向日葵响应黄萎病菌侵染的转录组分析及抗病相关基因挖掘

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向日葵响应黄萎病菌侵染的转录组分析及抗病相关基因挖掘

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向日葵响应黄萎病菌侵染的转录组分析及抗病相关基因挖掘

论文目录
摘要	第1-6页
ABSTRACT	第6-11页
第一章引言	第11-22页
· 研究背景和意义	第11-13页
· 国内外研究现状	第13-19页
· 植物黄萎病致病机理研究现状	第13页
· 植物抗黄萎病机理研究现状	第13-14页
· 转录组测序技术研究概述	第14-18页
· RNA-Seq在植物抗病机制研究中的应用现状	第18-19页
· 论文的组织结构和创新点	第19-22页
· 论文组织结构	第19-20页
· 技术路线	第20-21页
· 论文创新点	第21-22页
第二章黄萎病菌胁迫下向日葵品种S18、P77的生理生化指标响应及抗病性鉴定	第22-34页
· 引言	第22-24页
· 实验材料	第24页
· 植物材料及菌种	第24页
· 主要试剂	第24页
· 主要仪器设备	第24页
· 实验方法	第24-28页
· 植物材料和菌培养及接菌	第24-25页
· 抗病性鉴定	第25-26页
· 取样方法	第26页
· 生理生化指标测定方法	第26-28页
· 结果与分析	第28-31页
· 抗病性检测结果	第28页
· 生理生化指标测定结果	第28-31页
· 讨论	第31-32页
· 抗病性鉴定	第31页
· 病原菌侵染下植物生理生化响应	第31-32页
· 小结	第32-34页
第三章黄萎病胁迫下向日葵转录组测序及功能注释	第34-47页
· 引言	第34-35页
· 实验材料	第35-36页
· 植物材料及菌种	第35页
· 主要试剂	第35页
· 主要仪器设备	第35-36页
· 实验方法	第36-40页
· RNA制备	第36-37页
· 转录组测序与数据处理	第37-40页
· 结果与分析	第40-45页
· RNA样本质量检测结果	第40-41页
· RNA-Seq测序结果	第41-42页
· 基因表达量计算及功能注释	第42-45页
· 讨论	第45页
· 小结	第45-47页
第四章向日葵响应黄萎病侵染的差异表达基因筛选与分析	第47-68页
· 引言	第47页
· 研究材料	第47-48页
· 数据材料	第47-48页
· 主要仪器设备	第48页
· 研究方法	第48-50页
· 主成分分析和条件特异表达分析	第48-49页
· 差异表达基因(DEGs)筛选	第49页
· 差异表达基因GO功能注释与KEGG通路分析	第49页
· 抗黄萎病相关DEGs共表达网络构建	第49-50页
· 结果与分析	第50-65页
· 主成分分析和条件特异表达分析结果	第50-51页
· SCK与PCK间DEGs筛选及功能注释	第51-52页
· 病原菌诱导下样品DEGs筛选与功能注释	第52-56页
· 品种间共表达模式DEGs分析	第56-58页
· 品种间特异表达模式下DEGs分析	第58-60页
· 向日葵抗黄萎病相关DEGs的KEGG通路分析	第60-65页
· 抗黄萎病相关DEGs共表达网络调控研究	第65页
· 讨论	第65-66页
· 小结	第66-68页
第五章向日葵抗黄萎病差异表达基因的q-PCR验证	第68-75页
· 引言	第68页
· 实验材料	第68-69页
· 植物材料	第68页
· 主要试剂	第68-69页
· 主要仪器设备	第69页
· 实验方法	第69-71页
· RNA提取	第69-70页
· qRCR反应体系及程序	第70-71页
· 结果与分析	第71-74页
· RNA提取结果	第71页
· qPCR验证结果	第71-74页
· 讨论	第74页
· 小结	第74-75页
第六章总结与展望	第75-78页
· 本论文工作总结	第75-76页
· 工作展望	第76-78页
参考文献	第78-90页
附录1 RNA样品质量检验和测序质量评估	第90-92页
附录2 差异表达基因筛选及KEGG通路分析	第92-97页
附录3 q-PCR反应引物序列信息、18S序列信息及溶解曲线	第97-100页
致谢	第100-102页
攻读博士学位期间发表的学术论文	第102-103页

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