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牦牛基因组有害突变积累研究
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牦牛基因组有害突变积累研究
论文目录
 
中文摘要第1-6页
Abstract第6-10页
第一章 研究背景第10-22页
　　1.1 有害突变研究进展第10-20页
　　　　1.1.1 有害突变的定义第10页
　　　　1.1.2 有害突变的产生与作用机制第10-12页
　　　　1.1.3 有害突变的检测方法第12-17页
　　　　1.1.4 动植物驯化与有害突变积累第17-18页
　　　　1.1.5 有害突变对家畜表型的影响第18-20页
　　1.2 牦牛驯化的研究进展第20-21页
　　1.3 科学问题和研究意义第21-22页
第二章 材料与方法第22-29页
　　2.1 样本采集、DNA提取与基因组测序第22页
　　2.2 基因组遗传变异分析第22-24页
　　　　2.2.1 数据过滤与质量评估第22页
　　　　2.2.2 基因组序列比对第22-23页
　　　　2.2.3 SNP的鉴定第23页
　　　　2.2.4 SNP注释第23-24页
　　　　2.2.5 位点频谱评估第24页
　　2.3 有害突变鉴定第24-26页
　　　　2.3.1 基于PROVEAN软件的鉴定第24-25页
　　　　2.3.2 基于PolyPhen2软件的鉴定第25页
　　　　2.3.3 基于SIFT4G软件的鉴定第25-26页
　　　　2.3.4 有害突变数据集的确定与评估第26页
　　2.4 驯化和野生牦牛有害突变的比较分析第26-27页
　　　　2.4.1 私有突变第26-27页
　　　　2.4.2 在驯化和野生牦牛中有害突变数量比较第27页
　　2.5 驯化牦牛的选择扫荡区和非扫荡区突变的比较分析第27-28页
　　　　2.5.1 在驯化牦牛选择扫荡区与非选择扫荡区遗传多态性的比较第27-28页
　　　　2.5.2 在驯化牦牛选择扫荡区与非选择扫荡区编码序列位点与间区位点比较第28页
　　2.6 有害突变基因的功能注释第28-29页
第三章 研究结果第29-48页
　　3.1 SNP分类与统计第29-37页
　　3.2 有害位点的识别与评估第37-41页
　　3.3 野生和家养牦牛群体间有害突变积累程度不同第41-45页
　　3.4 家养牦牛私有有害突变基因功能第45-48页
第四章 讨论第48-53页
　　4.1 有害突变数据集的确定第48-49页
　　4.2 驯化牦牛中有害突变的积累第49-50页
　　4.3 私有有害突变基因功能与疾病第50-51页
　　4.4 总结第51页
　　4.5 展望第51-53页
参考文献第53-61页
在学期间的研究成果第61-62页
致谢第62-63页

本篇论文共63页，点击这进入下载页面。
 
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