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链霉菌转录调控和转运分泌的功能基因系统进化研究
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链霉菌转录调控和转运分泌的功能基因系统进化研究
论文目录
摘要
第1-8页
Abstract
第8-11页
缩略词
第11-15页
第1章 绪论
第15-31页
· 概述
第15-16页
· 链霉菌基因组学研究进展
第16-26页
· 链霉菌基因组的特性
第17-21页
· 链霉菌转录组学研究进展
第21-24页
· 链霉菌蛋白组学研究进展
第24-26页
· 膜复合蛋白SecDF研究进展
第26-29页
· 链霉菌生物学研究走向系统生物学
第29-30页
· 本论文主要研究内容
第30-31页
第2章 链霉菌基因组可塑性及系统进化
第31-59页
· 引言
第31-32页
· 材料与方法
第32-33页
· 基因组数据
第32页
· 序列相似性比对及同源基因家族鉴定
第32-33页
· 功能分类分析
第33页
· 结果与讨论
第33-57页
· 泛基因组含有17,362同源基因家族
第33-34页
· 链霉菌基因组成分定位分析
第34-40页
· 链霉菌核心基因组
第40-49页
· 链霉菌谱系特异性扩增
第49-57页
· 本章小结
第57-59页
第3章 链霉菌sigma因子介导的基因转录调控网络
第59-79页
· 引言
第59-60页
· 材料与方法
第60-61页
· sigma因子鉴定及分类
第60页
· sigma因子序列相似性分析及同源家族分类
第60页
· 相互作用网络分析
第60-61页
· 结果与讨论
第61-77页
· 链霉菌sigma因子分类
第61-63页
· 链霉菌sigma基因家族鉴定
第63-69页
· 链霉菌sigma因子相互作用蛋白分析
第69-77页
· 本章小结
第77-79页
第4章 链霉菌转运分泌网络
第79-103页
· 引言
第79-80页
· 材料与方法
第80-81页
· 基因组数据及转运蛋白家族分类数据
第80页
· 转运蛋白鉴定及分类
第80-81页
· 转运蛋白保守结构域分析
第81页
· 转运蛋白跨膜结构分析
第81页
· 转运蛋白底物分析
第81页
· 结果与讨论
第81-101页
· 链霉菌转运蛋白鉴定
第81-82页
· 链霉菌转运蛋白跨膜结构分析
第82-85页
· 链霉菌转运蛋白家族分类
第85-96页
· 链霉菌转运蛋白底物分布
第96-98页
· 链霉菌蛋白质分泌系统
第98-101页
· 本章小结
第101-103页
第5章 SecD/F进化与功能分析
第103-129页
· 引言
第103-104页
· 材料与方法
第104-115页
· 菌株、质粒、引物、主要仪器及设备
第104-107页
· 培养基及培养条件
第107-109页
· 大肠杆菌相关基因克隆实验技术
第109-110页
· 链霉菌基因组DNA抽提
第110页
· 链霉菌质粒的构建及转化
第110-111页
· 链霉菌基因敲除株的构建及验证
第111-112页
· 链霉菌总RNA抽提及检测
第112-113页
· 链霉菌胞内及胞外蛋白提取及检测
第113-114页
· 报告蛋白检测方法
第114-115页
· 分子进化分析方法
第115页
· 结果与讨论
第115-127页
· 链霉菌secD/F同源基因分子进化
第115-118页
· S coelicolor secD/F同源基因敲除及验证
第118-119页
· S coelicolor secD/F同源基因缺失株表型分析
第119-121页
· S coelicolor secD/F同源基因功能分化
第121-123页
· S coelicolor secD/F同源基因表达分化
第123-127页
· 本章小结
第127-129页
第6章 结论与展望
第129-131页
· 本文研究成果
第129-130页
· 后续研究展望
第130-131页
参考文献
第131-145页
攻读博士学位期间的主要研究成果
第145-146页
致谢
第146页
本篇论文共
146
页,
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