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Mycobacterium neoaurum NwIB-01降解甾醇母核关键酶3-甾酮-△~1-脱氢酶和3-甾酮-9α-羟化酶基因的鉴定及其基因工程改造

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分类:教育论文网→生物科学论文→分子生物学论文基因工程(遗传工程)论文
Mycobacterium neoaurum NwIB-01降解甾醇母核关键酶3-甾酮-△~1-脱氢酶和3-甾酮-9α-羟化酶基因的鉴定及其基因工程改造
论文目录
 
摘要第1-7 页
Abstract第7-10 页
目录第10-14 页
第1章 文献综述第14-36 页
  · 甾体化合物及其微生物转化第14-20 页
    · 甾体化合物及甾体药物第14-16 页
    · 甾体化合物的微生物转化第16-20 页
      · 甾体化合物的微生物转化概述第16-17 页
      · 甾体化合物微生物转化的反应类型第17 页
      · 植物甾醇及甾醇侧链降解第17-20 页
  · 3-甾酮-△~1-脱氢酶(KsdD)第20-24 页
    · 3-甾酮-△~1-脱氢反应概况第20-21 页
    · 3-甾酮-△~1-脱氢酶的反应机理第21-22 页
    · 3-甾酮-△~1-脱氢酶氨基酸序列分析第22-23 页
    · 3-甾酮-△~1-脱氢酶的异源表达第23-24 页
  · 3-甾酮-9A-羟基化酶(KSH)第24-28 页
    · 3-甾酮-9α-羟基化反应概况第24-25 页
    · 3-甾酮-9α-羟基化酶的酶学分类第25-27 页
    · 3-甾酮-9α-羟基化酶的抑制第27-28 页
  · 分枝杆菌降解甾醇侧链的国内外相关研究现状及最新发展动态分析第28-33 页
    · 分枝杆菌概况及在甾体代谢上的研究第28-29 页
    · 国内外相关研究现状第29-31 页
      · 菌种选育第29-30 页
      · 培养基优化第30 页
      · 发酵系统的研究第30-31 页
    · 甾醇降解机制最新发展动态分析第31-33 页
    · 构建甾醇降解基因工程菌的研究进展第33 页
  · 本课题的研究目的与内容第33-36 页
    · 课题背景第33-35 页
    · 本课题的研究内容及目标第35-36 页
第2章 新金分枝杆菌NwIB-01的筛选鉴定、生长特性研究第36-50 页
  · 引言第36 页
  · 材料与方法第36-42 页
    · 实验材料第36-38 页
      · 实验药品及仪器第36-37 页
      · 菌株第37 页
      · 培养基第37-38 页
    · 实验方法第38-42 页
      · 植物甾醇的乳化第38 页
      · 微生物的富集、分离与纯培养第38-39 页
      · 转化产物分析第39 页
      · 菌种鉴定第39-41 页
      · 菌种生长分析第41-42 页
  · 结果与分析第42-48 页
    · 微生物筛选鉴定第42-46 页
      · 微生物的形态观察第42-43 页
      · NwIB-01的植物甾醇转化实验第43-44 页
      · 微生物的16SrDNA鉴定第44-46 页
    · NwIB-01的生长特性及培养基选择第46-48 页
  · 本章小结第48-50 页
第3章 新金分枝杆菌NwIB-01中3-酮-4-烯类固醇化合物C_(1,2)位脱氢反应关键基因的克隆和酶学分析第50-79 页
  · 引言第50 页
  · 材料与方法第50-66 页
    · 实验材料第50-54 页
      · 菌株及质粒第50-51 页
      · 培养基及试剂第51-53 页
      · 实验药品及仪器第53-54 页
    · 实验方法第54-66 页
      · 菌种保藏第55 页
      · 染色体DNA的制备第55 页
      · 大肠杆菌质粒质粒DNA的提取第55-56 页
      · DNA片段的凝胶电泳回收第56 页
      · 小量PCR产物的纯化第56 页
      · 大肠杆菌感受态细胞的制备第56-57 页
      · T载体克隆第57 页
      · 转化和筛选第57 页
      · 阳性重组子的鉴定第57-58 页
      · 引物设计第58 页
      · 基因走读Genome-Walking及基因全长的获得第58-60 页
      · 表达质粒的构建第60-61 页
      · 蛋白质的原核表达及SDS-PAGE检测第61-62 页
      · 重组菌诱导优化第62-63 页
      · 大肠杆菌细胞破碎第63 页
      · Ni-NTA琼脂糖亲和层析柱分离纯化第63 页
      · 透析第63-64 页
      · 总蛋白含量测定第64-65 页
      · 3-甾酮-△~1-脱氢酶酶活测定第65 页
      · 基因工程大肠杆菌转化AD实验第65 页
      · 基因序列的简单生物信息学分析第65-66 页
  · 结果与分析第66-77 页
    · NwIB-01中3-甾酮-△~1-脱氢酶基因保守序列的克隆第66-68 页
      · 分枝杆菌基因组提取方法改进第66-67 页
      · 分枝杆菌3-甾酮-△~1-脱氢酶保守序列的扩增第67-68 页
    · NwIB-01中3-甾酮-△~1-脱氢酶基因全序列的克隆第68-70 页
    · 构建pET-22b-ksdD_M和pET-32a-ksdD_M表达载体第70-71 页
    · 3-甾酮-△~1-脱氢酶的优化表达第71-74 页
      · 重组pET-22b-ksdD_M和pET-32a-ksdD_M的诱导表达第71-72 页
      · 表达条件的优化第72-73 页
      · 蛋白纯化第73-74 页
    · 酶活测定第74 页
    · 大肠杆菌全细胞转化实验第74-75 页
    · 生物信息学分析第75-77 页
      · 3-甾酮-△~1-脱氢酶的基因分析第75-76 页
      · 3-甾酮-△~1-脱氢酶的跨膜结构分析第76-77 页
  · 本章小结第77-79 页
第4章 新金分枝杆菌NwIB-01中甾体9α-羟基化反应关键基因的克隆和酶学分析第79-99 页
  · 引言第79 页
  · 材料与方法第79-84 页
    · 实验材料第79-80 页
    · 实验方法第80-84 页
      · 常规分子生物学实验方法第80 页
      · 3-甾酮-9α-羟基化酶(KshA)的引物设计第80-81 页
      · 3-甾酮-9α-羟基化酶(KshA)的保守序列的扩增第81 页
      · 3-甾酮-9α-羟基化酶的染色体走读第81 页
      · 3-甾酮-9α-羟基化酶全长基因的克隆第81-82 页
      · 3-甾酮-9α-羟基化酶还原酶(KshB)保守序列的扩增第82 页
      · 3-甾酮-9α-羟基化酶还原酶(KshB)全长序列的克隆第82 页
      · 重组质粒的构建第82 页
      · 重组pET32-ksh的诱导表达第82-83 页
      · 表达产物鉴定第83 页
      · 表达蛋白KshA的分离纯化第83 页
      · 3-甾酮-9α-羟基化酶及其还原酶基因的共表达第83-84 页
  · 结果与分析第84-97 页
    · 3-甾酮-9α-羟基化酶基因保守序列的扩增第84 页
    · 3-甾酮-9α-羟基化酶基因全长的克隆第84-85 页
    · 3-甾酮-9α-羟基化酶序列及进化树分析第85-90 页
      · 开放阅读框(ORF)的确定及蛋白一级结构分析第85-87 页
      · KshA的二级结构及结构域预测第87-89 页
      · 基因进化树及保守结构域分析第89-90 页
    · 重组质粒的构建及转化第90-91 页
    · KSH的诱导表达优化及蛋白纯化第91-92 页
    · 全菌转化第92 页
    · 3-甾酮-9α-羟基化酶还原酶(KshB)基因的克隆第92-93 页
    · 3-甾酮-9α-羟基化酶及其还原酶的共表达第93-97 页
  · 本章小结第97-99 页
第5章 新金分枝杆菌NwIB-01中3-甾酮-9α-羟基化酶(KshA)及3-甾酮-△~1-脱氢酶(KsdD)的基因敲除第99-117 页
  · 引言第99 页
  · 材料与方法第99-107 页
    · 实验材料第99-101 页
      · 菌株和质粒第99-100 页
      · 实验试剂及器材第100-101 页
    · 实验方法第101-107 页
      · KsdD自杀敲除质粒的构建第101-103 页
      · KsdD敲除工程菌阳性克隆子的筛选第103-106 页
      · KSH自杀敲除质粒的构建第106-107 页
      · KSH敲除工程菌阳性克隆子的筛选第107 页
      · KsdD及KshA基因敲除工程菌的验证第107 页
  · 实验结果第107-116 页
    · KsdD上下游序列的扩增第107-109 页
    · KsdD敲除质粒的构建第109-110 页
    · KsdD基因敲除突变菌的筛选第110-111 页
    · KsdD基因敲除突变菌的表型及生产特征鉴定第111-113 页
    · KshA基因上下游序列的克隆及敲除质粒的构建第113-116 页
  · 本章小结第116-117 页
第6章 新金分枝杆菌NwIB-01中3-甾酮-△~1-脱氢酶(KsdD)的基因强化表达及基因工程菌ADD发酵试验初探第117-127 页
  · 引言第117 页
  · 材料与方法第117-120 页
    · 实验材料第117-118 页
      · 菌株和质粒第117-118 页
      · 实验试剂及器材第118 页
    · 实验方法第118-120 页
      · KsdD穿梭表达质粒(pMV261-ksdDM)的构建第118-119 页
      · KsdD整合表达质粒(pMV306-ksdDM)的构建第119-120 页
      · 重组分枝杆菌的构建第120 页
      · 重组分枝杆菌的稳定性分析第120 页
      · 重组分枝杆菌NwIB-04的发酵初探第120 页
      · 重组分枝杆菌NwIB-04的转化反应及产物分析第120 页
  · 实验结果与分析第120-125 页
    · 重组质粒pMV261-ksdD_M的构建第120-121 页
    · 重组质粒pMV306-ksdD_M的构建第121-122 页
    · 重组分枝杆菌重组子的鉴定第122-123 页
    · 重组分枝杆菌的稳定性分析第123 页
    · 重组分枝杆菌NwIB-04的性状检测及发酵放大实验第123-125 页
  · 本章小结第125-127 页
第7章 课题最新进展及结论与展望第127-134 页
  · 课题最新进展-甾体降解基因簇的研究第127-130 页
  · 结论第130-132 页
  · 课题研究展望第132-134 页
参考文献第134-143 页
致谢第143-144 页
博士期间发表的论文与专利第144-145 页
附录一 缩写词和英汉对照第145-146 页
附录二 NCBI提交序列信息第146-151 页

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