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苏云金芽胞杆菌S-层蛋白形成内涵体的研究

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苏云金芽胞杆菌S-层蛋白形成内涵体的研究
论文目录
 
目录第1-8 页
中文摘要第8-9 页
ABSTRACT第9-10 页
缩略语第10-11 页
1.文献综述第11-36 页
  · 细菌S-层及其一般性质第12-15 页
  · 细菌S-层的多样性第15-21 页
    · S-层结构的多样性第15-18 页
      · S-层在不同细菌种属中存在的多样性第15 页
      · 不同的S-层致使表达形成不同的菌落形态第15 页
      · S-层结构装配的多样性第15-17 页
      · 组成S-层晶格的结构多样性第17 页
      · S-层结构装配的牢固性存在多样性第17-18 页
    · S-层蛋白的多样性第18-20 页
      · S-层蛋白的大小呈现多样性第18 页
      · 组成S-层的基本蛋白单元的多样性第18 页
      · 形成S-层晶体的蛋白质结构单元同源性的多样性第18 页
      · S-层蛋白结构域的多样性第18-19 页
      · S-层蛋白转译后修饰的多样性第19 页
      · S-层蛋白作为抗原的多态性第19-20 页
    · S-层蛋白基因的多样性第20-21 页
      · 编码S-层蛋白的基因多样性第20 页
      · S-层基因的结构多样性第20 页
      · S-层基因的启动子结构的多样性第20-21 页
    · 细菌S-层的功能多样性第21 页
  · 细菌S-层的应用第21-28 页
    · 细菌S-层的应用概述第21-23 页
    · 细菌S-层的应用基础第23-26 页
      · S-层蛋白的自装配第23 页
      · S-层蛋白与次细胞壁多聚体(SCWP)的相互作用第23-26 页
    · 细菌S-层的应用实例第26-28 页
      · S-层融合蛋白和其应用第26-28 页
      · S-层蛋白在微米和纳米材料上的应用第28 页
  · 蜡状芽胞杆菌群的S-层第28-32 页
    · 蜡状芽胞杆菌群简介第28-31 页
    · 蜡状芽胞杆菌群的S-层第31-32 页
  · 细菌S-层研究方法综述第32-34 页
    · 细菌S-层观测研究方法第32-33 页
    · 细菌S-层基因在外源宿主中的表达第33 页
    · 细菌S-层蛋白结构与功能的研究第33-34 页
  · 本文的研究背景及研究意义第34-36 页
    · 苏云金芽胞杆菌CTC菌株产生的伴胞晶体及其产生的条件第34 页
    · 苏云金芽胞杆菌CTC菌株的S-层蛋白可以形成伴胞晶体第34 页
    · 苏云金芽胞杆菌CTC菌株细胞表面的S-层结构第34-35 页
    · 苏云金芽胞杆菌中S-层基因的普查第35 页
    · 苏云金芽胞杆菌CTC菌株的分类鉴定第35 页
    · 本文的研究目的和意义第35-36 页
2.材料与方法第36-54 页
  · 菌株第36-37 页
  · 质粒第37 页
  · 引物第37-38 页
  · 培养基和实验试剂第38-40 页
    · 培养基和普通实验试剂第38-39 页
    · 生化试剂及免疫试剂第39-40 页
  · 生物测定供试昆虫和靶细胞第40 页
  · DNA测序公司第40 页
  · 仪器第40 页
  · 各种溶液及配方第40-41 页
  · 实验方法第41-54 页
    · 微生物培养条件及菌种保藏第41 页
    · 碱裂解法抽提大肠杆菌质粒DNA第41 页
    · 大肠杆菌质粒DNA的少量快速提取及检测第41-42 页
    · 苏云金芽胞杆菌总DNA抽提第42 页
    · DNA片段的回收第42-43 页
    · DNA的纯化第43 页
    · 载体的去磷酸化第43 页
    · DNA的连接第43 页
    · 大肠杆菌感受态的制备(CaCl_2法)及转化第43-44 页
    · 苏云金芽胞杆菌的电穿孔第44 页
    · DNA的琼脂糖凝胶电泳第44-45 页
    · IPTG诱导大肠杆菌中重组基因的表达第45 页
    · PCR技术第45 页
    · AT克隆第45-46 页
    · 苏云金芽胞杆菌RNA的抽提第46 页
    · RNA电泳(甲醛凝胶电泳)第46-47 页
    · RNA的定量以及质量检测第47 页
    · RT-PCR第47 页
    · SDS-PAGE和蛋白质的银染第47-48 页
    · Western blot第48-49 页
    · 抗血清的制备第49-50 页
    · 免疫双扩散定性检测抗体效价第50 页
    · ELISA定量检测抗体效价第50-51 页
    · 蛋白质测序第51 页
    · 蛋白质组学双向电泳分离技术第51-53 页
    · 对棉铃虫毒力的生物测定和细胞毒性试验第53 页
    · 分子生物学操作软件及基本生物信息学分析方法第53-54 页
3.结果与分析第54-91 页
  · 与苏云金芽胞杆菌相关的生物信息学分析第54-61 页
    · ctc_1和ctc_2基因密码子组成分析第54 页
    · ctc_1和ctc_2基因内部重复序列分析第54-55 页
    · ctc_1、ctc_2全基因重复序列分析第55 页
    · ctc_1和ctc_2基因上游启动子分析第55-56 页
    · ctc_1和ctc_2基因下游终止子分析第56 页
    · ctc_1基因的上游基因分析第56-57 页
    · ctc_1和ctc_2基因全长比对结果第57 页
    · CTC_1和CTC_2蛋白全长比对结果第57 页
    · CTC_1蛋白N段和CTC_2蛋白N段比对结果第57-58 页
    · CTC_1蛋白C段和CTC_2蛋白C段比对结果第58 页
    · CTC_1蛋白C段和CTC_2蛋白C段基因序列比对结果第58 页
    · CTC_1和CTC_2蛋白保守结构域SLH分析第58 页
    · S-层蛋白的信号肽预测第58-59 页
    · CTC_1蛋白和SAP蛋白比对结果第59 页
    · CTC_2蛋白和EA1蛋白比对结果第59 页
    · CTC_1-C和CTC_2-C末端多肽潜在的抗原决定簇分析第59-60 页
    · 小结第60-61 页
  · 苏云金芽胞杆菌一类新的内涵体蛋白第61-74 页
    · CTC菌株在不同pH环境下的生长曲线第61 页
    · CTC菌株表面S-层的研究第61-63 页
      · CTC菌株表面S-层的电镜观察第61-62 页
      · CTC菌株表面S-层的冰冻蚀刻第62 页
      · SDS-PAGE检测CTC菌株表面S-层第62 页
      · CTC菌株表面S-层的初抽提第62-63 页
      · CTC菌株表面S-层蛋白测序结果第63 页
    · UTC菌株芽胞期内涵体的研究第63-66 页
      · CTC菌株芽胞期内涵体的电镜观察第64 页
      · CTC菌株芽胞期内涵体的初抽提第64-65 页
      · CTC菌株芽胞期内涵体蛋白测序结果第65-66 页
      · CTC菌株芽胞期内涵体的表面结构第66 页
    · Bt.菌株中类CTC菌株的普查第66-73 页
      · CTC_1和CTC_2蛋白C末端特异性抗血清的制备第66-69 页
      · 62个Bt.菌株内涵体的SDS-PAGE和Western blot分析第69 页
      · 62个Bt.菌株的PCR分析第69-71 页
      · 阳性菌株的基因克隆、测序和序列比对分析第71 页
      · 阳性菌株H20ac、T68、H61的基本生物学性状第71-73 页
    · 内涵体蛋白对棉铃虫的毒力和细胞毒性第73 页
    · 小 结第73-74 页
  · 苏云金芽胞杆菌的S-层形成内涵体与低氧条件有关第74-80 页
    · CTC菌株在不同培养条件下的生长状态第74-76 页
      · 在常规摇床中的发酵比较研究第74 页
      · 在固体平皿中的生长比较第74-75 页
      · 在发酵罐中的分批发酵比较研究第75-76 页
    · 不同通气条件下S-层形成内涵体的Western blot证据第76-77 页
    · 不同通气条件下S-层形成内涵体的RT-PCR证据第77-78 页
    · 在低氧条件下S-层形成内涵体的质谱证据第78 页
    · 低氧条件下其它菌株的S-层蛋白形成内涵体第78-79 页
    · 小结第79-80 页
  · 苏云金芽胞杆菌中S-层功能的初步探索第80-90 页
    · CTC菌株中S-层基因的突变结果第80-87 页
      · S-层基因突变菌株的中间载体的构建第80-82 页
      · 苏云金芽胞杆菌野生菌株的电转化条件第82-83 页
      · 突变前的中间转化子BMB0549~*的获得第83 页
      · 突变前的中间转化子BMB0549~*的PCR验证第83-84 页
      · 通过双交换缺失CTC菌株的S-层基因示意图第84-85 页
      · ctc_1和ctc_2基因突变菌株的筛选结果第85 页
      · S-层基因突变菌株的验证第85-87 页
    · CTC菌株S-层缺失株耐碱性实验结果第87-88 页
    · 通过蛋白质组学的方法研究S-层的功能第88-89 页
      · 样品蛋白质浓度测定第88 页
      · 突变株和野生株总蛋白的双向电泳第88-89 页
    · 小结第89-90 页
  · 本文主要结果总结第90-91 页
4 讨论第91-93 页
参考文献第93-101 页
致谢第101-102 页
附录第102-111 页
攻博期间的成果第111 页

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