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肉牛肌间脂肪差异miRNAs鉴定与生物信息分析
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肉牛肌间脂肪差异miRNAs鉴定与生物信息分析
论文目录
摘要
第1-7页
Abstract
第7-13页
英文缩略词表
第13-14页
第一章 文献综述:miRNA与肉牛脂肪调控
第14-28页
1 肉牛业发展动态
第14-19页
1.1 牛肉消费趋势
第14-15页
1.2 肉牛生产动态
第15-18页
1.3 肉牛育种动态
第18-19页
2 miRNA与动物脂肪沉积
第19-28页
2.1 miRNA的发现
第19-20页
2.2 miRNA的生成过程
第20-22页
2.3 miRNA的作用机制
第22-24页
2.4 miRNA的识别
第24-25页
2.5 miRNA与脂肪沉积
第25-28页
第二章 安格斯牛、西门塔尔牛和日本和牛脂肪组织miRNA文库构建和Solexa测序
第28-52页
引言
第28页
1 材料与方法
第28-31页
1.1 试验动物
第28页
1.2 主要仪器和试剂
第28-29页
1.2.1 主要仪器设备
第28-29页
1.2.2 主要试验药品与试剂
第29页
1.3 总RNA提取
第29页
1.4 总RNA质量检测
第29-30页
1.5 RNA混合池建立
第30页
1.6 miRNA 测序文库的构建和高通量测序
第30页
1.7 测序数据初步处理
第30-31页
1.8 测序数据的初步分析
第31页
1.8.1 小 RNA的特征分析
第31页
1.8.2 小RNA文库的分类注释
第31页
2 结果与分析
第31-48页
2.1 总RNA质量检测
第31-33页
2.2 序列文库质量处理
第33-34页
2.3 小RNA文库片段长度分布
第34-35页
2.4 小RNA的特征分析
第35-44页
2.5 小RNA文库的分类注释
第44-48页
3 讨论
第48-49页
3.1 试验样品的选择
第48页
3.2 高通量测序的质量
第48-49页
4 小结
第49-52页
第三章 牛品种差异脂肪沉积相关miRNA鉴定和特征
第52-71页
引言
第52页
1 材料与方法
第52-55页
1.1 试验材料
第52页
1.2 试验方法
第52-55页
2 结果与分析
第55-68页
2.1 公共及特有序列分析
第55-56页
2.2 已知miRNA对比
第56-58页
2.3 新miRNA预测
第58-59页
2.4 已知miRNA的差异分析
第59-62页
2.5 聚类分析
第62-64页
2.6 GO分析
第64-66页
2.7 KEGG分析
第66-67页
2.8 定量PCR验证
第67-68页
3 讨论
第68-69页
4 小结
第69-71页
第四章 日本和牛×皖南牛杂交一代公、母牛脂肪沉积的miRNA基因芯片分析
第71-81页
引言
第71页
1. 材料与方法
第71-75页
1.1. 试验动物
第71页
1.2 主要仪器设备与试剂
第71-72页
1.3 总RNA提取
第72页
1.4 总RNA质量检测
第72页
1.5 miRNA芯片选择
第72-73页
1.6 样品RNA标记
第73页
1.7 杂交、洗涤与染色
第73-74页
1.8 芯片扫描
第74页
1.9 数据提取与分析
第74-75页
1.10 芯片结果的实施定量验证
第75页
2 结果与分析
第75-80页
2.1 肌间脂肪总RNA的提取质量
第75-77页
2.2 芯片试验的质量控制
第77页
2.3 杂一代公、母牛脂肪沉积差异表达的miRNA
第77-78页
2.4 差异表达miRNA的定量验证
第78-79页
2.5 mi R-148b的靶基因预测
第79-80页
3 讨论
第80页
4 小结
第80-81页
第五章 结论与展望
第81-83页
1 主要结论
第81页
2 创新点
第81-82页
3 研究展望
第82-83页
参考文献
第83-90页
附件
第90-110页
致谢
第110-112页
个人简历
第112-113页
本篇论文共
113
页,
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