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链霉菌转录调控和转运分泌的功能基因系统进化研究

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链霉菌转录调控和转运分泌的功能基因系统进化研究
论文目录
 
摘要第1-8页
Abstract第8-11页
缩略词第11-15页
第1章 绪论第15-31页
  · 概述第15-16页
  · 链霉菌基因组学研究进展第16-26页
    · 链霉菌基因组的特性第17-21页
    · 链霉菌转录组学研究进展第21-24页
    · 链霉菌蛋白组学研究进展第24-26页
  · 膜复合蛋白SecDF研究进展第26-29页
  · 链霉菌生物学研究走向系统生物学第29-30页
  · 本论文主要研究内容第30-31页
第2章 链霉菌基因组可塑性及系统进化第31-59页
  · 引言第31-32页
  · 材料与方法第32-33页
    · 基因组数据第32页
    · 序列相似性比对及同源基因家族鉴定第32-33页
    · 功能分类分析第33页
  · 结果与讨论第33-57页
    · 泛基因组含有17,362同源基因家族第33-34页
    · 链霉菌基因组成分定位分析第34-40页
    · 链霉菌核心基因组第40-49页
    · 链霉菌谱系特异性扩增第49-57页
  · 本章小结第57-59页
第3章 链霉菌sigma因子介导的基因转录调控网络第59-79页
  · 引言第59-60页
  · 材料与方法第60-61页
    · sigma因子鉴定及分类第60页
    · sigma因子序列相似性分析及同源家族分类第60页
    · 相互作用网络分析第60-61页
  · 结果与讨论第61-77页
    · 链霉菌sigma因子分类第61-63页
    · 链霉菌sigma基因家族鉴定第63-69页
    · 链霉菌sigma因子相互作用蛋白分析第69-77页
  · 本章小结第77-79页
第4章 链霉菌转运分泌网络第79-103页
  · 引言第79-80页
  · 材料与方法第80-81页
    · 基因组数据及转运蛋白家族分类数据第80页
    · 转运蛋白鉴定及分类第80-81页
    · 转运蛋白保守结构域分析第81页
    · 转运蛋白跨膜结构分析第81页
    · 转运蛋白底物分析第81页
  · 结果与讨论第81-101页
    · 链霉菌转运蛋白鉴定第81-82页
    · 链霉菌转运蛋白跨膜结构分析第82-85页
    · 链霉菌转运蛋白家族分类第85-96页
    · 链霉菌转运蛋白底物分布第96-98页
    · 链霉菌蛋白质分泌系统第98-101页
  · 本章小结第101-103页
第5章 SecD/F进化与功能分析第103-129页
  · 引言第103-104页
  · 材料与方法第104-115页
    · 菌株、质粒、引物、主要仪器及设备第104-107页
    · 培养基及培养条件第107-109页
    · 大肠杆菌相关基因克隆实验技术第109-110页
    · 链霉菌基因组DNA抽提第110页
    · 链霉菌质粒的构建及转化第110-111页
    · 链霉菌基因敲除株的构建及验证第111-112页
    · 链霉菌总RNA抽提及检测第112-113页
    · 链霉菌胞内及胞外蛋白提取及检测第113-114页
    · 报告蛋白检测方法第114-115页
    · 分子进化分析方法第115页
  · 结果与讨论第115-127页
    · 链霉菌secD/F同源基因分子进化第115-118页
    · S coelicolor secD/F同源基因敲除及验证第118-119页
    · S coelicolor secD/F同源基因缺失株表型分析第119-121页
    · S coelicolor secD/F同源基因功能分化第121-123页
    · S coelicolor secD/F同源基因表达分化第123-127页
  · 本章小结第127-129页
第6章 结论与展望第129-131页
  · 本文研究成果第129-130页
  · 后续研究展望第130-131页
参考文献第131-145页
攻读博士学位期间的主要研究成果第145-146页
致谢第146页

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