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食源性致病菌肠杆菌科细菌数值鉴定系统和耐药性研究

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食源性致病菌肠杆菌科细菌数值鉴定系统和耐药性研究
论文目录
 
摘要第1-7页
ABSTRACT第7-14页
第一章 绪论第14-39页
  1.1 肠杆菌科细菌的生物学特性第14-15页
  1.2 肠杆菌科的检测方法进展第15-16页
  1.3 数值鉴定系统第16-29页
    1.3.1 细菌数值鉴定法的建立第16-17页
    1.3.2 细菌数值鉴定法中的可信度第17-23页
    1.3.3 细菌数值鉴定中生化试验的选择与编码第23-28页
    1.3.4 细菌数值鉴定系统的应用及存在问题第28-29页
  1.4 肠杆菌科细菌的耐药性第29-35页
    1.4.1 肠杆菌科细菌的耐药性第29-31页
    1.4.2 超广谱 β-内酰胺酶(ESBL)第31-34页
    1.4.3 质粒介导AmpC酶第34-35页
    1.4.4 整合子与质粒介导的耐药性传播第35页
  1.5 本课题的主要内容与意义第35-39页
第二章 食源性致病菌肠杆菌科细菌数值鉴定系统理论分析及软件设计第39-58页
  2.1 实验材料第39-40页
  2.2 实验方法第40页
  2.3 结果第40-55页
    2.3.1 数值鉴定系统的理论建模第40-48页
    2.3.2 数值鉴定系统软件的编制第48-55页
    2.3.3 数值鉴定系统生化反应鉴定条第55页
  2.4 讨论第55-57页
  2.5 本章小结第57-58页
第三章 食源性致病菌肠杆菌科细菌数值鉴定系统的应用第58-79页
  3.1 实验材料第58-59页
    3.1.1 菌株来源第58页
    3.1.2 实验仪器第58页
    3.1.3 主要试剂第58-59页
  3.2 实验方法第59-61页
    3.2.1 广州食品与珠江水样肠杆菌科细菌的分离第59-60页
    3.2.2 标准菌株与实际样品分离株的验证第60页
    3.2.3 肠杆菌科细菌PCR鉴定第60-61页
    3.2.4 肠杆菌科细菌 16S rRNA基因测序第61页
  3.3 结果第61-76页
    3.3.1 标准菌株的验证第61-62页
    3.3.2 实际样本分离株的验证第62-69页
    3.3.3 广州食品与珠江水样肠杆菌科细菌的分离鉴定第69-76页
  3.4 讨论第76-78页
  3.5 本章小结第78-79页
第四章 食源性小肠结肠炎耶尔森菌的耐药性及遗传多样性研究第79-98页
  4.1 实验材料第79-80页
    4.1.1 菌株来源第79页
    4.1.2 实验仪器第79-80页
    4.1.3 主要试剂第80页
  4.2 实验方法第80-83页
    4.2.1 生物型与血清型的检测第80-81页
    4.2.2 毒力基因的检测第81-82页
    4.2.3 耐药表型的检测第82页
    4.2.4 耐药基因的PCR检测第82-83页
    4.2.5 ERIC分型第83页
    4.2.6 遗传多样性分析第83页
  4.3 结果第83-94页
    4.3.1 生物型与血清型的检测第83-88页
    4.3.2 毒力基因的检测第88-89页
    4.3.3 耐药性分析第89-91页
    4.3.4 耐药基因的检测第91页
    4.3.5 ERIC分型第91-94页
  4.4 讨论第94-97页
  4.5 本章小结第97-98页
第五章 广州食品与珠江水中肠杆菌科细菌的耐药性研究第98-121页
  5.1 实验材料第98-99页
    5.1.1 菌株来源第98页
    5.1.2 实验仪器第98-99页
    5.1.3 主要试剂第99页
  5.2 实验方法第99-102页
    5.2.1 抗生素敏感性实验第99页
    5.2.2 超广谱 β-内酰胺酶(ESBL)表型初筛与确证第99-100页
    5.2.3 AmpC表型初筛与确证第100页
    5.2.4 β-内酰胺酶基因的检测第100-102页
    5.2.5 整合子的检测第102页
    5.2.6 质粒接合实验与接合子检测第102页
  5.3 结果第102-117页
    5.3.1 耐药性分析第102-107页
    5.3.2 ESBL与AmpC的分离率及其分布第107-109页
    5.3.3 ESBL与AmpC阳性菌株耐药性分析第109-111页
    5.3.4 β-内酰胺酶基因的检测与序列分析第111-116页
    5.3.5 整合子基因的检测第116页
    5.3.6 质粒接合实验与接合子的检测第116-117页
  5.4 讨论第117-120页
  5.5 本章小结第120-121页
第六章 产ESBL酶的肠杆菌科细菌全国食品分离株的耐药性研究第121-136页
  6.1 实验材料第121-122页
    6.1.1 菌株来源第121页
    6.1.2 实验仪器第121-122页
    6.1.3 主要试剂第122页
  6.2 实验方法第122-123页
    6.2.1 ESBL表型的初筛第122页
    6.2.2 ESBL分离株耐药表型的检测第122页
    6.2.3 β-内酰胺酶基因的检测第122-123页
    6.2.4 整合子基因的检测第123页
    6.2.5 质粒接合实验与接合子检测第123页
  6.3 结果第123-133页
    6.3.1 ESBL阳性的分离率及其分布第123-125页
    6.3.2 ESBL肠杆菌科的耐药性分析第125-127页
    6.3.3 β-内酰胺酶基因的检测第127-131页
    6.3.4 整合子基因的检测第131页
    6.3.5 ESBL阳性菌的质粒接合实验与接合子检测第131-133页
  6.4 讨论第133-135页
  6.5 本章小结第135-136页
结论与展望第136-139页
参考文献第139-160页
附录第160-178页
攻读博士学位期间取得的研究成果第178-180页
致谢第180-181页
附表第181页

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