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斑皮桉及其近缘树种CCR基因分子克隆及变异分析
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斑皮桉及其近缘树种CCR基因分子克隆及变异分析
论文目录
 
缩略词表第1-9 页
中文摘要第9-11 页
英文摘要第11-13 页
1 前言第13-24 页
　　· 桉树第13-14 页
　　· 伞房属第14-15 页
　　· CCR基因第15-19 页
　　· 植物CCR基因及有关分子遗传信息研究进展第19-21 页
　　· 研究目的第21-24 页
2 材料和方法第24-50 页
　　· 试验样本第24 页
　　· 试验试剂第24-27 页
　　　　· 基因组DNA提取试剂第24 页
　　　　· CCR基因PCR反应试剂第24-26 页
　　　　· 电泳及凝胶纯化试剂第26 页
　　　　· 克隆试剂盒和感受态细胞的制备第26-27 页
　　　　· 测序反应和纯化试剂第27 页
　　· 仪器和设备第27 页
　　· 基因组DNA的提取方法第27-30 页
　　· CCR基因PCR反应条件第30-36 页
　　　　· 引物设计与合成第30-34 页
　　　　· PCR反应条件第34-36 页
　　· 凝胶电泳纯化DNA第36-37 页
　　· 直接测序第37-38 页
　　　　· 测序反应第37 页
　　　　· 纯化第37-38 页
　　· 克隆测序第38-43 页
　　　　· 缓冲液及溶液配方第39-40 页
　　　　· 感受态细胞的制备第40-41 页
　　　　· pGEM(?)-T Easy载体连接反应的步骤第41-42 页
　　　　· pGEM(?)-T Easy载体连接反应产物的转化步骤第42-43 页
　　· 克隆菌落的筛选第43-48 页
　　　　· 以菌落为模板的PCR检验克隆菌落第43-44 页
　　　　· 以Templiphi产物PCR或酶切检验克隆菌落第44-46 页
　　　　· 以MiniPrep产物PCR或酶切检验克隆菌落第46-48 页
　　· 克隆片断的测序第48-49 页
　　　　· 质粒DNA的测序第48 页
　　　　· Templiphi产物的直接测序第48-49 页
　　· 序列校正和拼接第49 页
　　· 序列比对、系统进化分析和基因变异分析第49-50 页
　　　　· 系统进化分析第49-50 页
　　　　· 基因变异分析第50 页
3 结果与分析第50-82 页
　　· 基因组DNA提取结果第50 页
　　· DNA浓度和产量第50-51 页
　　· PCR条件的优化第51-54 页
　　　　· 引物对0420-3185的PCR条件第52 页
　　　　· 引物对0420-1678和1610-3198的PCR条件第52-53 页
　　　　· 引物对A-3198的PCR条件第53-54 页
　　· PCR产物凝胶纯化第54-55 页
　　· 目的片断的直接测序第55 页
　　· 伞房属和加柠桉的比对第55-57 页
　　· NCBI BLAST分析第57 页
　　· 伞房属16个样本CCR基因的变异分析第57-61 页
　　　　· 伞房属16个样本CCR基因的比对第57 页
　　　　· 变异点分析第57-61 页
　　· 用伞房属CCR基因构建系统发育树第61-64 页
　　　　· 采用加柠桉为外属构建进化树第61-62 页
　　　　· 不采用加柠桉为外属构建进化树第62-64 页
　　· 克隆测序第64-82 页
　　　　· 克隆转化效果的分析第64-65 页
　　　　· 克隆菌落的筛选第65-69 页
　　　　· 杯果木属CCR基因的克隆第69-70 页
　　　　· 伞房属CCR基因多拷贝的发现及分析第70-76 页
　　　　· CCV样本CCR基因的变异分析第76-82 页
4 讨论第82-91 页
参考文献第91-101 页
附录Ⅰ第101-102 页
附录Ⅱ第102-117 页
附录Ⅲ第117-128 页
附录Ⅳ第128-142 页
致谢第142页

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