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基于SILAC技术的PRRSV感染Marc-145细胞分泌蛋白质组学研究

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基于SILAC技术的PRRSV感染Marc-145细胞分泌蛋白质组学研究
论文目录
 
摘要第1-8页
Abstract第8-11页
缩略语表(Abbreviation)第11-14页
第1章 文献综述第14-35页
  1.1 分泌蛋白质组学的研究进展第14-27页
    1.1.1 分泌蛋白质组学的定义和意义第14-15页
    1.1.2 分泌蛋白的合成与转运第15-18页
    1.1.3 分泌蛋白质组学研究的技术和方法第18-22页
    1.1.4 稳定同位素标记氨基酸技术(SILAC)第22-23页
    1.1.5 分泌蛋白质组学的研究进展第23-25页
    1.1.6 分泌蛋白质组学在病毒学中的应用第25-27页
  1.2 猪繁殖与呼吸综合征第27-31页
    1.2.1 PRRSV第27-29页
    1.2.2 PRRSV与炎症反应第29-31页
  1.3 PRDX蛋白家族第31-35页
    1.3.1 胞内PRDX蛋白家族的功能第31-32页
    1.3.2 胞外PRDX蛋白家族的功能第32-35页
第2章 研究目的与意义第35-36页
第3章 材料与方法第36-63页
  3.1 试验材料第36-43页
    3.1.1 细胞、毒株与菌株第36页
    3.1.2 载体与质粒第36-37页
    3.1.3 工具酶、siRNA及主要试剂第37-38页
    3.1.4 SILAC样品准备材料和试剂第38-39页
    3.1.5 Western blot所需材料第39页
    3.1.6 培养基与抗生素及其配制第39-40页
    3.1.7 主要缓冲液与相关试剂及其配制第40-43页
    3.1.8 主要实验仪器及设备第43页
  3.2 试验方法第43-63页
    3.2.1 原代PAM细胞的分离第43页
    3.2.2 PRRSV的增殖第43-44页
    3.2.3 病毒滴度的测定第44页
    3.2.4 MTT法检测细胞活性和LDH释放实验第44-45页
    3.2.5 稳定同位素标记及分泌蛋白质样本收集样品制备第45-46页
    3.2.6 全细胞蛋白浓度的测定第46-47页
    3.2.7 LC-MS/MS鉴定第47-49页
    3.2.8 生物信息学分析第49-50页
    3.2.9 统计学方法第50-51页
    3.2.10 siRNA及质粒转染(脂质体介导的瞬时转染法)第51页
    3.2.11 Western blot样品制备第51页
    3.2.12 Western blot检测分析第51-52页
    3.2.13 双荧光素酶检测实验第52页
    3.2.14 间接免疫荧光实验第52-53页
    3.2.15 RNA的提取及mRNA水平定量检测第53-55页
    3.2.16 目的蛋白的原核表达和纯化第55-61页
    3.2.17 显色基质鲎试剂盒检测蛋白内毒素第61-62页
    3.2.18 分子生物学信息软件第62-63页
第4章 结果与分析第63-91页
  4.1 PRRSV感染Marc-145细胞分泌蛋白组分析第63-74页
4.1.1PRRSV感染Marc-145细胞动力学分析第63-65页
    4.1.2 基于SILAC技术的分泌蛋白组学实验流程第65页
    4.1.3 分泌蛋白鉴定的基本信息第65-67页
    4.1.4 蛋白质的定量信息及差异蛋白的筛选第67-69页
    4.1.5 分泌蛋白质组的生物信息学分析第69-73页
    4.1.6 差异蛋白的验证第73-74页
  4.2 PRDX3能促进炎症因子的产生第74-81页
    4.2.1 猪源PRDX3的原核表达第74-75页
    4.2.2 PRDX3本身在胞外具有致炎活性第75-78页
    4.2.3 TLR4参与PRDX3诱导的炎症反应第78-81页
  4.3 PRDX3参与PRRSV诱导的NF-κB的激活和炎症因子产生第81-89页
    4.3.1 PRRSV感染Marc-145细胞对PRDX3表达的影响第81-82页
    4.3.2 PRRSV感染Marc-145细胞对PRDX3定位的影响第82页
    4.3.3 猴源PRDX3的原核表达第82-85页
    4.3.4 胞外的PRDX3对PRRSV的增殖无明显影响第85-86页
    4.3.5 胞外PRDX3增强PRRSV诱导的p65磷酸化和炎症因子产生第86-87页
    4.3.6 干扰胞内PRDX3基因促进PRRSV诱导的炎症因子产生第87-89页
  4.4 PRRSV感染Marc-145细胞对PRDX蛋白家族表达的影响第89-91页
第5章 讨论与结论第91-103页
  5.1 讨论第91-101页
    5.1.1 分泌蛋白样品制备条件的优化第91-92页
    5.1.2 PRRSV感染Marc-145细胞分泌蛋白的途径第92-95页
    5.1.3 差异蛋白的生物学功能第95-99页
    5.1.4 PRDX3对PRRSV诱导炎症反应的影响第99-101页
  5.2 结论第101-103页
参考文献第103-124页
致谢第124-125页
附表第125-133页
附录第133-134页

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