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陆地棉遗传图谱的构建及其重要农艺性状的QTL定位

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陆地棉遗传图谱的构建及其重要农艺性状的QTL定位
论文目录
 
摘要第1-11页
Abstract第11-16页
第一章 文献综述第16-36页
  · 棉花发展现状第16-17页
  · 遗传标记技术第17-19页
    · 遗传标记的发展第17页
    · DNA分子标记第17页
    · 主要DNA分子标记的简介及其特点第17-19页
      · 基于分子杂交技术的分子标记第17-18页
      · 基于PCR技术的分子标记第18-19页
      · 基于测序技术的分子标记第19页
  · 高通量测序技术第19-22页
    · 高通量测序技术的发展第19-20页
    · 基于高通量测序技术开发分子标记第20-22页
      · 基于全基因组重测序开发分子标记第21页
      · 基于简化基因组测序开发分子标记第21-22页
      · 基于转录组测序开发分子标记第22页
  · 棉花遗传连锁图谱的构建第22-28页
    · 作图群体第23-24页
      · 初级作图群体第23页
      · 次级作图群体第23-24页
      · 自然群体第24页
    · 棉花遗传连锁图谱的研究进展第24-28页
      · 海岛棉和陆地棉种间群体遗传连锁图谱研究进展第24-26页
      · 陆地棉种内群体遗传连锁图谱研究进展第26-28页
  · QTL定位第28-35页
    · QTL定位原理和方法第28页
    · 棉花QTL定位研究进展第28-35页
      · 棉花产量QTL定位研究第28-30页
      · 棉花纤维品质 QTL 定位第30-33页
      · 棉花抗病QTL定位第33-34页
      · 棉花形态学、生理性状QTL定位第34-35页
  · 本研究目的和意义第35-36页
第二章 利用 RAD-seq 技术基于双亲本开发分子标记用于陆地棉 F_2 群体遗传图谱的加密第36-76页
  · 前言第36-37页
  · 材料和方法第37-43页
    · 实验材料和 DNA 提取第37页
    · 构建RAD文库及高通量测序第37-38页
    · 序列过滤及组装第38页
    · 序列注释第38页
    · SSR、InDel和SNP引物的开发第38-40页
    · 去除冗余的SSRs第40页
    · 基于两个材料之间去除冗余及引物的合成第40-41页
    · 海陆种间遗传图谱上挑选引物第41页
    · PCR扩增及基因型分析及记录方法第41-42页
    · 偏分离标记检测第42页
    · 遗传图谱构建及QTL定位第42-43页
  · 结果与分析第43-69页
    · DH962 和冀棉5号RAD-seq测序结果分析第43-45页
    · 陆地棉序列集Gh-D-J的GO分析第45-46页
    · SSR 标记的开发及其特点第46-49页
    · In Del标记的开发及其特点第49-50页
    · SNP标记的开发及其特点第50-51页
    · 包含引物的contigs进行in silico mapping第51-53页
    · 基于 RAD 开发标记在陆地棉种内的多态性分析第53页
    · 基于RAD开发标记在陆地棉和海岛棉种间的多态性分析第53页
    · 从海陆种间图谱上挑选的引物多态性情况第53-54页
    · 标记偏分离情况统计第54页
    · 陆地棉遗传图谱的构建第54-56页
    · 陆地棉F2 群体产量和纤维品质的QTL定位第56页
    · 陆地棉和亚洲棉、雷蒙德氏棉比较基因组学研究第56-69页
  · 讨论第69-76页
    · RAD-seq测序结果分析第69-70页
    · 陆地棉序列的功能分析第70-71页
    · RAD开发引物序列的在基因组上的分布第71页
    · 基因组SSR的分析第71-72页
    · RAD-seq开发SNP的效率第72页
    · RAD-seq开发引物的验证第72-73页
    · 海陆种间遗传图谱上挑选的引物在陆地棉种内的多态性分析第73页
    · 遗传图谱分析第73-74页
    · 遗传图谱密度对检测QTL的效率的分析第74页
    · 陆地棉和亚洲棉、雷蒙德氏棉基因组的同源性分析第74-76页
第三章 陆地棉重组自交系群体遗传图谱的构建及产量和纤维品质相关性状的 QTL 定位第76-124页
  · 前言第76页
  · 材料和方法第76-79页
    · 实验材料和基因组DNA提取第76-77页
    · 田间种植和群体性状调查第77页
    · 引物的挑选、PCR扩增和基因型分析第77页
    · 偏分离标记检测第77-78页
    · 遗传图谱构建第78页
    · 性状正态检验、广义遗传率计算、相关分析及QTL定位第78页
    · 共区间QTL的整合分析第78-79页
  · 结果与分析第79-117页
    · 遗传图谱的构建第79-81页
    · 偏分离情况统计第81页
    · 两亲本以及群体间的性状统计描述第81-91页
    · 产量和纤维品质性状方差分析第91-92页
    · 产量和纤维品质相关性状的广义遗传率第92-93页
    · 产量和纤维品质的遗传相关性分析第93页
    · 棉花产量和纤维品质相关性状的QTL定位第93-96页
      · 纤维品质相关性状的QTL定位第94-95页
      · 产量相关性状的QTL定位第95-96页
    · QTL共聚现象第96-117页
  · 讨论第117-124页
    · 标记偏分离情况分析第117-118页
    · QTL共聚现象的分析第118页
    · 不同研究间共同QTL的分析第118-120页
    · 棉花QTL定位研究中的难点第120-124页
参考文献第124-144页
研究生期间发表论文情况第144-145页
致谢第145-147页

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