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家蚕分子图谱的构建及茧质性状的QTL定位研究

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家蚕分子图谱的构建及茧质性状的QTL定位研究
论文目录
 
中文摘要第10-16 页
英文摘要第16-23 页
第一章 文献综述第23-44 页
  1.1 遗传图谱的研究现状第23-25 页
    1.1.1 遗传图谱的研究意义第23 页
    1.1.2 遗传图谱的种类第23-24 页
      1.1.2.1 实验遗传图第23-24 页
      1.1.2.2 细胞遗传图第24 页
      1.1.2.3 分子遗传图第24 页
    1.1.3 家蚕遗传图谱的早期研究第24-25 页
  1.2 分子遗传标记技术的产生及其特点第25-27 页
    1.2.1 表型标记第25 页
      1.2.1.1 形态标记第25 页
      1.2.1.2 同工酶标记第25 页
    1.2.2 分子遗传标记第25-27 页
      1.2.2.1 RFLP标记第26 页
      1.2.2.2 RAPD标记第26 页
      1.2.2.3 AFLP标记第26-27 页
      1.2.2.4 其它分子标记第27 页
  1.3 分子连锁图谱构建的研究进展第27-33 页
    1.3.1 影响分子连锁图谱作图效果的因素第27-29 页
      1.3.1.1 亲本和分离群体类型的选择第27-28 页
      1.3.1.2 家蚕作图群体大小第28-29 页
      1.3.1.3 交换值与作图的关系第29 页
      1.3.1.4 标记数与图谱的饱和度第29 页
    1.3.2 动植物分子连锁图谱的构建第29-30 页
    1.3.3 家蚕分子连锁图的研究第30-32 页
      1.3.3.1 家蚕RFLP分子连锁图第31 页
      1.3.3.2 家蚕RAPD分子连锁图第31-32 页
      1.3.3.3 家蚕SADF和AFLP分子连锁图第32 页
      1.3.3.4 其它分子标记在蚕业科学研究的发展趋势第32 页
    1.3.4 分子连锁图谱在比较基因组作图中的应用第32-33 页
    1.3.5 连锁图谱在分子标记辅助育种中的应用第33 页
  1.4 QTL定位技术及其应用第33-36 页
    1.4.1 QTL定位技术的产生和发展第33-34 页
    1.4.2 其它动植物数量性状基因定位研究现状第34-35 页
    1.4.3 家蚕QTL研究进展第35-36 页
  1.5 家蚕分子育种技术的产生与发展第36-44 页
    1.5.1 家蚕育种技术发展第36-37 页
    1.5.2 家蚕分子育种育种技术的产生第37 页
    1.5.3 家蚕分子标记辅助选择育种第37-39 页
      1.5.3.1 DNA标记回交辅助选择育种第37-38 页
      1.5.3.2 DNA杂交辅助育种第38 页
      1.5.3.3 DNA标记辅助抗性育种第38-39 页
    1.5.4 分子标记在杂种优势预测上的应用第39-44 页
      1.5.4.1 基因多态性与杂种优势第40 页
      1.5.4.2 DNA分子标记差异性与杂种优势第40-41 页
      1.5.4.3 mRNA差异显示与杂种优势第41 页
      1.5.4.4 基因网络系统与杂种优势第41-42 页
      1.5.4.5 分子标记与杂种优势研究展望第42 页
      1.5.4.6 利用分子标记进行家蚕杂种优势预测的设想第42-44 页
第二章 引言第44-49 页
第三章 家蚕高密度AFLP分子连锁图谱的构建第49-78 页
  3.1 材料和方法第49-55 页
    3.1.1 材料第49 页
    3.1.2 主要试剂第49 页
    3.1.3 作图软件第49 页
    3.1.4 主要仪器与设备第49-50 页
    3.1.5 基因组DNA的制备第50 页
    3.1.6 基因组DNA的酶切与连接第50-51 页
      3.1.6.1 酶切第50 页
      3.1.6.2 接头第50-51 页
      3.1.6.3 连接第51 页
    3.1.7 酶切片段的扩增第51-53 页
      3.1.7.1 预扩增第51 页
      3.1.7.2 二次扩增第51-53 页
    3.1.8 扩增产物的测序胶电泳分析第53 页
    3.1.9 连锁数据的统计与分析第53 页
      3.1.9.1 分子标记数据的统计第53 页
      3.1.9.2 连锁分析及家蚕AFLP连锁图谱的构建第53 页
    3.1.10 不同群体的抽样及其建立第53-54 页
    3.1.11 不同标记数的抽样第54-55 页
  3.2 结果与分析第55-72 页
    3.2.1 高质量家蚕基因组DNA的提取第55 页
    3.2.2 扩增产物的凝胶检测第55-56 页
    3.2.3 家蚕AFLP分子标记的重复性第56-57 页
    3.2.4 AFLP标记的多态性分布第57-59 页
    3.2.5 家蚕AFLP分子遗传图谱的构建第59-60 页
    3.2.6 家蚕AFLP标记图谱第60-64 页
    3.2.7 本研究构建的分子连锁图谱对QTL定位的作用第64 页
    3.2.8 现行家蚕遗传图谱的比较第64-65 页
    3.2.9 群体大小与作图效果第65-71 页
      3.2.9.1 不同群体大小在相同交换值条件下的分群差异第65-67 页
      3.2.9.2 各类群体a亚群不同交换值的分群效果第67-68 页
      3.2.9.3 各类群体b亚群不同交换值的分群效果第68-70 页
      3.2.9.4 不同群体的作图效果第70-71 页
    3.2.10 相同群体不同标记数的作图比较第71-72 页
  3.3 讨论第72-78 页
    3.3.1 作图群体的建立第72-74 页
      3.3.1.1 亲本和分离群体类型的选择第72 页
      3.3.1.2 作图群体大小的确定第72-73 页
      3.3.1.3 交换值和标记数与作图的关系第73-74 页
    3.3.2 标记数与图谱的饱和度第74-75 页
    3.3.3 限制性内切酶的选择第75 页
    3.3.4 家蚕遗传图谱的比较第75-76 页
    3.3.5 家蚕遗传图谱的整合及对未来工作的思考第76-78 页
第四章 家蚕茧质性状的QTL定位第78-112 页
  4.1 材料与方法第78-79 页
    4.1.1 F2分离群体的建立和F2的分离群体数量性状的获得第78 页
    4.1.2 AFLP分子标记的获得第78-79 页
    4.1.3 QTL定位分析第79 页
      4.1.3.1 家蚕茧质性状的性别效应第79 页
      4.1.3.2 QTL分析方法第79 页
  4.2 结果与分析第79-106 页
    4.2.1 全茧量、茧层量、茧层率性状的性别效应估算第79-81 页
    4.2.2 全茧量、茧层量、茧层率性状的分布规律第81-85 页
      4.2.2.1 全茧量、茧层量、茧层率和蛹体重等性状性别调整前后的差异第81-84 页
      4.2.2.2 性别效应作用下全茧量、茧层量、茧层率、蛹体重等性状的分布特征第84-85 页
      4.2.2.3 性别效应校正后全茧量、茧层量、茧层率性状的分布特征第85 页
    4.2.3 F2群体及分子连锁图谱的特征第85-86 页
    4.2.4 家蚕全茧量、茧层量、茧层率和蛹体重等性状的QTL定位分析第86-93 页
      4.2.4.1 家蚕全茧量、茧层量性状的QTL定位分析第86-91 页
      4.2.4.2 家蚕茧层率、蛹体重性状的QTL定位分析第91-93 页
    4.2.5 被检测到的家蚕茧质和蛹体重等性状的QTL数目及其在染色体上的分布第93-96 页
    4.2.6 QTL的效应及其显著性与贡献率的关系第96-99 页
    4.2.7 同一群体不同标记数的QTL定位比较第99-106 页
      4.2.7.1 542个总标记的QTL定位结果第100-102 页
      4.2.7.2 392个总标记的QTL定位结果第102-105 页
      4.2.7.3 不同标记数的QTL定位结果比较第105-106 页
  4.3 讨论第106-112 页
    4.3.1 家蚕全茧量、茧层量、茧层率和蛹体重性状的性别效应第106 页
    4.3.2 QTL作图的显著性域值第106-107 页
    4.3.3 QTL的确认第107 页
    4.3.4 QTL的遗传主效应及其上位性估计第107-108 页
    4.3.5 QTL效应及其显著性与贡献率第108-109 页
    4.3.6 不同标记数的QTL定位差异第109 页
    4.3.7 QTL作图的研究成果在遗传育种上的应用前景第109-112 页
      4.3.7.1 指导遗传育种实践第109-110 页
      4.3.7.2 QTL的克隆第110 页
      4.3.7.3 标记辅助选择第110-112 页
第五章 家蚕近交系后代分子标记的传递规律及其DNA多态性第112-134 页
  5.1 材料与方法第112-115 页
    5.1.1 试验用蚕品种第112 页
    5.1.2 亲本间的杂交及杂交后代的选择与选配第112-113 页
    5.1.3 近交系各代供DNA分析的材料的准备第113 页
    5.1.4 蚕蛾DNA的抽提第113 页
      5.1.4.1 蚕蛾DNA的方法第113 页
      5.1.4.2 蚕蛾DNA的质量和RAPD检测第113 页
    5.1.5 AFLP分子标记的获得第113-114 页
    5.1.6 各近交系的DNA多态性及其聚类分析第114-115 页
  5.2 结果与分析第115-131 页
    5.2.1 近交系定向选择的效果第115-117 页
    5.2.2 近交系各代茧质性状的方差及其近交纯合性分析第117-120 页
    5.2.3 各近交系的遗传距离第120-122 页
    5.2.4 各近交系DNA水平上的聚类分析第122-124 页
    5.2.5 不同近交选育系各选育各代的DNA多态性比较第124-127 页
    5.2.6 近交系各代分子标记的分布特征第127-128 页
    5.2.7 蚕蛾DNA的抽提效果第128-131 页
      5.2.7.1 蚕蛾基因组DNA的浓度和纯度分析第128-129 页
      5.2.7.2 蚕蛾基因组DNA的PCR及RAPD检测第129 页
      5.2.7.3 蚕蛾基因组的有效提取在家蚕育种上的意义第129-131 页
  5.3 讨论第131-134 页
    5.3.1 定向歧化选择各近交系的遗传表现第131 页
    5.3.2 近交系各代纯合性分析第131-132 页
    5.3.3 亲本及其杂交后代的DNA差异第132 页
    5.3.4 分子标记近交系各代的分布第132-133 页
    5.3.5 蚕卵DNA的抽提效果在家蚕育种上的意义第133-134 页
第六章 结论第134-137 页
参考文献第137-145 页
攻读博士学位期间发表的论文和参加的课题第145-146 页
英文缩写第146-147 页
致谢第147页

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