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蝙蝠的特异性状、食性转变及视觉功能的分子进化研究
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蝙蝠的特异性状、食性转变及视觉功能的分子进化研究
论文目录
 
摘要第1-11页
Abstract第11-14页
第一章 绪论第14-25页
第一节 翼手目及其分类第14-15页
第二节 蝙蝠的特异性状第15-19页
　　　　1.2.1 回声定位和飞行第15-17页
　　　　1.2.2 免疫和长寿第17-19页
第三节 蝙蝠的食性第19-22页
　　　　1.3.1 蝙蝠的食性特点第19页
　　　　1.3.2 蝙蝠食性的研究进展第19-22页
第四节 蝙蝠的视觉系统及其研究进展第22-25页
　　　　1.4.1 哺乳动物的视觉系统简介第22页
　　　　1.4.2 蝙蝠视觉系统及其研究进展第22-25页
第二章 比较转录组学探讨翼手目的系统发育第25-36页
第一节 研究背景第25-27页
第二节 材料与方法第27-31页
　　　　2.2.1 样品与测序第27-28页
　　　　2.2.2 序列处理和组装第28-29页
　　　　2.2.3 直系同源基因的鉴定和序列比对第29-30页
　　　　2.2.4 系统发育树的构建第30-31页
第三节 实验结果第31-33页
　　　　2.3.1 核苷酸串联构建的系统发育树第31-32页
　　　　2.3.2 基因的异质性分析第32页
　　　　2.3.3 基于联合方法构建的系统发育树第32-33页
第四节 讨论第33-36页
第三章 比较转录组学揭示蝙蝠特异性状的起源第36-52页
第一节 研究背景第36-38页
第二节 材料与方法第38-42页
　　　　3.2.1 样品、测序与序列组装第38-40页
　　　　3.2.2 直系同源基因的鉴定和比对第40页
　　　　3.2.3 受选择基因的筛选第40-41页
　　　　3.2.4 受选择基因的GO富集分析第41页
　　　　3.2.5 受选择基因的通路富集分析第41-42页
　　　　3.2.6 蝙蝠特异氨基酸位点的鉴定第42页
第三节 研究结果第42-48页
　　　　3.3.1 样品信息和直系同源基因的鉴定第42-43页
　　　　3.3.2 受选择基因的筛选第43-44页
　　　　3.3.3 受选择基因的GO富集分析第44-47页
　　　　3.3.4 受选择基因的通路富集分析第47页
　　　　3.3.5 蝙蝠特异的氨基酸位点第47-48页
第四节 讨论第48-52页
第四章 基于转录组研究蝙蝠的食性转变第52-66页
第一节 研究背景第52-53页
第二节 材料与方法第53-56页
　　　　4.2.1 旧大陆果蝠食性转变的适应性分析第53-54页
　　　　4.2.2 不同食性蝙蝠肝脏组织的表达谱分析第54-56页
第三节 研究结果第56-64页
　　　　4.3.1 在旧大陆果蝠祖先枝筛选到的受选择基因第56-57页
　　　　4.3.2 受选择基因的GO富集分析第57页
　　　　4.3.3 受选择基因的通路富集分析第57-58页
　　　　4.3.4 旧大陆果蝠特异的氨基酸位点第58-59页
　　　　4.3.5 蝙蝠肝脏组织的表达谱第59-60页
　　　　4.3.6 蝙蝠肝脏组织普遍高表达基因第60-62页
　　　　4.3.7 食果蝙蝠肝脏组织表达量显著上调的基因第62-64页
第四节 讨论第64-66页
　　　　4.4.1 比较转录组学揭示旧大陆果蝠的食性转变 514.4.2 蝙蝠肝脏组织的普遍高表达基因第64-65页
　　　　4.4.2 蝙蝠肝脏组织的普遍高表达基因第65页
　　　　4.4.3 不同食性蝙蝠肝脏组织的表达谱差异第65-66页
第五章 视觉基因SWS1在新大陆蝙蝠中的分子进化第66-94页
第一节 研究背景第66-68页
第二节 材料与方法第68-79页
　　　　5.2.1 研究材料第68-71页
　　　　5.2.2 基因组DNA的提取、PCR扩增、克隆及测序第71-76页
　　　　5.2.3 序列比对和系统发育树重建第76页
　　　　5.2.4 关键光谱位点分析第76-77页
　　　　5.2.5 祖先序列重建和进化分析第77-78页
　　　　5.2.6 SWS1基因假基因化的时间估算第78-79页
第三节 研究结果第79-91页
　　　　5.3.1 SWS1在新大陆蝙蝠中的保守性第79-84页
　　　　5.3.2 SWS1基因在新大陆恒频蝙蝠中的假基因化第84-87页
　　　　5.3.3 SWS1基因在吸血蝙蝠中的假基因化第87-90页
　　　　5.3.4 新大陆蝙蝠中SWS1基因的假基因化时间推断第90-91页
第四节 讨论第91-94页
参考文献第94-117页
攻读博士期间的科研成果第117-118页
致谢第118页

本篇论文共118页，点击这进入下载页面。
 
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