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龙眼体胚发生中期的蛋白质组学及Ran家族表达调控研究

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龙眼体胚发生中期的蛋白质组学及Ran家族表达调控研究
论文目录
 
缩写词第1-9页
摘要第9-13页
Abstract第13-19页
第一章 引言第19-30页
  1 植物体胚发生研究进展第20页
  2 植物体胚发生蛋白质组学研究进展第20-22页
  3 Ran和Obg研究进展第22-24页
    · Ran研究进展第22-24页
    · Obg研究进展第24页
  4 NMD研究进展第24-25页
  5 龙眼生物技术研究进展第25-27页
  6 本研究的意义和主要研究内容第27-30页
    · 本研究的意义第27-28页
    · 本研究的主要内容第28-30页
第二章 龙眼体胚发生中期的同步化调控第30-36页
  1 材料与方法第31页
    · 材料第31页
    · 方法第31页
  2 结果与分析第31-33页
    · 龙眼球形胚阶段体胚的诱导第31页
    · 龙眼体胚发生中期的同步化调控第31-33页
  3 讨论第33-36页
    · 龙眼体胚发生同步化调控的影响因素第33-34页
    · 2,4-D与植物体胚发生的关系第34-36页
第三章 龙眼体胚发生中期的蛋白质组学研究第36-59页
  1 材料与方法第36-37页
    · 材料第36页
    · 方法第36-37页
  2 结果与分析第37-54页
    · 龙眼体胚发生中期各阶段蛋白质的双线电泳分离和图谱分析第37-41页
      · 龙体胚发生中期各阶段双向电泳图谱蛋白点数和比例变化分析第37-39页
      · 龙眼体胚发生中期各阶段差异表达蛋白比较分析第39-41页
    · 龙眼体胚发生中期部分差异蛋白质点的质谱鉴定第41页
    · 成功鉴定蛋白表达模式聚类分析和功能分类第41-54页
  3 讨论第54-59页
    · 龙眼体细胞胚发生中期各阶段蛋白质种类的变化第54-55页
    · 体细胞胚发生中期的代谢变化第55-56页
    · 氧化胁迫促进体细胞胚发生第56-57页
    · 小 G 蛋白在体细胞胚发生中的作用第57-58页
    · 角蛋白与体细胞胚发生第58-59页
第四章 龙眼体胚Ran家族基因的克隆、生物信息学分析及其在龙眼体胚发生过程中的表达分析第59-101页
  第一节 龙眼体胚Ran家族基因的克隆及结构分析第60-85页
    1 材料与方法第60-62页
      · 材料第60页
      · 方法第60-62页
        · 龙眼胚性愈伤组织和同步化鱼雷形胚DNA与总RNA的提取及cDNA合成第60页
        · 龙眼体胚Ran家族基因引物设计与 PCR 扩增第60-61页
        · 目的片段的回收、克隆和测序第61-62页
        · 龙眼体胚Ran家族基因序列的分析第62页
    2 结果与分析第62-83页
      · 龙眼鱼雷形胚Ran家族基因部分编码序列的获得第62-63页
      · 龙眼鱼雷形胚Ran家族基因cDNA 5'和 3'末端的扩增第63-68页
        · 龙眼鱼雷形胚Ran家族基因cDNA3'末端的获得第63-67页
        · 龙眼鱼雷形胚Ran家族基因cDNA 5'末端的获得第67-68页
      · 龙眼鱼雷形胚Ran家族基因全长cDNA的获得第68-70页
      · 龙眼胚性愈伤组织Ran家族基因基因组 DNA 序列的获得第70-71页
      · 龙眼鱼雷形胚Ran家族基因核酸和氨基酸序列分析第71-83页
        · 龙眼鱼雷形胚Ran家族基因cDNA的比较分析第71页
        · 龙眼体胚Ran基因结构与核酸特征第71-75页
        · 龙眼鱼雷形胚Ran家族基因氨基酸序列的比较分析第75-83页
    3 讨论第83-85页
      · 龙眼体胚Ran家族基因 mRNA 3'UTR 长度的多态性第83页
      · 龙眼体胚Ran家族基因转录起始位点的多态性第83页
      · 龙眼体胚Ran家族基因中同义密码子的使用第83-85页
  第二节 龙眼体胚Ran家族基因的生物信息学分析第85-97页
    1 材料与方法第85页
      · 材料第85页
      · 方法第85页
    2 结果与分析第85-96页
      · 龙眼体胚Ran蛋白的基本理化性质比较分析第85-86页
      · 龙眼体胚Ran蛋白的信号肽和亚细胞定位分析第86-87页
      · 龙眼体胚Ran蛋白的跨膜结构预测第87页
      · 龙眼体胚Ran蛋白磷酸化位点预测与分析第87页
      · 龙眼体胚Ran蛋白的功能基序预测与分析第87-90页
      · 龙眼体胚Ran蛋白保守结构域的预测与分析第90-91页
      · 龙眼体胚Ran蛋白二级结构和三维结构预测与分析第91页
      · 龙眼体胚Ran蛋白同源性分析第91-93页
      · 龙眼体胚Ran蛋白的系统进化分析第93-96页
    3 讨论第96-97页
      · 龙眼体胚Ran不同成员亚细胞定位的差异第96页
      · 龙眼体胚Ran不同成员的功能是否存在差异?第96-97页
  第三节 龙眼体胚Ran家族基因在龙眼体胚发生过程中的表达分析第97-101页
    1 材料与方法第97-98页
      · 材料第97页
      · 方法第97-98页
        · 龙眼胚性培养物总 RNA 的提取和cDNA的合成第97页
        · qPCR 引物的设计第97-98页
        · 实时荧光定量 PCR第98页
    2 结果与分析第98-99页
    3 讨论第99-101页
      · 龙眼体胚Ran家族基因在龙眼体胚发生过程中可能发挥的作用第99-100页
      · 龙眼体胚发生过程中 Ran 家族基因的转录水平与蛋白质表水平的差异第100-101页
第五章 龙眼体胚发生过程中Ran表达调控研究第101-121页
  第一节 AS-NMD 与龙眼体胚发生过程中Ran表达调控关系的研究第102-114页
    1 材料与方法第102-103页
      · 材料第102页
      · 方法第102-103页
        · 龙眼胚性愈伤组织的放线菌酮处理第102页
        · 龙眼体胚 PTC-Ran qPCR 分析引物设计第102页
        · 龙眼胚性培养物总 RNA 的提取和cDNA的合成及 qPCR 分析第102-103页
    2 结果与分析第103-112页
      · 龙眼体胚PTC-Ran cDNA的克隆与分析第103-106页
      · 龙眼体胚Ran mRNA前体的剪接与 PTC-Ran 转录本形成的关系第106-107页
      · 放线菌酮处理可提高龙眼胚性愈伤组织中 PTC-Ran 转录本表达量第107-109页
      · DLRan 的表达量在龙眼体胚发生过程中随相应野生型转录本变化而变化第109-112页
    3 讨论第112-114页
      · PTC-Ran 转录本源于可变剪接第112页
      · 龙眼体胚 Ran 可变剪接的意义第112-113页
      · Ran 转录本中 PTC 的引入可能不保守第113页
      · AS-NMD 可能是一种维持特定细胞中 Ran mRNA 动态平衡的机制第113-114页
  第二节 3'UTR 与龙眼体胚发生过程中 Ran 表达调控关系的研究第114-121页
    1 材料与方法第115页
      · 材料第115页
      · 方法第115页
        · 用于 qPCR 分析的引物设计第115页
        · 龙眼胚性培养物总 RNA 的提取和 cDNA 的合成及 qPCR 分析第115页
    2 结果与分析第115-119页
      · 长的龙眼体胚 Ran 3'UTR 拥有更多的潜在 miRNA 结合位点第115-116页
      · 龙眼体胚 Ran 3'UTR 受发育调控但未随体胚发育延伸第116-119页
    3 讨论第119-121页
      · 龙眼体胚 Ran 可能与龙眼体胚发生过程中细胞增殖有关第119页
      · 3'UTR 可能与 Ran 的表达有关第119-121页
第六章 龙眼体胚 Obg1 基因的克隆及其在龙眼体胚发生过程中的表达分析第121-128页
  1 材料与方法第121-122页
    · 材料第121页
    · 方法第121-122页
      · 总 RNA 提取第121-122页
      · 龙眼体胚 Obg 基因 cDNA 序列的克隆第122页
      · 生物信息学分析第122页
      · 实时荧光定量 PCR第122页
  2 结果与分析第122-126页
    · 龙眼体胚 Obg 基因 cDNA 序列的克隆及序列分析第122-123页
    · 龙眼体胚 DLObg1 序列的比较分析和系统进化分析第123页
    · 龙眼体胚发生过程中 DLObg1 的转录水平分析第123-126页
  3 讨论第126-128页
    · DLObg1 3’UTR 长度多态性与龙眼体胚发生过程中 DLObg1 表达调控的关系第126页
    · DLObg1 在龙眼体胚发生中的作用第126-128页
第七章 小结第128-132页
  1 龙眼体胚发生中期的同步化调控第128页
  2 龙眼体胚发生中期的蛋白质组学研究第128-129页
  3 龙眼体胚 Ran 家族基因的克隆、生物信息学分析及其在龙眼体胚发生过程中的表达分析第129-130页
  4 龙眼体胚发生过程中 Ran 表达调控研究第130-131页
  5 龙眼体胚 Obg1 基因的克隆及其在龙眼体胚发生过程中的表达分析第131-132页
参考文献第132-157页
附录 1 龙眼体胚 Ran 家族基因 cDNA 3'末端和 5'末端序列信息第157-161页
附录 2 GenBank 上登录的龙眼体胚 Ran 家族基因 cDNA 和 DNA 序列信息第161-169页
在学博士期间发表论文情况与参加学术会议情况第169-170页
致谢第170页

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