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棉花R2R3-MYB基因家族海陆种间序列变异及与纤维性状的相关性分析

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棉花R2R3-MYB基因家族海陆种间序列变异及与纤维性状的相关性分析
论文目录
 
摘要第1-10页
ABSTRACT第10-12页
第一章 文献综述第16-32页
    1.1 棉花纤维发育分子机制研究现状第16-23页
        1.1.1 棉花纤维品质改良及相关基因研究进展第18-22页
        1.1.2 海陆群体在棉花纤维品质改良中的应用第22-23页
    1.2 植物R2R3-MYB转录因子的研究进展第23-29页
        1.2.1 R2R3-MYB转录因子功能研究进展第23-27页
        1.2.2 R2R3-MYB转录因子在棉花纤维发育过程中的研究进展第27-29页
    1.3 目的意义与技术路线第29-32页
第二章 四个棉种R2R3-MYB家族比较分析及与纤维性状QTL hotspots共定位第32-49页
    2.1 实验材料第32-33页
        2.1.1 公共数据库第32页
        2.1.2 生物信息学分析相关软件第32-33页
    2.2 实验方法第33-34页
        2.2.1 棉花R2R3-MYB转录因子的鉴定及系统进化分析第33页
        2.2.2 DNA-binding结构域比较分析第33页
        2.2.3 染色体定位及密码子替换率分析第33页
        2.2.4 R2R3-MYB与纤维性状QTL hotspots共定位第33-34页
    2.3 结果分析第34-47页
        2.3.1 四个棉种R2R3-MYB转录因子的鉴定及比较分析第34-40页
        2.3.2 R2R3-MYB与纤维性状QTL hotspots共定位第40-47页
    2.4 讨论第47-49页
第三章 R2R3-MYB基因海陆SNP鉴定及与纤维性状相关性分析第49-69页
    3.1 实验材料第49-50页
        3.1.1 植物材料第49页
        3.1.2 公共数据第49-50页
    3.2 方法第50-54页
        3.2.1 RNA提取及表达模式分析第50页
        3.2.2 基因组DNA提取第50页
        3.2.3 R2R3-MYB基因海陆种间SNP鉴定第50页
        3.2.4 R2R3-MYB在 BIL群体中基因分型及与纤维性状相关性分析第50-54页
    3.3 结果分析第54-67页
        3.3.1 R2R3-MYB基因海陆种间SNP鉴定第54-58页
        3.3.2 R2R3-MYB在 BIL群体中基因分型及与纤维形状相关性分析第58-64页
        3.3.3 17个R2R3-MYB基因表达模式分析第64-67页
    3.4 讨论第67-69页
第四章 棉花GhMYB5_A12 的克隆与功能验证第69-102页
    4.1 实验材料第69页
    4.2 方法第69-81页
        4.2.1 GhMYB5_A12 的鉴定及功能预测第69-70页
        4.2.2 MYB5 海陆等位基因SNP与纤维性状相关性分析第70页
        4.2.3 GhMYB5_A12 的亚细胞定位第70-71页
        4.2.4 GhMYB5_A12 遗传转化棉花和拟南芥及VIGS实验第71-73页
        4.2.5 RNA提取及表达模式分析第73-74页
        4.2.6 扫描电镜第74-75页
        4.2.7 棉花成熟纤维品质测定第75页
        4.2.8 酵母双杂实验第75-81页
        4.2.9 双分子荧光互补实验第81页
    4.3 结果分析第81-98页
        4.3.1 GhMYB5_A12 的分子和细胞特性第81-84页
        4.3.2 GhMYB5_A12 与纤维性状QTL共定位分析第84-85页
        4.3.3 MYB5 海陆等位基因SNP与纤维性状相关性分析第85-88页
        4.3.4 GhMYB5_A12 在拟南芥中过表达及性状分析第88-89页
        4.3.5 GhMYB5_A12的VIGS实验及表型分析第89-91页
        4.3.6 GhMYB5_A12 在棉花中过表达及表型分析第91-93页
        4.3.7 酵母双杂实验第93-96页
        4.3.8 双分子荧光互补实验第96-98页
    4.4 讨论第98-102页
        4.4.1 GhMYB5_A12 在纤维发育过程中的潜在作用第98-101页
        4.4.2 GhMYB5_A12 在棉花纤维发育过程中的调控机制第101-102页
第五章 全文结论第102-105页
附录第105-111页
参考文献第111-121页
致谢第121-123页
个人简历第123-124页

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