论文目录 | |
| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-14页 |
| 1 绪论 | 第14-26页 |
| · 杨树概述 | 第14页 |
| · 植物芽休眠调控机理的研究进展 | 第14-18页 |
| · 芽休眠概述 | 第14-15页 |
| · 内休眠分子调控的研究进展 | 第15-16页 |
| · 类休眠分子调控的研究进展 | 第16-17页 |
| · 生态休眠分子调控的研究进展 | 第17-18页 |
| · 磷酸化蛋白质组学研究进展 | 第18-22页 |
| · 蛋白质磷酸化与磷酸化蛋白质组 | 第18-19页 |
| · 磷酸化蛋白质组分析中常用的分离富集技术 | 第19-20页 |
| · 生物质谱法进行磷酸化蛋白质组研究 | 第20-22页 |
| · 植物磷酸化蛋白质组研究进展 | 第22-23页 |
| · 植物对非生物、生物环境因子响应过程的磷酸化蛋白质组 | 第22页 |
| · 亚细胞磷酸化蛋白质组的鉴定 | 第22-23页 |
| · N~α-乙酰化蛋白质组研究进展 | 第23-25页 |
| · 本研究目的和意义 | 第25-26页 |
| 2 磷酸化蛋白质组鉴定和分析杨树休眠顶芽蛋白 | 第26-55页 |
| · 研究背景 | 第26-27页 |
| · 实验材料 | 第27页 |
| · 植物材料 | 第27页 |
| · 实验试剂 | 第27页 |
| · 实验方法 | 第27-29页 |
| · 提取杨树休眠顶芽总蛋白 | 第27页 |
| · 溶液酶解总蛋白 | 第27页 |
| · 富集磷酸化肽段 | 第27-28页 |
| · NanoUPLC-ESI-MS/MS串联质谱鉴定 | 第28页 |
| · 数据分析及Mascot数据库搜索 | 第28页 |
| · 生物信息学分析 | 第28-29页 |
| · 结果 | 第29-50页 |
| · 杨树休眠顶芽磷酸化蛋白质组的鉴定 | 第29-43页 |
| · 杨树与拟南芥磷酸化蛋白和磷酸化位点相对保守 | 第43-46页 |
| · 杨树蛋白特有的磷酸化位点 | 第46-47页 |
| · 杨树休眠顶芽磷酸化蛋白的分类 | 第47-48页 |
| · 杨树休眠期间可能参与磷酸化信号转导的蛋白激酶 | 第48-50页 |
| · 讨论 | 第50-54页 |
| · 与休眠相关涉及信号转导的磷酸化蛋白 | 第50-51页 |
| · 与休眠相关涉及生长素响应和生长发育的磷酸化蛋白 | 第51页 |
| · 与休眠相关涉及冷胁迫响应的磷酸化蛋白 | 第51-52页 |
| · 与休眠相关涉及黄酮类化合物生物合成的磷酸化蛋白 | 第52页 |
| · 与休眠相关涉及转运功能的磷酸化蛋白 | 第52页 |
| · 与休眠相关涉及蛋白质合成的磷酸化蛋白 | 第52-53页 |
| · 与休眠相关涉及电子转移及能量途径的磷酸化蛋白 | 第53-54页 |
| · 本章小结 | 第54-55页 |
| 3 磷酸化蛋白质组鉴定和分析杨树休眠顶芽核糖体P-蛋白 | 第55-70页 |
| · 研究背景 | 第55-56页 |
| · 实验材料 | 第56页 |
| · 植物材料 | 第56页 |
| · 实验试剂 | 第56页 |
| · 实验方法 | 第56-58页 |
| · 分离提取核糖体P-蛋白 | 第56页 |
| · 溶液酶解核糖体P-蛋白 | 第56-57页 |
| · 富集磷酸化肽段 | 第57页 |
| · NanoUPLC-ESI-MS/MS串联质谱鉴定 | 第57页 |
| · Mascot数据库搜索 | 第57页 |
| · 柔性对接和分子动力学模拟 | 第57-58页 |
| · 进化分析核糖体P-蛋白 | 第58页 |
| · 结果 | 第58-67页 |
| · 杨树P-蛋白磷酸化的鉴定 | 第58-60页 |
| · 杨树CK2负责P-蛋白C-端域的磷酸化 | 第60-63页 |
| · 杨树P3蛋白的鉴定和命名 | 第63-65页 |
| · 杨树P-蛋白C-末端序列特征 | 第65-67页 |
| · 核糖体P-蛋白的同源和进化分析 | 第67页 |
| · 讨论 | 第67-69页 |
| · 杨树休眠顶芽是研究核糖体P-蛋白磷酸化的好材料 | 第67页 |
| · 磷酸化全部发生在P-蛋白高度保守的C-末端且由CK2催化引起 | 第67-69页 |
| · 杨树的P2蛋白具分歧 | 第69页 |
| · 本章小结 | 第69-70页 |
| 4 乙酰化蛋白质组鉴定和分析杨树休眠顶芽蛋白 | 第70-89页 |
| · 研究背景 | 第70-71页 |
| · 实验材料 | 第71页 |
| · 植物材料 | 第71页 |
| · 实验试剂 | 第71页 |
| · 实验方法 | 第71-73页 |
| · 提取杨树休眠顶芽总蛋白 | 第71页 |
| · 溶液酶解总蛋白 | 第71页 |
| · 富集乙酰化肽段 | 第71页 |
| · NanoUPLC-ESI-MS/MS串联质谱鉴定 | 第71-72页 |
| · 数据分析及Mascot数据库搜索 | 第72页 |
| · 生物信息学分析 | 第72-73页 |
| · 结果 | 第73-85页 |
| · 杨树乙酰化蛋白的鉴定及特征描述 | 第73-77页 |
| · 鉴定目标杨树蛋白NME过程涉及的酶类 | 第77-81页 |
| · 鉴定目标杨树蛋白N~α-乙酰化涉及的Nats | 第81-82页 |
| · 全基因组鉴定杨树和拟南芥的Nats | 第82-85页 |
| · 讨论 | 第85-88页 |
| · 杨树蛋白去除N-末端Met遵循普遍的NME规则 | 第85-86页 |
| · 杨树基因组编码一个扩展的Nat催化亚基系统 | 第86页 |
| · 拟南芥、杨树的细胞质和叶绿体型NatA-B异构体 | 第86-87页 |
| · 休眠期间杨树蛋白N~α-乙酰化的生物学意义 | 第87-88页 |
| · 本章小结 | 第88-89页 |
| 结论 | 第89-90页 |
| 参考文献 | 第90-106页 |
| 附录1 缩略语一览表 | 第106-107页 |
| 附录2 与拟南芥具有同源蛋白的保守的磷酸化位点 | 第107-112页 |
| 附录3 与拟南芥具有同源蛋白的非保守的磷酸化位点 | 第112-113页 |
| 附录4 KOG分类杨树磷酸化蛋白及所有蛋白信息 | 第113-114页 |
| 附录5 KOG分析杨树休眠顶芽磷酸化蛋白及所有杨树蛋白 | 第114-115页 |
| 附录6 讨论部分中所提到的磷酸化蛋白详细信息 | 第115-117页 |
| 附录7 多序列比对每个杨树P-蛋白家族 | 第117-120页 |
| 附录8 研究所涉及到的P-蛋白信息 | 第120-122页 |
| 附录9 鉴定的杨树乙酰化肽段和位点信息 | 第122-126页 |
| 附录10 多序列比对真核生物各自Nat类型催化亚基 | 第126-128页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第128-129页 |
| 致谢 | 第129-130页 |
