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基于CALYPSO方法的XRD逆向结构搜索和蛋白质结构预测

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基于CALYPSO方法的XRD逆向结构搜索和蛋白质结构预测
论文目录
 
论文提要第1-6页
中文摘要第6-9页
abstract第9-17页
第一章 绪论第17-27页
  1.1 群智理论第17-22页
    1.1.1 群智理论概述第17-18页
    1.1.2 粒子群优化算法概述第18-22页
  1.2 CALYPSO结构预测方法第22-24页
  1.3 本论文的选题与目的第24-27页
第二章 晶体结构与X射线衍射第27-41页
  2.1 晶体的基本结构第27-29页
    2.1.1 晶体的基本特征第27-28页
    2.1.2 晶面与面指数第28页
    2.1.3 倒格子第28-29页
  2.2 晶体对X射线衍射第29-32页
    2.2.1 Bragg衍射公式第29-31页
    2.2.2 原子散射因子和几何结构因子第31-32页
  2.3 X射线粉末衍射技术第32-34页
  2.4 X射线粉末衍射晶体结构测定第34-41页
第三章 基于XRD的逆向结构搜索第41-53页
  3.1 本章简介第41-42页
  3.2 程序流程第42-48页
    3.2.1 实验数据预处理第43-45页
    3.2.2 CALYPSO方法产生结构第45页
    3.2.3 模拟结构XRD图谱第45-47页
    3.2.4 评估XRD图谱差异第47-48页
  3.3 测试和应用第48-51页
    3.3.1 测试第48-49页
    3.3.2 应用第49-51页
  3.4 本章小结第51-53页
第四章 蛋白质空间结构及理论结构预测第53-69页
  4.1 蛋白质基本结构第53-57页
    4.1.1 氨基酸第53-55页
    4.1.2 蛋白质的肽链第55-57页
  4.2 蛋白质结构层次的形成第57-61页
  4.3 蛋白质结构中的相互作用第61-63页
  4.4 蛋白质结构预测概述第63-67页
    4.4.1 同源模型法第64-65页
    4.4.2 折叠识别法第65-66页
    4.4.3 从头算法第66-67页
  4.5 评估预测蛋白质的准确性第67-69页
第五章 CALYPSO从头算蛋白质结构预测方法第69-79页
  5.1 本章简介第69-70页
  5.2 程序流程第70-73页
    5.2.1 蛋白质二级结构预测第71页
    5.2.2 构建蛋白质全原子模型第71-72页
    5.2.3 能量最小化和能量表征第72页
    5.2.4 结构演化第72-73页
  5.3 结果与讨论第73-78页
  5.4 本章小结第78-79页
第六章 数据库辅助的蛋白质结构预测方法第79-91页
  6.1 本章简介第79-80页
  6.2 程序流程第80-86页
    6.2.1 预处理第80-83页
    6.2.2 构建蛋白质初始结构第83-84页
    6.2.3 能量最小化和能量表征第84页
    6.2.4 结构演化第84-86页
  6.3 结果与讨论第86-90页
  6.4 本章小结第90-91页
第七章 总结与展望第91-93页
参考文献第93-109页
作者简介及科研成果第109-110页
攻读研究生期间公开发表的学术论文第110-111页
致谢第111-112页

本篇论文共112页,点击这进入下载页面
 
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