论文目录 | |
| 摘要 | 第1-7页 |
| abstract | 第7-12页 |
| 英文略缩语 | 第12-17页 |
| 第一部分 ：高通量测序技术初步筛查胰腺癌候选环状RNA | 第17-54页 |
| 1 前言 | 第17-18页 |
| 2 实验材料与方法 | 第18-21页 |
| 2.1 实验材料 | 第18-19页 |
| 2.1.1 收集组织标本 | 第18-19页 |
| 2.1.2 组织标本的准备 | 第19页 |
| 2.2 实验方法 | 第19-21页 |
| 2.2.1 建库测序流程 | 第19页 |
| 2.2.2 生物信息分析流程 | 第19-21页 |
| 3 结果 | 第21-49页 |
| 3.1 原始测序数据 | 第21-22页 |
| 3.2 测序错误率分布检查 | 第22-26页 |
| 3.3 测序数据质量情况汇总 | 第26-27页 |
| 3.4 circRNA的鉴定 | 第27-29页 |
| 3.5 circRNA的长度分布 | 第29页 |
| 3.6 circRNA的来源统计 | 第29-30页 |
| 3.7 circRNA的表达及差异表达 | 第30-39页 |
| 3.7.1 circRNA的表达水平分析 | 第30-31页 |
| 3.7.2 circRNA表达量TPM密度分布图 | 第31-32页 |
| 3.7.3 circRNA差异表达分析结果 | 第32-33页 |
| 3.7.4 差异circRNA筛选 | 第33-36页 |
| 3.7.5 差异circRNA聚类分析 | 第36页 |
| 3.7.6 样本间公共及特有的circRNA维恩图 | 第36-39页 |
| 3.8 差异circRNA来源基因富集分析 | 第39-46页 |
| 3.8.1 来源基因GO富集分析 | 第39-42页 |
| 3.8.2 来源基因KEGG富集分析 | 第42-46页 |
| 3.9 miRNA结合位点分析 | 第46页 |
| 3.10 以hsa_circ_0006215为中心,通过高通量测序联合生物信息学分析circRNA-miRNA-mRNA互作网络 | 第46-49页 |
| 4 讨论 | 第49-52页 |
| 5 结论 | 第52-54页 |
| 第二部分 ：胰腺癌组织及血液中验证候选环状RNA | 第54-72页 |
| 1 前言 | 第54-55页 |
| 2 实验材料与方法 | 第55-64页 |
| 2.1 主要试剂和仪器及耗材 | 第55页 |
| 2.1.1 主要试剂 | 第55页 |
| 2.1.2 主要仪器及耗材 | 第55页 |
| 2.2 步骤与方法 | 第55-64页 |
| 2.2.1 组织和血液样本收集 | 第55-56页 |
| 2.2.2 组织标本的RNA提取 | 第56页 |
| 2.2.3 血液标本的RNA提取 | 第56-57页 |
| 2.2.4 测RNA浓度和纯度 | 第57页 |
| 2.2.5 完整性检测 | 第57页 |
| 2.2.6 Sanger测序 | 第57-58页 |
| 2.2.7 RT-qPCR | 第58-60页 |
| 2.2.8 miRNA反转录 | 第60-62页 |
| 2.2.9 westernblot检测组织蛋白的表达 | 第62-63页 |
| 2.2.10 统计学处理 | 第63-64页 |
| 3 结果 | 第64-68页 |
| 3.1 提取RNA的质量验证 | 第64页 |
| 3.2 Sanger测序结果 | 第64-65页 |
| 3.3 RT-qPCR结果 | 第65-66页 |
| 3.4 Western blot 检测结果 | 第66-68页 |
| 4 讨论 | 第68-71页 |
| 5 结论 | 第71-72页 |
| 第三部分 ：通过体外细胞实验对hsa_circ_0006215,微小RNA及其靶基因的研究 | 第72-89页 |
| 1 前言 | 第72-73页 |
| 2 实验材料与方法 | 第73-80页 |
| 2.1 主要试剂和仪器及耗材 | 第73-74页 |
| 2.1.1 主要试剂 | 第73页 |
| 2.1.2 主要仪器及耗材 | 第73-74页 |
| 2.2 步骤与方法 | 第74-80页 |
| 2.2.1 研究对象和分组 | 第74页 |
| 2.2.2 细胞培养 | 第74页 |
| 2.2.3 细胞传代 | 第74页 |
| 2.2.4 细胞计数 | 第74页 |
| 2.2.5 慢病毒的包装 | 第74-75页 |
| 2.2.6 RT-qPCR | 第75-76页 |
| 2.2.7 miRNA反转录 | 第76-77页 |
| 2.2.8 CCK-8法检测细胞增殖 | 第77-78页 |
| 2.2.9 流式细胞(FCM)法检测细胞凋亡 | 第78页 |
| 2.2.10 Transwell法检测细胞迁移能力 | 第78页 |
| 2.2.11 westernblot检测细胞蛋白的表达 | 第78-79页 |
| 2.2.12 统计学分析 | 第79-80页 |
| 3 结果 | 第80-85页 |
| 3.1 PANC-1细胞株的转染效率 | 第80页 |
| 3.2 RT-qPCR结果 | 第80-81页 |
| 3.3 CCK-8检测细胞增殖能力结果 | 第81-82页 |
| 3.4 流式细胞技术(FCM)结果 | 第82页 |
| 3.5 Transwell实验结果 | 第82-83页 |
| 3.6 Westernblot检测结果 | 第83-85页 |
| 4 讨论 | 第85-88页 |
| 5 结论 | 第88-89页 |
| 本研究创新性的自我评价 | 第89-90页 |
| 参考文献 | 第90-98页 |
| 综述 | 第98-116页 |
| 参考文献 | 第109-116页 |
| 在学期间科研成绩 | 第116-117页 |
| 致谢 | 第117-118页 |
| 个人简历 | 第118页 |
