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中国地方山羊品种群体遗传结构和选择信号分析

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中国地方山羊品种群体遗传结构和选择信号分析
论文目录
 
中文摘要第1-4页
Abstract第4-9页
第一章 引言第9-17页
  1.1 我国山羊品种资源概况第9-10页
    1.1.1 山羊的驯化第9-10页
    1.1.2 我国山羊遗传资源第10页
  1.2 山羊遗传多样性及群体结构研究进展第10-13页
    1.2.1 微卫星DNA标记第11-12页
    1.2.2 DNA芯片技术第12页
    1.2.3 全基因组重测序第12-13页
  1.3 山羊遗传资源保护进展第13-15页
    1.3.1 畜禽遗传资源保护的法律法规第13页
    1.3.2 资源保护体系第13-14页
    1.3.3 遗传资源保护技术方式第14-15页
  1.4 山羊经济性状研究进展第15-16页
  1.5 研究目的及意义第16-17页
第二章 中国地方山羊群体遗传结构分析第17-29页
  2.1 前言第17页
  2.2 材料与方法第17-20页
    2.2.1 试验材料第17-18页
    2.2.2 试验方法第18-19页
    2.2.3 基因分型与质量控制第19-20页
  2.3 数据处理与分析第20-21页
    2.3.1 遗传多样性分析第20页
    2.3.2 PCA分析第20页
    2.3.3 NETVIEW分析第20页
    2.3.4 NJ树和STRUCTURE分析第20-21页
  2.4 结果第21-25页
    2.4.1 SNP质量控制结果第21页
    2.4.2 遗传多样性分析第21页
    2.4.3 群体遗传结构分析第21-25页
  2.5 讨论第25-28页
    2.5.1 山羊SNP芯片的质控第25-26页
    2.5.2 群体遗传结构和遗传多样性分析第26-27页
    2.5.3 保护对策第27-28页
  2.6 小结第28-29页
第三章 山羊的全基因组选择信号检测第29-38页
  3.1 前言第29页
  3.2 材料和方法第29-30页
    3.2.1 试验材料第29-30页
    3.2.2 试验方法第30页
    3.2.3 基因分型与质量控制第30页
  3.3 选择信号检测与分析第30页
  3.4 基因注释第30页
  3.5 结果第30-34页
    3.5.1 样品和SNP质控结果第30-31页
    3.5.2 野生和家养山羊之间选择信号检测结果第31-32页
    3.5.3 高海拔与低海拔之间选择信号检测第32-34页
    3.5.4 中国14个地方品种的选择信号分析第34页
  3.6 讨论第34-37页
    3.6.1 选择信号检测第34-36页
    3.6.2 保护对策第36-37页
  3.7 小结第37-38页
第四章 结论与研究展望第38-39页
  4.1 结论第38页
  4.2 研究展望第38-39页
参考文献第39-44页
在学期间的研究成果第44-45页
致谢第45页

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