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柔嫩艾美耳球虫入侵DF1细胞的转录组学及蛋白质组学分析

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柔嫩艾美耳球虫入侵DF1细胞的转录组学及蛋白质组学分析
论文目录
 
中文摘要第11-14页
ABSTRACT第14-18页
1 前言第18-37页
  1.1 鸡球虫病及防治现状第18-24页
    1.1.1 鸡球虫病病原第18页
    1.1.2 鸡球虫生活史第18-20页
    1.1.3 鸡球虫对宿主细胞的入侵第20-22页
    1.1.4 鸡球虫病防治现状第22-24页
  1.2 鸡球虫细胞培养的研究现状及进展第24-29页
    1.2.1 细胞培养在抗球虫制剂效果评价的应用第26-27页
    1.2.2 细胞培养在球虫蛋白功能研究的应用第27-28页
    1.2.3 细胞培养在球虫转基因技术的应用第28页
    1.2.4 细胞培养在球虫入侵机理研究的应用第28-29页
  1.3 转录组学及其在鸡球虫研究中的进展第29-32页
    1.3.1 转录组学概述及RNA-seq技术第29-30页
    1.3.2 转录组学在鸡球虫研究中的进展第30-32页
  1.4 蛋白质组学及其在鸡球虫研究中的进展第32-35页
    1.4.1 蛋白质组学概述及iTRAQ技术第32-34页
    1.4.2 蛋白质组学在鸡球虫研究中的进展第34-35页
  1.5 研究的目及意义第35-37页
2 材料与方法第37-59页
  2.1 实验材料第37-39页
    2.1.1 细胞、虫株及菌株和载体第37-38页
    2.1.2 实验动物第38页
    2.1.3 主要试剂与药品第38页
    2.1.4 主要仪器设备第38-39页
  2.2 实验方法第39-59页
    2.2.1 实验设计第39-40页
    2.2.2 鸡球虫的复壮与传代第40页
    2.2.3 球虫卵囊的收集与孢子化第40-41页
    2.2.4 卵囊的灭菌及子孢子出囊实验第41-42页
    2.2.5 DF1细胞的复苏与培养第42页
    2.2.6 柔嫩艾美耳球虫入侵DF1细胞模型的建立第42-43页
    2.2.7 入侵模型中DF1细胞的转录组学分析第43-45页
    2.2.8 荧光定量PCR鉴定转录组差异基因第45-47页
    2.2.9 鸡MAPK信号通路基因在入侵模型中的转录第47页
    2.2.10 入侵模型中DF1细胞及子孢子关键蛋白的蛋白质组学分析第47-51页
    2.2.11 鸡内吞及吞噬体信号通路基因在入侵模型中的转录第51-52页
    2.2.12 柔嫩艾美耳球虫蛋白U6KIV9和H9B954的功能研究第52-59页
3 结果第59-94页
  3.1 柔嫩艾美耳球虫入侵DF1细胞模型的建立第59-61页
    3.1.1 孢子化卵囊和子孢子的收集和纯化第59页
    3.1.2 柔嫩艾美耳球虫在DF1细胞中的培养第59-60页
    3.1.3 接种时间的确定第60-61页
    3.1.4 接种剂量的确定第61页
  3.2 入侵模型中宿主细胞DF1的转录组学研究第61-71页
    3.2.1 总RNA的质量鉴定第61-62页
    3.2.2 测序数据过滤及质量评估第62页
    3.2.3 鉴定基因统计结果第62-64页
    3.2.4 差异显著基因生物信息学分析第64-67页
    3.2.5 荧光定量验证转录差异基因结果第67-69页
    3.2.6 FosB、NR4A3和NR4A1的动态表达第69-70页
    3.2.7 MAPK信号通路基因在入侵模型DF1细胞中的转录第70-71页
  3.3 入侵模型中宿主细胞DF1的蛋白质组学研究第71-78页
    3.3.1 鉴定蛋白统计结果第71页
    3.3.2 差异显著蛋白生物信息学分析第71-75页
    3.3.3 差异蛋白在内吞及吞噬体通路中的富集及转录第75-78页
  3.4 入侵模型中柔嫩艾美耳球虫子孢子的蛋白质组学研究第78-81页
    3.4.1 鉴定蛋白统计结果第78页
    3.4.2 差异显著蛋白生物信息学分析第78-81页
  3.5 柔嫩艾美耳球虫蛋白U6KIV9和H9B954的功能研究第81-94页
    3.5.1 蛋白基本信息及生物信息学分析第81-84页
    3.5.2 目的基因的PCR扩增第84-85页
    3.5.3 原核重组表达质粒的构建第85-86页
    3.5.4 重组蛋白的原核表达及纯化第86-87页
    3.5.5 重组蛋白原核表达与鉴定第87-88页
    3.5.6 多克隆抗体的制备第88页
    3.5.7 酵母菌表面展示黏附试验模型第88-91页
    3.5.8 抗体阻断实验第91-92页
    3.5.9 蛋白免疫保护效果评价第92-94页
4 讨论第94-99页
  4.1 柔嫩艾美耳球虫入侵DF1细胞模型的建立第94-95页
  4.2 入侵模型中宿主细胞DF1及球虫子孢子的组学研究第95-97页
  4.3 柔嫩艾美耳球虫蛋白U6KIV9和H9B954的功能研究第97-99页
5 结论第99-100页
参考文献第100-111页
附录第111-114页
致谢第114-115页
攻读学位期间论文发表情况第115页

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