组学数据整合与功能模块化分析构建棉花全基因组注释体系

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组学数据整合与功能模块化分析构建棉花全基因组注释体系

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组学数据整合与功能模块化分析构建棉花全基因组注释体系

论文目录
摘要	第1-5页
Abstract	第5-7页
缩略词	第7-10页
第一章绪论	第10-27页
· 棉花功能基因组研究进展	第10-16页
· 棉花基因功能注释现状	第10-12页
· 棉花组学数据积累与研究进展	第12-16页
· 利用基因网络模块化挖掘基因功能	第16-25页
· 基因调控网络类型和主要作用	第16-18页
· 基于网络分析基因功能的研究方法	第18-21页
· 表观基因组与基因调控研究	第21-22页
· 功能基因集分析方法	第22-23页
· 顺式调控元件分析	第23页
· 多组学数据整合比较基因组学在植物中的应用	第23-25页
· 本研究的目的和主要手段	第25-27页
第二章棉花共表达网络构建与模块化注释功能基因	第27-53页
· 研究背景	第27页
· 数据收集与处理	第27-31页
· 共表达网络构建与分析	第31-41页
· 全局共表达网络构建	第31-32页
· 网络可信度评估	第32-35页
· 基因表达谱动态展示	第35-39页
· 组织特异性网络和胁迫处理网络比较分析	第39-41页
· 功能基因模块化分析工具	第41-43页
· 共表达网络结合表达谱分析功能模块	第43-48页
· 功能模块预测	第48-51页
· 共表达网络功能模块	第48-50页
· miRNA靶基因功能模块	第50-51页
· 讨论与展望	第51-53页
第三章二倍体和多倍体棉花模块化比较分析体系构建	第53-90页
· 研究背景	第53-54页
· 数据获取与处理	第54-55页
· 物种间网络比较分析基因功能	第55-65页
· 直系同源基因对和同源基因簇	第56页
· 直系同源基因网络比较	第56-62页
· 同源基因簇网络比较	第62-65页
· 组蛋白修饰分析完善功能注释	第65-77页
· 亚洲棉和陆地棉H3K4me3全基因组分布情况	第65-68页
· 基因表达与H3K4me3修饰相关性	第68-71页
· 预测棉花新转录本	第71-77页
· 模块化比较分析物种间蛋白差异修饰和转录变化	第77-78页
· 模块化比较分析组织间蛋白差异修饰和转录变化	第78-82页
· 棉花基因功能模块化比较分析平台构建	第82-87页
· 讨论与展望	第87-90页
第四章结论与展望	第90-92页
· 结论	第90-91页
· 展望	第91-92页
参考文献	第92-107页
附录	第107-166页
致谢	第166-167页
个人简历	第167-168页

本篇论文共168页，点击这进入下载页面。

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