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PEDV感染Vero细胞的蛋白质组学分析及诱导细胞自噬的机制研究

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PEDV感染Vero细胞的蛋白质组学分析及诱导细胞自噬的机制研究
论文目录
 
摘要第1-11页
Abstract第11-15页
缩略语表(Abbreviation)第15-18页
第1章 文献综述第18-41页
  1.1 猪流行性腹泻概述第18-26页
    1.1.1 PED的临床症状、致病机理及病理变化第18页
    1.1.2 PED流行病学特点第18页
    1.1.3 PED流行情况第18-20页
    1.1.4 PEDV病原学特征第20页
    1.1.5 PEDV基因结构第20-21页
    1.1.6 PEDV的基因功能研究进展第21-24页
    1.1.7 PED诊断第24-25页
    1.1.8 PED的疫苗研究及防控进展第25-26页
  1.2 单克隆抗体研究进展及应用第26-29页
    1.2.1 单克隆抗体概述第26-27页
    1.2.2 单克隆抗体在猪病中的研究进展及应用第27-28页
    1.2.3 单克隆抗体在PEDV中的研究进展及应用第28-29页
  1.3 蛋白质组学技术研究及其应用第29-32页
    1.3.1 蛋白质组学概述第29页
    1.3.2 蛋白质组学在病毒学研究中的应用第29-30页
    1.3.3 同位素标记相对与绝对定量(iTRAQ)技术第30-32页
  1.4 细胞自噬研究进展第32-40页
    1.4.1 细胞自噬概述第32页
    1.4.2 细胞自噬的分类第32-33页
    1.4.3 细胞自噬的分子机制第33-35页
    1.4.4 细胞自噬常用研究手段第35-37页
    1.4.5 细胞自噬与病毒感染第37-38页
    1.4.6 细胞自噬与炎症反应第38页
    1.4.7 细胞自噬与内质网应激第38-39页
    1.4.8 细胞自噬与细胞凋亡第39-40页
  1.5 立题依据第40-41页
第2章 PEDV单克隆抗体的制备及应用第41-60页
  2.1 研究目的及意义第41页
  2.2 试验材料第41-44页
    2.2.1 细胞、毒株、菌株第41页
    2.2.2 实验动物第41页
    2.2.3 载体与质粒第41页
    2.2.4 主要仪器与试剂第41-42页
    2.2.5 相关试剂及其配制第42-44页
  2.3 试验方法第44-52页
    2.3.1 重组蛋白的表达及纯化第44页
    2.3.2 单克隆抗体的制备流程第44-47页
    2.3.3 间接酶联免疫吸附试验(ELISA)筛选阳性克隆第47-48页
    2.3.4 阳性杂交瘤细胞的克隆(有限稀释法)第48-49页
    2.3.5 单克隆抗体的大量制备第49页
    2.3.6 单克隆抗体的间接免疫荧光(IFA)验证第49页
    2.3.7 SDS-PAGE和Western Blot检测第49-50页
    2.3.8 单克隆抗体的纯化第50-51页
    2.3.9 抗PEDV-S1D单克隆抗体特异性检测第51页
    2.3.10 单克隆抗体分型的鉴定第51页
    2.3.11 仔猪肠道免疫组织化学分析(SABC 染色法)第51-52页
    2.3.12 IFA快速检测方法的建立第52页
  2.4 结果与分析第52-58页
    2.4.1 PEDV S1D蛋白的纯化及鉴定第52-53页
    2.4.2 PEDV S1D单克隆抗体的制备及初步验证第53-54页
    2.4.3 单克隆抗体的纯化及特性分析第54-57页
    2.4.4 基于单克隆抗体的PEDV快速诊断方法的初步建立及应用第57-58页
  2.5 讨论第58-59页
  2.6 小结第59-60页
第3章 PEDV强弱毒株感染Vero细胞的蛋白质组学分析第60-94页
  3.1 研究目的及意义第60页
  3.2 试验材料第60-62页
    3.2.1 细胞、毒株第60页
    3.2.2 主要试剂与试剂盒第60-61页
    3.2.3 主要培养基及溶液的配制第61页
    3.2.4 主要缓冲液及相关试剂的配制第61页
    3.2.5 主要实验器材第61-62页
    3.2.6 分子生物学信息软件第62页
  3.3 试验方法第62-72页
    3.3.1 PEDV的增殖第62页
    3.3.2 病毒滴度测定第62-63页
    3.3.3 病毒RNA的提取及实时绝对荧光定量PCR第63-65页
    3.3.4 间接免疫荧光实验第65页
    3.3.5 用于蛋白质组学分析的细胞样品的制备第65-66页
    3.3.6 细胞总蛋白的提取及定量第66页
    3.3.7 FASP方法酶解第66-67页
    3.3.8 iTRAQ试剂标记第67页
    3.3.9 第一维高PH-RP液相分离第67-68页
    3.3.10 第二维反相液质联用RPLC-MS第68页
    3.3.11 生物信息学分析第68-70页
    3.3.12 细胞总RNA的提取及实时相对定量PCR第70-72页
    3.3.13 Western Blot试验第72页
    3.3.14 统计学分析第72页
  3.4 结果与分析第72-88页
    3.4.1 PEDV强弱毒株同源分析及在Vero细胞上增殖的动力学分析第72-75页
    3.4.2 蛋白质的鉴定第75-78页
    3.4.3 样品间重复性分析第78-79页
    3.4.4 蛋白质的定量及差异蛋白的筛选第79页
    3.4.5 差异蛋白的GO分类第79-81页
    3.4.6 差异蛋白的功能性特征分析第81-83页
    3.4.7 差异蛋白互作网络分析第83-86页
    3.4.8 差异蛋白的验证第86页
    3.4.9 PEDV感染导致翻译调控水平和炎症反应相关通路失调第86-88页
  3.5 讨论第88-93页
    3.5.1 宿主蛋白质的合成第88-89页
    3.5.2 细胞免疫反应第89-91页
    3.5.3 GTPase家族和细胞维持第91-92页
    3.5.4 其它差异蛋白第92-93页
  3.6 小结第93-94页
第4章 PEDV感染Vero细胞诱导细胞自噬的机制研究第94-113页
  4.1 研究目的及意义第94页
  4.2 试验材料第94-95页
    4.2.1 细胞、毒株、菌株第94页
    4.2.2 载体与质粒第94页
    4.2.3 抗体、siRNA及主要化学试剂第94-95页
    4.2.4 培养基与主要缓冲液的配制第95页
    4.2.5 主要实验仪器及设备第95页
  4.3 试验方法第95-100页
    4.3.1 PEDV增殖实验第95页
    4.3.2 细胞活力的测定(MTT法)第95页
    4.3.3 病毒感染第95-96页
    4.3.4 Western Blot试验第96页
    4.3.5 重组质粒无内毒素提取第96-97页
    4.3.6 质粒DNA浓度的测定第97页
    4.3.7 siRNA及质粒转染第97页
    4.3.8 间接免疫荧光试验与激光共聚焦显微镜观察第97-98页
    4.3.9 透射电镜第98页
    4.3.10 实时荧光定量PCR实验第98-99页
    4.3.11 统计学分析第99-100页
  4.4 结果与分析第100-110页
    4.4.1 自噬调节药物的细胞毒性分析第100页
    4.4.2 PEDV感染Vero细胞诱导自噬体的形成第100-102页
    4.4.3 PEDV感染Vero细胞上调自噬相关蛋白的表达第102-104页
    4.4.4 PEDV感染Vero细胞诱导自噬潮第104-106页
    4.4.5 抑制细胞自噬降低PEDV的增殖第106-107页
    4.4.6 降低自噬关键基因的表达抑制PEDV增殖第107-108页
    4.4.7 细胞自噬与PEDV介导炎症反应的关系第108-110页
  4.5 讨论第110-112页
  4.6 小结第112-113页
第5章 全文总结第113-114页
参考文献第114-138页
附表第138-168页
基本信息第168-170页
致谢第170-171页

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