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革兰氏阳性菌枯草芽孢杆菌中赖氨酸核糖开关调控机制的研究

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革兰氏阳性菌枯草芽孢杆菌中赖氨酸核糖开关调控机制的研究
论文目录
 
摘要第1-6页
ABSTRACT第6页
第一章 前言第9-22页
    §1.1 RNA简介第9-10页
    §1.2 RNA结构和折叠第10-11页
    §1.3 RNA二级结构预测方法第11-14页
    §1.4 自由能最近邻模型第14-15页
    §1.5 共转录对RNA结构形成的重要性第15-19页
        §1.5.1 转录方向、转录速度及其变体第16-17页
        §1.5.2 RNA中间态的相互作用第17页
        §1.5.3 RNA转录物与其它分子的相互作用第17-19页
    §1.6 预测折叠动力学的主方程方法第19-21页
    §1.7 本章小结第21-22页
第二章 核糖开关第22-32页
    §2.1 核糖开关的简介第22-23页
    §2.2 核糖开关的普遍机制第23-24页
    §2.3 各类核糖开关概述第24-30页
        §2.3.1 辅酶-B_(12)核糖开关第24-25页
        §2.3.2 硫胺素焦磷酸核糖开关第25-26页
        §2.3.3 S-腺苷甲硫氨酸(SAM)核糖开关第26页
        §2.3.4 黄素单核苷酸核糖开关第26-27页
        §2.3.5 嘌呤核糖开关第27页
        §2.3.6 glmS核糖开关第27-28页
        §2.3.7 甘氨酸(Gly)核糖开关第28-29页
        §2.3.8 PreQ1核糖开关第29页
        §2.3.9 串联核糖开关第29-30页
    §2.4 核糖开关的前景和挑战第30-32页
第三章 赖氨酸核糖开关第32-44页
    §3.1 赖氨酸核糖开关简介第32-33页
    §3.2 模型和方法第33-38页
        §3.2.1 动力学模型——螺旋第33-35页
        §3.2.2 共转录折叠动力学第35页
        §3.2.3 转换节点近似第35-37页
        §3.2.4 配体结合动力学第37-38页
    §3.3 结果和讨论第38-42页
        §3.3.1 配体不存在/存在时lysC核糖开关的共转录折叠动力学行为第38-41页
        §3.3.2 Lys浓度和转录速度对lysC核糖开关终止效率的影响第41-42页
    §3.4 结论第42-44页
第四章 全文总结第44-45页
参考文献第45-56页
攻读硕士期间发表的论文第56-57页
致谢第57页

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