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紫花苜蓿抗寒转录组测序分析及MsNCX和MsCML基因的功能研究

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紫花苜蓿抗寒转录组测序分析及MsNCX和MsCML基因的功能研究
论文目录
 
摘要第11-15页
ABSTRACT第15-19页
第1章 绪论第19-29页
  1.1 低温胁迫对植物的危害第19-20页
  1.2 植物响应低温胁迫机制研究进展第20-25页
    1.2.1 抗氧化酶在低温胁迫中的作用第20页
    1.2.2 渗透保护剂在低温胁迫中的作用第20-21页
    1.2.3 钙信号转导途径第21-23页
    1.2.4 依赖CBF信号转导途径第23-24页
    1.2.5 不依赖CBF信号转导途径第24-25页
  1.3 紫花苜蓿抗寒性研究进展第25-27页
    1.3.1 紫花苜蓿的研究进展第25页
    1.3.2 紫花苜蓿响应低温胁迫的生理生化反应第25-26页
    1.3.3 通过基因工程技术提高紫花苜蓿抗寒性第26-27页
  1.4 本研究的目的和意义第27-28页
  1.5 技术路线第28-29页
第2章 紫花苜蓿抗寒转录组测序分析第29-67页
  2.1 引言第29页
  2.2 实验材料第29-30页
    2.2.1 植物材料第29-30页
    2.2.2 实验药品第30页
  2.3 实验方法第30-35页
    2.3.1 紫花苜蓿根颈芽的收集第30页
    2.3.2 紫花苜蓿根颈芽总RNA的提取和质量检测第30页
    2.3.3 cDNA文库的构建第30-31页
    2.3.4 转录组测序及数据组装第31页
    2.3.5 转录本功能注释第31页
    2.3.6 差异表达基因分析第31-32页
    2.3.7 荧光定量qRT-PCR(Quantitative real-time PCR)第32-35页
  2.4 实验结果与分析第35-65页
    2.4.1 测序总RNA质量检测第35页
    2.4.2 转录组测序组装结果和质量评估第35-37页
    2.4.3 Unigene功能注释分析第37-44页
    2.4.4 Unigene表达水平分析第44-45页
    2.4.5 差异表达基因的GO注释分析第45-55页
    2.4.6 差异表达基因KEGG代谢途径的富集第55-56页
    2.4.7 钙信号转导途径相关基因第56-59页
    2.4.8 转录因子响应紫花苜蓿冷冻胁迫第59-61页
    2.4.9 基因表达模式分析第61-65页
  2.5 本章小结第65-67页
第3章 MSNCX基因对烟草的转化及功能分析第67-105页
  3.1 引言第67-68页
  3.2 实验材料第68-69页
    3.2.1 菌种、质粒及植物材料第68页
    3.2.2 实验药品第68页
    3.2.3 主要仪器设备第68-69页
  3.3 实验方法第69-76页
    3.3.1 紫花苜蓿MsNCX的克隆第69-71页
    3.3.2 MsNCX生物信息学分析第71页
    3.3.3 MsNCX的表达特异性分析第71页
    3.3.4 MsNCX表达载体构建及遗传转化第71-72页
    3.3.5 转基因烟草的分子生物学检测第72-73页
    3.3.6 转基因烟草的抗寒性分析第73-74页
    3.3.7 转基因烟草的耐盐性分析第74-75页
    3.3.8 转基因烟草的抗旱性分析第75页
    3.3.9 胁迫响应基因表达分析第75-76页
    3.3.10 数据处理第76页
  3.4 实验结果与分析第76-104页
    3.4.1 紫花苜蓿MsNCX的克隆及生物信息学分析第76-82页
    3.4.2 紫花苜蓿MsNCX基因表达模式分析第82-84页
    3.4.3 转MsNCX基因烟草的获得及分子生物学检测第84-87页
    3.4.4 转MsNCX基因烟草的抗寒性分析第87-93页
    3.4.5 转MsNCX基因烟草的耐盐性分析第93-99页
    3.4.6 转MsNCX基因烟草的抗旱性分析第99-102页
    3.4.7 过表达MsNCX基因烟草中抗逆相关基因的表达分析第102-104页
  3.5 本章小结第104-105页
第4章 MSCML基因对烟草的转化及功能分析第105-133页
  4.1 引言第105页
  4.2 实验材料第105页
  4.3 实验方法第105-107页
    4.3.1 紫花苜蓿MsCML的克隆第105-106页
    4.3.2 MsCML生物信息学分析第106页
    4.3.3 MsCML的表达特异性分析第106页
    4.3.4 MsCML表达载体构建及遗传转化第106页
    4.3.5 转基因烟草的分子生物学检测第106-107页
    4.3.6 转基因烟草的抗寒性分析第107页
    4.3.7 转基因烟草的耐盐性分析第107页
    4.3.8 转基因烟草的抗旱性分析第107页
    4.3.9 胁迫响应基因表达分析第107页
    4.3.10 数据处理第107页
  4.4 实验结果与分析第107-132页
    4.4.1 紫花苜蓿MsCML的克隆及生物信息学分析第107-111页
    4.4.2 紫花苜蓿MsCML基因表达模式分析第111-113页
    4.4.3 转MsCML基因烟草的获得及分子生物学检测第113-117页
    4.4.4 转MsCML基因烟草的抗寒性分析第117-121页
    4.4.5 转MsCML基因烟草的耐盐性分析第121-127页
    4.4.6 转MsCML基因烟草的抗旱性分析第127-130页
    4.4.7 过表达MsCML基因烟草中胁迫响应基因的表达的分析第130-132页
  4.5 本章小结第132-133页
第5章 讨论第133-143页
  5.1 转录组分析紫花苜蓿抗寒机制第133-136页
    5.1.1 膜蛋白第133页
    5.1.2 抗氧化防御系统第133-134页
    5.1.3 激素信号转导途径第134-135页
    5.1.4 泛素介导的蛋白水解途径第135页
    5.1.5 次生代谢产物的生物合成途径第135-136页
  5.2 紫花苜蓿MSNCX基因功能研究第136-139页
    5.2.1 紫花苜蓿MsNCX基因响应非生物胁迫第137页
    5.2.2 过表达MsNCX基因增强烟草耐寒性第137-138页
    5.2.3 过表达MsNCX基因增强烟草的耐盐和耐旱性第138-139页
  5.3 紫花苜蓿MSCML基因功能研究第139-141页
  5.4 紫花苜蓿MSNCX和MSCML基因表达模式分析第141-142页
  5.5 对后续工作的设想第142页
  5.6 论文的主要创新点第142-143页
结论第143-145页
参考文献第145-163页
攻读博士学位期间发表的学术论文第163-164页
致谢第164页

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