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基于RNA-seq的棉花陆海渐渗系黄萎病抗性及纤维品质研究
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基于RNA-seq的棉花陆海渐渗系黄萎病抗性及纤维品质研究
论文目录
摘要
第1-9页
ABSTRACT
第9-12页
缩略语表
第12-13页
第一章 前言
第13-30页
1.1 棉花的起源与驯化
第13-14页
1.2 植物染色体片段代换系的研究进展
第14-17页
1.2.1 染色体片段代换系的构建和特点
第14-15页
1.2.2 染色体片段代换系的应用
第15-17页
1.3 棉花黄萎病抗性相关的研究进展
第17-25页
1.3.1 棉花黄萎病的研究现状
第17-19页
1.3.2 棉花黄萎病致病机理
第19-21页
1.3.3 棉花抗黄萎病分子机制
第21-22页
1.3.4 棉花黄萎病相关转录组研究
第22-25页
1.4 棉花纤维发育过程及相关转录组研究
第25-28页
1.4.1 棉花纤维发育过程
第25-26页
1.4.2 棉花纤维发育的转录组研究
第26-28页
1.5 本研究的目的和意义
第28-30页
第二章 陆海渐渗系黄萎病抗性研究
第30-84页
2.1 材料与方法
第30-34页
2.1.1 实验材料
第30-31页
2.1.2 棉花黄萎病菌株
第31-32页
2.1.3 实验试剂
第32-33页
2.1.4 实验仪器
第33-34页
2.2 实验方法
第34-48页
2.2.1 棉花黄萎病抗性鉴定
第34-36页
2.2.2 陆海渐渗系遗传背景鉴定
第36-38页
2.2.3 棉花纤维品质性状检测
第38页
2.2.4 棉花黄萎病相关生理生化指标检测
第38-43页
2.2.5 棉花黄萎病转录组测序和分析
第43-48页
2.3 结果与分析
第48-76页
2.3.1 棉花黄萎病抗性鉴定
第48-53页
2.3.2 陆海渐渗系遗传背景鉴定
第53-57页
2.3.3 棉花纤维品质检测
第57-58页
2.3.4 棉花生理生化指标检测结果
第58-60页
2.3.5 棉花黄萎病转录组测序分析
第60-76页
2.4 讨论
第76-84页
2.4.1 实验条件和表型评价
第76-77页
2.4.2 与V991侵染相关的生理生化抗性机制
第77-79页
2.4.3 与V991侵染相关的基因表达变化
第79-80页
2.4.4 与V991侵染相关的苯丙烷代谢通路
第80-81页
2.4.5 与V991侵染相关的氧化还原过程
第81-82页
2.4.6 与V991侵染相关的植物抗性基因
第82-84页
第三章 棉花陆海渐渗系的纤维转录组分析
第84-110页
3.1 材料与方法
第84-85页
3.1.1 实验材料和取样
第84-85页
3.1.2 主要试剂耗材
第85页
3.2 实验方法
第85-88页
3.2.1 RNA的提取与检测
第85页
3.2.2 cDNA文库构建与测序
第85-86页
3.2.3 数据质量控制与参考基因组比对
第86页
3.2.4 差异表达基因分析
第86-87页
3.2.5 渐渗基因的预测
第87页
3.2.6 qRT-PCR验证转录组测序数据
第87-88页
3.3 结果与分析
第88-105页
3.3.1 渐渗系的表型特征和渐渗背景
第88-90页
3.3.2 RNA-seq和序列比对
第90-93页
3.3.3 差异表达基因分析
第93-98页
3.3.4 基因时序表达模式分析
第98-101页
3.3.5 差异表达基因的qRT-PCR验证
第101-102页
3.3.6 渐渗基因分析
第102-105页
3.4 讨论
第105-110页
第四章 全文总结与讨论
第110-113页
4.1 棉花黄萎病抗性相关研究
第110-112页
4.2 棉花纤维品质相关研究
第112-113页
参考文献
第113-130页
附录:作者简介及在读期间发表的文章
第130-131页
致谢
第131-132页
本篇论文共
132
页,
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