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棉花茎秆无腺体基因gl1的精细定位及棉酚腺体发育相关基因筛选
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棉花茎秆无腺体基因gl1的精细定位及棉酚腺体发育相关基因筛选
论文目录
 
摘要第1-10页
Abstract第10-12页
缩略语表第12-13页
1 文献综述第13-31页
　　· 棉花棉酚腺体与棉酚性状第13-15页
　　　　· 棉花棉酚腺体及其类型第13-14页
　　　　· 棉酚的特性及其对棉花的影响第14页
　　　　· 棉酚腺体与棉酚的关系第14-15页
　　　　· 棉酚腺体研究的重要性第15页
　　· 棉酚腺体控制基因的遗传研究第15-17页
　　　　· 棉酚腺体的主要控制基因第15-16页
　　　　· 棉酚腺体的其他控制基因第16-17页
　　· 棉酚腺体控制基因的定位研究第17-18页
　　· 棉酚生物合成途径及相关基因的研究第18-22页
　　　　· 棉酚的生物合成途径第18-19页
　　　　· 棉酚生物合成途径中关键酶及其研究进展第19-22页
　　· 国内外低酚棉育种的研究进展第22-25页
　　· 基因精细定位与图位克隆技术第25-28页
　　　　· 作图群体的构建第25-26页
　　　　· 分子标记第26-28页
　　　　· 图位克隆技术与功能验证第28页
　　· 转录组测序及基因发掘第28-30页
　　　　· 转录组测序的方法和步骤第29-30页
　　　　· 转录组测序的基因挖掘第30页
　　· 研究目的与意义第30-31页
2 材料与方法第31-50页
　　· 实验材料第31页
　　· 群体构建第31-32页
　　· 田间调查及样品的采集第32页
　　· 棉花基因组DNA的提取第32-34页
　　· 染色体特异分子标记开发第34-36页
　　　　· 染色体序列信息第34-35页
　　　　· SSR检测及引物设计第35页
　　　　· 染色体特异的SSR开发第35-36页
　　　　· 同源染色体chr07和chr16的确定第36页
　　· SSR标记分析第36-38页
　　　　· PCR反应体系及程序第36-37页
　　　　· 聚丙烯酰胺凝胶电泳第37-38页
　　　　· 聚丙烯酰胺凝胶银染检测第38页
　　· 基因定位第38-40页
　　　　· 表型和基因型数据记录第38页
　　　　· 多态性引物筛选及其连锁测验第38-39页
　　　　· 遗传连锁图谱的构建第39页
　　　　· 基因精细定位第39-40页
　　· 定位区间候选基因分析第40页
　　· 候选基因的扩增第40-43页
　　　　· RNA提取第40-41页
　　　　· cDNA反转录第41-42页
　　　　· 候选基因的扩增第42页
　　　　· 扩增产物的纯化第42-43页
　　· 候选基因的克隆第43-48页
　　　　· 候选基因连接到T载体第43-44页
　　　　· TA克隆转化大肠杆菌第44-46页
　　　　· 菌液PCR检测、酶切检测与测序第46-48页
　　· 候选基因的表达量分析第48页
　　· 病毒诱导的基因沉默（VIGS）载体构建第48-49页
　　· 转录组测序与分析第49-50页
　　　　· 实验材料及测序第49-50页
　　　　· 转录组数据分析第50页
3 结果与分析第50-82页
　　· 棉花茎秆无腺体性状的遗传分析第50-51页
　　· 棉花染色体特异SSR标记的开发第51-64页
　　　　· SSR在各染色体上的分布特征第52-54页
　　　　· SSR类型的分布第54-58页
　　　　· 染色体特异SSR分子标记的开发第58-60页
　　　　· SSR染色体特异性在四倍体棉花中的验证第60-64页
　　· 棉花茎秆无腺体基因gl_1的定位第64-72页
　　　　· SSR标记的多态性验证及连锁分析第64页
　　　　· 基因的初步定位第64-65页
　　　　· 精细定位第65-68页
　　　　· 候选区间基因预测与序列分析第68-69页
　　　　· 候选基因的表达分析第69-70页
　　　　· 候选基因的比较测序第70-71页
　　　　· 候选基因VIGS载体的构建第71-72页
　　· 棉花棉酚腺体发育相关基因的筛选与分析第72-82页
　　　　· 转录组测序及质量分析第72-73页
　　　　· 棉酚腺体相关表达差异基因的鉴定第73-78页
　　　　· 棉酚腺体相关选择性剪接差异基因的鉴定第78-82页
4 讨论第82-89页
　　· 两个二倍体基因组间SSR的频率差异第82页
　　· 染色体特异SSR与同源染色体第82-84页
　　· 染色体特异SSR在棉花研究中的应用前景第84页
　　· 提高质量性状基因粗定位效率的方法第84-85页
　　· 精细定位群体的选择第85-86页
　　· gl_1基因在低酚棉育种的应用第86-87页
　　· 棉花基因组中的选择性剪接第87-88页
　　· 与棉酚生物合成和腺体细胞发育相关的基因第88-89页
参考文献第89-100页
致谢第100-101页
附录1 亚洲棉基因组中各染色体的SSR类型分布统计第101-105页
附录2 雷蒙德氏棉基因组中各染色体的SSR类型分布统计第105-109页
附录3 五碱基重复SSR在亚洲棉和雷蒙德氏棉基因组中的分布第109-111页
附录4 六碱基重复SSR在亚洲棉和雷蒙德氏棉基因组中的分布第111-113页
附录5 102个选择性剪接差异基因的位置及注释信息第113-119页
附录6 102个选择性剪接差异基因的代谢途径注释第119-120页
附录7 作者简介及在读期间发表论文第120-121页

本篇论文共121页，点击这进入下载页面。
 
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