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PRRSV抗体差异猪外周血单核细胞的转录组及全基因组DNA甲基化调控研究

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PRRSV抗体差异猪外周血单核细胞的转录组及全基因组DNA甲基化调控研究
论文目录
 
摘要第1-6页
ABSTRACT第6-10页
ABBREVIATIONS第10-11页
第一章 文献综述第11-29页
  1.1 猪繁殖与呼吸综合征及其免疫遗传学研究进展第11-17页
    1.1.1 猪繁殖与呼吸综合征对现代养猪业的危害第11页
    1.1.2 猪繁殖与呼吸综合征的发病机理第11-14页
    1.1.3 猪繁殖与呼吸综合征病毒感染的抗体依赖性增强(ADE)作用第14-15页
    1.1.4 猪繁殖与呼吸综合征抗性的遗传研究进展第15-16页
    1.1.5 猪繁殖与呼吸综合征免疫遗传学的研究进展第16-17页
  1.2 表观遗传学研究进展第17-25页
    1.2.1 表观遗传学及其作用第17-18页
    1.2.2 DNA甲基化第18-21页
    1.2.3 DNA甲基化的研究方法第21-24页
    1.2.4 疫苗免疫应答的DNA甲基化调控研究进展第24-25页
  1.3 外周血单核细胞(PBMCs)第25页
  1.4 猪PRRS宿主转录组学研究进展第25-27页
    1.4.1 RNA-seq技术第25-26页
    1.4.2 RNA-seq在猪转录组学研究中的应用第26页
    1.4.3 猪繁殖与呼吸综合征宿主转录组学的研究进展第26-27页
  1.5 本研究的目的和意义第27-29页
第二章 妊娠母猪PRRS活毒疫苗免疫后PBMCS转录组研究第29-50页
  2.1 材料与方法第30-37页
    2.1.1 试验材料第30-31页
    2.1.2 试验方法第31-37页
  2.2 结果与分析第37-47页
    2.2.1 妊娠母猪PRRSV抗体水平的变异第37-38页
    2.2.2 长白妊娠母猪PRRSV抗体高、中、低水平个体间差异情况第38-39页
    2.2.3 PBMCs总RNA的质检结果第39-40页
    2.2.4 妊娠母猪PRRSV抗体高、中、低水平个体间PBMCs转录组分析第40-47页
    2.2.5 RT-qPCR验证转录组测序结果第47页
  2.3 讨论第47-48页
  2.4 小结第48-50页
第三章 仔猪PRRSV不同抗体水平的PBMCS转录组测序与全基因组DNA甲基化调控研究第50-70页
  3.1 材料与方法第51-56页
    3.1.1 试验材料第51-52页
    3.1.2 试验方法第52-56页
  3.2 结果与分析第56-68页
    3.2.1 仔猪PRRSV抗体水平的变化第56页
    3.2.2 仔猪PRRSV高、低抗体水平间差异情况第56-57页
    3.2.3 总RNA的质检结果第57-58页
    3.2.4 仔猪PBMCs转录组分析第58-62页
    3.2.5 RT-qPCR验证转录组测序结果第62页
    3.2.6 DNA提取结果第62-63页
    3.2.7 PBMCs的DNA甲基化测序数据统计第63页
    3.2.8 全基因组DNA甲基化水平分析第63-67页
    3.2.9 差异甲基化区域相关差异基因的分析第67页
    3.2.10 差异甲基化差异表达分析第67-68页
  3.3 讨论第68-69页
    3.3.1 仔猪PRRSV抗体变化规律第68页
    3.3.2 仔猪不同抗体应答水平相关免疫基因差异表达第68页
    3.3.3 仔猪不同抗体应答水平相关差异甲基化调控基因第68-69页
  3.4 小结第69-70页
第四章 两代猪PRRSV免疫后PBMCS转录组对比分析第70-74页
  4.1 两代猪PRRSV免疫后PBMCs转录组测序结果同质性分析第70-72页
  4.2 两代猪PRRSV免疫后相同免疫相关基因的活体验证第72页
  4.3 讨论第72-73页
  4.4 小结第73-74页
第五章 总结第74-75页
  5.1 主要结论第74页
  5.2 创新点第74页
  5.3 下一步研究工作第74-75页
参考文献第75-84页
致谢第84-85页
附录第85-98页
作者简介第98-99页

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