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XY和YY黄颡鱼精巢转录组分析以及rbmx基因在鱼类性腺发育中的功能研究

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XY和YY黄颡鱼精巢转录组分析以及rbmx基因在鱼类性腺发育中的功能研究
论文目录
 
摘要第1-8页
Abstract第8-10页
缩略语表第10-11页
第一章 前言第11-27页
  1. 转录组概述第11-13页
  1.1 转录组在鱼类性别分化及性腺发育中的研究概况第11-12页
  1.2 转录组研究方法概述第12-13页
  2. 超雄鱼类研究进展第13-14页
  3. RNA结合蛋白概述第14-24页
  3.1 RNA结合蛋白的结构与作用机制第14-17页
  3.2 RNA结合蛋白在性别决定及性腺发育过程中的功能第17-19页
  3.3 RNA结合蛋白的研究方法第19-21页
  3.4 RNA Binding Mofit families(RBM)家族研究进展第21-24页
  4. 实验动物研究背景第24-26页
  4.1 黄颡鱼第24-25页
  4.2 斑马鱼第25-26页
  5. 研究目的和意义第26-27页
第二章 黄颡鱼XY, YY精巢转录组分析第27-52页
  1. 实验材料第27-28页
  1.1 实验动物第27页
  1.2 所用载体第27-28页
  2. 实验方法第28-36页
  2.1 黄颡鱼基因组DNA提取第28页
  2.2 黄颡鱼性别鉴定第28页
  2.3 RNA抽提第28-29页
  2.4 Illumina RNA文库构建及测序第29-30页
  2.5 Illumina测序结果拼接及注释第30-31页
  2.6 差异mRNA表达分析第31页
  2.7 差异mRNA富集分析第31-32页
  2.8 RNA反转录第32页
  2.9 荧光定量PCR第32-34页
  2.10 miRNA靶基因验证质粒构建第34-35页
  2.11 双荧光素酶系统验证第35-36页
  3. 结果第36-50页
  3.1 RNA质量检测第36页
  3.2 RNA高通量测序数据总览第36-37页
  3.3 de novo拼接及功能注释第37-39页
  3.4 Unigene表达丰度分析第39-41页
  3.5 差异表达Unigene统计第41-42页
  3.6 差异表达Unigene GO富集分析第42-43页
  3.7 差异表达Unigene KEGG富集分析第43-46页
  3.8 荧光定量PCR验证结果第46-47页
  3.9 miR-141/429 靶基因预测及双荧光素酶报告系统检测第47-49页
  3.10 miR141/429 及其潜在靶基因rbmx在XY、YY精巢中的表达第49-50页
  4. 讨论第50-52页
第三章 rbmx基因在鱼类性腺发育过程中的功能研究第52-92页
  1. 实验材料第52-53页
  1.1 实验动物第52-53页
  1.2 所用载体第53页
  2. 实验方法第53-68页
  2.1 rbmx基因生物信息学分析第53-54页
  2.2 rbmx基因表达分析第54-59页
  2.3 斑马鱼rbmx基因CRISPR/Cas9敲除系统构建第59-62页
  2.4 显微注射第62-63页
  2.5 斑马鱼敲除靶位点有效性验证第63-66页
  2.6 斑马鱼F0代突变体筛选第66页
  2.7 斑马鱼F1代突变体筛选第66-67页
  2.8 斑马鱼F2纯合突变体筛选第67页
  2.9 斑马鱼F2代个体性别比例分析第67页
  2.10 斑马鱼rbmx~(-/-)精子活力分析第67-68页
  3. 结果第68-89页
  3.1 rbmx基因生物信息学分析第68-74页
  3.2 rbmx基因时空表达分析第74-76页
  3.3 斑马鱼rbmx CRISPR/Cas9系统构建第76-80页
  3.4 斑马鱼rbmx靶位点有效性验证及突变效率分析第80-81页
  3.5 rbmx F0代突变体筛选第81-83页
  3.6 rbmx F1代突变体筛选第83-84页
  3.7 rbmx F2代突变体筛选第84-86页
  3.8 rbmx F2代个体性别比例统计第86-87页
  3.9 rbmx~(-/-)突变体精子活力分析第87-89页
  4. 讨论第89-92页
参考文献第92-115页
附录第115-118页
附录1 实验所需仪器第115-116页
附录2 实验所需试剂第116-117页
附录3 发表论文第117-118页
致谢第118-119页

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