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基于RNA-Seq技术的雏鸵鸟胸腺应答硼刺激分子机制研究
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基于RNA-Seq技术的雏鸵鸟胸腺应答硼刺激分子机制研究
论文目录
 
摘要第1-13页
Abstract第13-18页
缩略词表（Abbreviation）第18-19页
第1章 文献综述第19-41页
　　前言第19页
　　1 鸵鸟人工养殖及疾病防控第19-21页
　　　　· 我国人工鸵鸟养殖的发展概况第19-21页
　　　　· 鸵鸟疾病防控现状第21页
　　2 微量元素硼的生物学效应研究进展第21-24页
　　　　· 硼对动物体的影响第21-24页
　　　　　　· 硼的营养作用及其新陈代谢第21-23页
　　　　　　· 硼对动物体的毒性作用第23-24页
　　　　· 硼对癌细胞增殖及凋亡的调节第24页
　　3 雏鸵鸟、胸腺与硼的关系第24-25页
　　4 胸腺发育相关基因研究进展第25-28页
　　　　· Foxn1基因与胸腺发育第26-28页
　　　　· BMPs家族与胸腺发育第28页
　　5 免疫及炎症应答相关通路研究进展第28-40页
　　　　· MAPK信号通路第28-32页
　　　　　　· Ras-ERK信号通路第29-30页
　　　　　　· JNK信号通路第30-31页
　　　　　　· p38MAPK信号通路第31-32页
　　　　· 钙依赖性信号通路第32-33页
　　　　· PI3K/AKT信号通路第33-35页
　　　　· 热应激蛋白与免疫应答第35-36页
　　　　　　· Hsp70第35页
　　　　　　· Hsp40第35-36页
　　　　· 细胞凋亡信号通路第36-40页
　　　　　　· 外源性凋亡信号通路第36-37页
　　　　　　· 内源性凋亡信号通路第37页
　　　　　　· 钙离子介导的凋亡通路第37-38页
　　　　　　· 凋亡抑制蛋白IAP和FLIP第38-39页
　　　　　　· 存活因子PI3K和PKA第39-40页
　　6 选题目的与意义第40-41页
第2章 硼对雏鸵鸟胸腺生长发育相关基因的影响第41-77页
　　1 引言第41-42页
　　2 材料与方法第42-54页
　　　　· 实验材料第42-45页
　　　　　　· 实验动物第42页
　　　　　　· 主要仪器设备第42-43页
　　　　　　· 主要试剂第43-44页
　　　　　　· 试剂配置第44-45页
　　　　· 实验方法第45-54页
　　　　　　· 取材第45页
　　　　　　· HE染色第45页
　　　　　　· 免疫组织化学第45页
　　　　　　· TUNEL技术第45-46页
　　　　　　· 免疫荧光化学第46-47页
　　　　　　· 荧光定量PCR第47-48页
　　　　　　· Western Blot第48-50页
　　　　　　· RACE测序第50-54页
　　3 结果第54-72页
　　　　· 硼对雏鸵鸟胸腺组织结构的影响第54-57页
　　　　· 硼对雏鸵鸟胸腺细胞凋亡的影响第57-60页
　　　　· 鸵鸟Foxn1基因的克隆和序列分析第60-65页
　　　　　　· 鸵鸟Foxn1基因的RACE扩增结果第60-65页
　　　　· 硼对雏鸵鸟胸腺内Foxn1蛋白表达的影响第65-68页
　　　　· 硼对雏鸵鸟胸腺内BMP信号通路的影响作用第68-72页
　　4 讨论第72-76页
　　　　· 硼对 90d雏鸵鸟胸腺组织结构的影响第72页
　　　　· 硼对 90d雏鸵鸟胸腺淋巴细胞凋亡的影响第72-73页
　　　　· 硼对鸵鸟Foxn1基因的影响第73-74页
　　　　· 硼对鸵鸟胸腺发育相关基因BMP2/BMP4的影响作用第74-76页
　　5 结论第76-77页
第3章 雏鸵鸟胸腺应答硼刺激的RNA-Seq分析第77-128页
　　1 引言第77-78页
　　2 材料与方法第78-87页
　　　　· 实验材料第78页
　　　　　　· 实验动物第78页
　　　　　　· 仪器设备第78页
　　　　· 实验方法第78-87页
　　　　　　· RNA-Seq实验简介第78-79页
　　　　　　· 转录组信息分析简介第79-82页
　　　　　　· 转录组信息分析方法简述第82-87页
　　3 结果第87-119页
　　　　· 转录组测序评估第87-92页
　　　　　　· 转录组测序质量评估第87页
　　　　　　· 碱基组成与质量分析第87-89页
　　　　　　· 过滤信息统计分析第89-90页
　　　　　　· 转录组测序饱和度分析第90-91页
　　　　　　· 转录组测序随机性分析第91-92页
　　　　· 转录组比对统计分析第92页
　　　　　　· 比对核糖体第92页
　　　　　　· 比对鸵鸟参考基因组第92页
　　　　· 转录组基因统计分析第92-95页
　　　　　　· 基因表达结果统计第92-93页
　　　　　　· 基因覆盖度统计第93-94页
　　　　　　· 表达量丰度分析第94-95页
　　　　· 转录组差异分析第95-119页
　　　　　　· 重复性检验第95-96页
　　　　　　· 样品关系概况第96-98页
　　　　　　· 成对差异基因统计分析第98-100页
　　　　　　· 差异表达基因的GO功能分析第100-111页
　　　　　　· 差异表达基因的KEGG pathway分析第111-119页
　　4 讨论第119-127页
　　　　· 雏鸵鸟胸腺转录组学测序质量评估第120页
　　　　· 雏鸵鸟胸腺转录组学差异基因GO功能注释分析第120-121页
　　　　· 雏鸵鸟胸腺转录组学差异基因KEGG pathway的富集分析第121-127页
　　5 结论第127-128页
第4章 硼对鸵鸟机体免疫及炎症相关通路的影响第128-155页
　　1 引言第128页
　　2 材料与方法第128-129页
　　　　· 实验材料第128-129页
　　　　　　· 实验动物第128页
　　　　　　· 仪器设备第128-129页
　　　　· 实验方法第129页
　　　　　　· RNA-Seq测序及分析第129页
　　　　　　· 荧光定量PCR技术第129页
　　　　　　· Western Blot技术第129页
　　3 结果第129-149页
　　　　· 硼对鸵鸟机体内MAPK信号通路的影响第129-135页
　　　　· 硼对鸵鸟机体内钙离子信号通路的影响第135-139页
　　　　· 硼对鸵鸟机体内B/T细胞受体信号通路的影响第139-142页
　　　　· 硼对鸵鸟机体内Toll样受体通路的影响第142-145页
　　　　· 硼对热休克蛋白(HSP)活性的影响第145-149页
　　4 讨论第149-154页
　　　　· 硼对MAPK信号通路的影响第149-151页
　　　　· 硼对钙离子信号通路的影响第151-152页
　　　　· 硼对T/B细胞受体信号通路的影响第152-153页
　　　　· 硼对Toll样受体信号通路的影响第153页
　　　　· 硼对热应激蛋白Hsp70和Hsp40表达水平的影响第153-154页
　　5 结论第154-155页
第5章 硼对鸵鸟胸腺细胞增殖及凋亡通路的影响第155-164页
　　1 引言第155-156页
　　2 材料与方法第156页
　　　　· 实验材料第156页
　　　　　　· 实验动物第156页
　　　　　　· 仪器设备第156页
　　　　· 实验方法第156页
　　　　　　· RNA-Seq测序及分析第156页
　　　　　　· 荧光定量PCR技术第156页
　　3 结果第156-161页
　　　　· 硼对鸵鸟机体内细胞凋亡通路的影响第156-160页
　　　　　　· 硼对外源性细胞凋亡通路的影响第157-158页
　　　　　　· 硼对存活因子及凋亡相关因子表达水平的影响第158-160页
　　　　　　· 硼对钙离子诱导的细胞凋亡的影响第160页
　　　　· 硼对鸵鸟机体内癌症信号通路的影响第160-161页
　　4 讨论第161-163页
　　　　· 硼对鸵鸟机体内细胞凋亡信号通路的影响第161-163页
　　　　· 硼对鸵鸟机体内癌症信号通路的影响第163页
　　5 结论第163-164页
第6章 全文结论第164-166页
参考文献第166-186页
致谢第186-187页
附录1 个人简历第187-188页
附录2 博士期间发表的论文第188-190页

本篇论文共190页，点击这进入下载页面。
 
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