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马铃薯低温糖化相关淀粉酶基因的功能鉴定及机制解析

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马铃薯低温糖化相关淀粉酶基因的功能鉴定及机制解析
论文目录
 
摘要第1-11页
Abstract第11-14页
缩略词表第14-15页
1 前言第15-26页
  1.1 马铃薯低温糖化概述第15页
  1.2 低温下块茎碳水化合物代谢响应第15-17页
  1.3 课题的提出第17-18页
  1.4 淀粉降解综述第18-24页
    1.4.1 淀粉结构第19页
    1.4.2 淀粉磷酸解途径相关基因研究第19-21页
      1.4.2.1 磷酸激酶第19-20页
      1.4.2.1 磷酸化酶第20-21页
    1.4.3 淀粉水解途径相关基因研究第21-24页
      1.4.3.1 α-淀粉酶第22-23页
      1.4.3.1 β-淀粉酶第23-24页
  1.5 本研究的目的及内容第24-26页
2 材料与方法第26-46页
  2.1 实验材料第26-28页
    2.1.1 植物材料第26页
    2.1.2 菌株及载体第26页
    2.1.3 引物第26-28页
  2.2 实验方法第28-46页
    2.2.1 生物信息学分析第28-29页
      2.2.1.1 马铃薯α-淀粉酶、β-淀粉酶家族成员的鉴定第28页
      2.2.1.2 不同物种α-淀粉酶和β-淀粉酶系统进化树构建第28页
      2.2.1.3 β-淀粉酶基因家族成员的基因结构分析及保守结构域比对第28-29页
      2.2.1.4 马铃薯淀粉酶基因家族成员染色体分布第29页
      2.2.1.5 马铃薯α-淀粉酶β-淀粉酶家族成员信号肽或转运肽的预测第29页
    2.2.2 DNA提取第29页
    2.2.3 RNA的提取第29-30页
    2.2.4 cDNA的制备第30页
    2.2.5 PCR及定量qRT-PCR第30-32页
    2.2.6 质粒提取、琼脂糖胶回收、质粒酶切及载体构建第32-35页
    2.2.7 基因枪瞬时转化洋葱表皮、烟草悬浮系及荧光观察第35页
    2.2.8 农杆菌电击转化第35页
    2.2.9 农杆菌介导的烟草瞬时表达及荧光观察第35-36页
    2.2.10 Western blot第36-37页
    2.2.11 农杆菌介导的马铃薯遗传转化第37-38页
    2.2.12 转基因阳性植株的筛选第38页
    2.2.13 马铃薯薯片油炸及色泽指数测定第38页
    2.2.14 马铃薯块茎及叶片生理生化指标测定第38-41页
      2.2.14.1 葡萄糖、果糖、蔗糖和淀粉含量的测定第38-39页
      2.2.14.2 可溶性淀粉含量的测定第39-40页
      2.2.14.3 淀粉酶活性的测定第40页
      2.2.14.4 叶片碘染第40-41页
    2.2.15 酵母转化第41页
    2.2.16 酵母双杂交(Y2H)互作验证第41-42页
    2.2.17 酵母杂交文库构建第42-43页
    2.2.18 酵母杂交文库筛选第43页
    2.2.19 双分子荧光互补(BiFC)实验第43-44页
    2.2.20 蛋白原核表达、纯化及活性测定第44-45页
    2.2.21 数据分析第45-46页
3 结果与分析第46-96页
  3.1 马铃薯中淀粉酶基因的鉴定第46页
  3.2 马铃薯淀粉酶基因染色体分布第46-47页
  3.3 不同物种α-淀粉酶系统进化树分析第47-50页
  3.4 不同物种β-淀粉酶系统进化树分析第50-51页
  3.5 马铃薯β-淀粉酶基因StBAMs结构分析第51-52页
  3.6 马铃薯β-淀粉酶StBAMs保守结构域分析第52-53页
  3.7 马铃薯淀粉酶基因在不同组织和不同温度贮藏块茎中的表达分析第53-55页
  3.8 StAmy23、StBAM1、StBAM9和StGBSS克隆及亚细胞定位第55-66页
    3.8.1 StAmy23、StBAM1、StBAM9和StGBSS基因的克隆第55-56页
    3.8.2 StBAM1和StBAM9在洋葱表皮和烟草悬浮系中的亚细胞定位第56-57页
    3.8.3 StAmy23、StBAM1和StBAM9在活体本氏烟草中的亚细胞定位第57-66页
      3.8.3.1 StAmy23、StBAM1和StBAM9信号肽或转运肽的预测第57页
      3.8.3.2 StAmy23、StBAM1和StBAM9在活体烟草中的亚细胞定位第57-63页
      3.8.3.3 StBAM1、StBAM9和StGBSS叶绿体转运肽和截去转运肽后的蛋白在活体本氏烟草中的亚细胞定位第63-66页
  3.9 StAmy23、StBAM1及StBAM9在马铃薯叶片淀粉降解及块茎低温糖化过程中的功能第66-83页
    3.9.1 干涉载体的构建第66-68页
    3.9.2 转基因株系的获得及筛选第68-69页
      3.9.2.1 转基因株系的获得第68-69页
      3.9.2.2 转基因株系的筛选第69页
    3.9.3 转基因株系田间表型鉴定第69-72页
    3.9.4 转基因株系叶片淀粉含量第72-74页
    3.9.5 转基因块茎贮藏过程中目的基因及家族其它成员表达分析第74-77页
    3.9.6 转基因块茎贮藏过程中糖含量测定及油炸加工品质分析第77-80页
    3.9.7 转基因块茎贮藏过程中淀粉酶活性及淀粉含量测定第80-83页
  3.10 StAmy23、StBAM1和StBAM9作用机制解析第83-96页
    3.10.1 StAmy23、StBAM1和StBAM9与淀粉代谢相关蛋白的互作关系第83-86页
    3.10.2 StBAM1、StBAM9和StLSF2蛋白表达、纯化及体外活性测定第86-87页
    3.10.3 饵蛋白StBAM9进行酵母文库的筛选第87-96页
      3.10.3.1 马铃薯抗感低温糖化基因型混合块茎酵母双杂交文库构建第87-90页
      3.10.3.2 以StBAM9为饵蛋白进行酵母文库的筛选第90-94页
      3.10.3.3 潜在互作蛋白StBAM1与StBAM9互作确认第94-96页
4 讨论第96-103页
  4.1 α-淀粉酶和β-淀粉酶的生物信息学分析第96页
  4.2 StAmy23、StBAM1和StBAM9的亚细胞定位第96-97页
  4.3 StAmy23在马铃薯叶片淀粉降解及块茎低温糖化中的功能第97-98页
  4.4 StBAM1在马铃薯叶片淀粉降解及块茎低温糖化中的功能第98页
  4.5 StBAM9在马铃薯叶片淀粉降解及块茎低温糖化中的功能第98-99页
  4.6 马铃薯低温糖化可能由多个淀粉降解相关酶类共同调节第99-100页
  4.7 StBAM9在淀粉降解过程中的作用机制第100-101页
  4.8 未来研究展望第101-103页
参考文献第103-114页
附录A 酵母文库构建期间所用试剂信息第114-115页
附录B 马铃薯StBAMs、大豆GmBMY1和拟南芥AtBAMs保守结构域比对第115-116页
附录C StAmy23、StBAM1、StBAM9和StGBSS基因CDS序列和氨基酸序列第116-120页
附录D 博士期间发表或参与发表的文章第120-121页
致谢第121-123页

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