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现生无尾目两栖动物的分子系统发育与生物地理学研究
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现生无尾目两栖动物的分子系统发育与生物地理学研究
论文目录
 
摘要第3-6页
ABSTRACT第6-11页
第一章 绪论第11-54页
　　1.1 无尾目两栖动物的生物多样性第11-45页
　　　　1.1.1 无尾目两栖动物概述第11-15页
　　　　1.1.2 无尾目两栖动物各科简介第15-40页
　　　　1.1.3 无尾目两栖动物的研究现状第40-45页
　　1.2 系统发育学概述第45-52页
　　　　1.2.1 系统发育树概述第45-47页
　　　　1.2.2 分歧时间估算概述第47-49页
　　　　1.2.3 生物地理学概述第49-50页
　　　　1.2.4 分子系统发育学的研究现状与挑战第50-52页
　　1.3 本研究的目的与意义第52-54页
第二章 大规模PCR产物高通量测序方法的开发第54-90页
　　2.1 引言第54-65页
　　　　2.1.1 测序技术简介第54-62页
　　　　2.1.2 高通量测序技术在分子系统发育学上的研究进展第62-65页
　　2.2 材料与方法第65-82页
　　　　2.2.1 样本与分子标记的选取第65-66页
　　　　2.2.2 试剂、仪器及来源第66页
　　　　2.2.3 DNA提取与检测第66-68页
　　　　2.2.4 PCR扩增与电泳检测第68-71页
　　　　2.2.5 高通量PCR产物文库构建第71-78页
　　　　2.2.6 数据分析第78-81页
　　　　2.2.7 系统发育分析第81-82页
　　2.3 结果第82-87页
　　　　2.3.1 目标片段的回收率第83-85页
　　　　2.3.2 最小测序深度第85页
　　　　2.3.3 拼接序列与数据库序列的相似度第85-86页
　　　　2.3.4 拼接序列在系统发育树上的表现第86-87页
　　2.4 讨论第87-90页
　　　　2.4.1 突破了测序平台的选择限制第87页
　　　　2.4.2 不同长度的PCR产物可直接高通量测序第87-88页
　　　　2.4.3 增加测序深度可以忽略PCR产物间的不均一性第88页
　　　　2.4.4 潜在的不足第88-90页
第三章 无尾目两栖动物的系统发育关系、分歧时间及生物地理分析第90-133页
　　3.1 引言第90-92页
　　3.2 材料与方法第92-109页
　　　　3.2.1 样本选取第92-95页
　　　　3.2.2 实验方法第95-97页
　　　　3.2.3 系统发育分析第97-102页
　　　　3.2.4 分歧时间估计第102-105页
　　　　3.2.5 多样性分化速率随时间变化的分析第105页
　　　　3.2.6 生物地理分析第105-109页
　　3.3 结果与讨论第109-133页
　　　　3.3.1 数据集概述第109页
　　　　3.3.2 稳健、可靠的系统发育树第109-118页
　　　　3.3.3 三大类群同时发生辐射进化第118-127页
　　　　3.3.4 新蛙类的发源地是非洲板块第127-132页
　　　　3.3.5 现生树栖无尾目两栖动物均起源于K-Pg之后第132-133页
第四章 总结与展望第133-137页
　　4.1 研究总结第133-135页
　　4.2 研究展望第135-137页
参考文献第137-151页
附录第151-179页
攻读学位期间研究成果第179-180页
致谢第180-181页

本篇论文共181页，点击这进入下载页面。
 
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