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肉牛肌间脂肪差异miRNAs鉴定与生物信息分析

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肉牛肌间脂肪差异miRNAs鉴定与生物信息分析
论文目录
 
摘要第1-7页
Abstract第7-13页
英文缩略词表第13-14页
第一章 文献综述:miRNA与肉牛脂肪调控第14-28页
1 肉牛业发展动态第14-19页
  1.1 牛肉消费趋势第14-15页
  1.2 肉牛生产动态第15-18页
  1.3 肉牛育种动态第18-19页
2 miRNA与动物脂肪沉积第19-28页
  2.1 miRNA的发现第19-20页
  2.2 miRNA的生成过程第20-22页
  2.3 miRNA的作用机制第22-24页
  2.4 miRNA的识别第24-25页
  2.5 miRNA与脂肪沉积第25-28页
第二章 安格斯牛、西门塔尔牛和日本和牛脂肪组织miRNA文库构建和Solexa测序第28-52页
引言第28页
1 材料与方法第28-31页
  1.1 试验动物第28页
  1.2 主要仪器和试剂第28-29页
    1.2.1 主要仪器设备第28-29页
    1.2.2 主要试验药品与试剂第29页
  1.3 总RNA提取第29页
  1.4 总RNA质量检测第29-30页
  1.5 RNA混合池建立第30页
  1.6 miRNA 测序文库的构建和高通量测序第30页
  1.7 测序数据初步处理第30-31页
  1.8 测序数据的初步分析第31页
    1.8.1 小 RNA的特征分析第31页
    1.8.2 小RNA文库的分类注释第31页
2 结果与分析第31-48页
  2.1 总RNA质量检测第31-33页
  2.2 序列文库质量处理第33-34页
  2.3 小RNA文库片段长度分布第34-35页
  2.4 小RNA的特征分析第35-44页
  2.5 小RNA文库的分类注释第44-48页
3 讨论第48-49页
  3.1 试验样品的选择第48页
  3.2 高通量测序的质量第48-49页
4 小结第49-52页
第三章 牛品种差异脂肪沉积相关miRNA鉴定和特征第52-71页
引言第52页
1 材料与方法第52-55页
  1.1 试验材料第52页
  1.2 试验方法第52-55页
2 结果与分析第55-68页
  2.1 公共及特有序列分析第55-56页
  2.2 已知miRNA对比第56-58页
  2.3 新miRNA预测第58-59页
  2.4 已知miRNA的差异分析第59-62页
  2.5 聚类分析第62-64页
  2.6 GO分析第64-66页
  2.7 KEGG分析第66-67页
  2.8 定量PCR验证第67-68页
3 讨论第68-69页
4 小结第69-71页
第四章 日本和牛×皖南牛杂交一代公、母牛脂肪沉积的miRNA基因芯片分析第71-81页
引言第71页
  1. 材料与方法第71-75页
    1.1. 试验动物第71页
  1.2 主要仪器设备与试剂第71-72页
  1.3 总RNA提取第72页
  1.4 总RNA质量检测第72页
  1.5 miRNA芯片选择第72-73页
  1.6 样品RNA标记第73页
  1.7 杂交、洗涤与染色第73-74页
  1.8 芯片扫描第74页
  1.9 数据提取与分析第74-75页
  1.10 芯片结果的实施定量验证第75页
2 结果与分析第75-80页
  2.1 肌间脂肪总RNA的提取质量第75-77页
  2.2 芯片试验的质量控制第77页
  2.3 杂一代公、母牛脂肪沉积差异表达的miRNA第77-78页
  2.4 差异表达miRNA的定量验证第78-79页
  2.5 mi R-148b的靶基因预测第79-80页
3 讨论第80页
4 小结第80-81页
第五章 结论与展望第81-83页
1 主要结论第81页
2 创新点第81-82页
3 研究展望第82-83页
参考文献第83-90页
附件第90-110页
致谢第110-112页
个人简历第112-113页

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