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dnd基因簇对细菌DNA骨架的磷硫酰化硫修饰

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dnd基因簇对细菌DNA骨架的磷硫酰化硫修饰
论文目录
 
中文摘要第1-8 页
英文摘要第8-15 页
符号说明第15-17 页
第一章 文献综述第17-43 页
  第1节 DNA 降解现象的前期研究第17-23 页
    · DNA 降解现象的发现第17-19 页
    · Dnd 现象是Tris 依赖性的氧化切割反应第19-20 页
    · 变铅青链霉菌的异常修饰系统具有DNA 位点特异性第20-22 页
    · DNA 异常修饰属于复制后修饰第22-23 页
  第2节 DNA异常修饰的研究进展第23-35 页
    · 变铅青链霉菌中异常修饰基因簇的分离第23-26 页
    · 序列分析与DNA 异常修饰相关的基因簇第26-27 页
    · 其他细菌中的Dnd 表型和dnd 基因簇第27-30 页
    · Dnd 蛋白功能分析第30-33 页
    · DNA 硫修饰的近期进展第33-35 页
  第3节 DNA硫修饰的近期进展第35-39 页
    · dnd 基因簇的分布和来源第35-37 页
    · dndB 的中断会加剧DNA 体外降解第37-39 页
    · Dnd 蛋白功能探索第39 页
  第4节 DNA 硫修饰的研究意义和挑战第39-41 页
    · 硫修饰——DNA 分子结构新的补充第39-40 页
    · 硫修饰——其他相关领域发展的推动力第40-41 页
    · DNA 硫修饰的挑战——DNA 硫修饰的化学本质第41 页
  第5节 本研究内容和目的第41-43 页
    · 本研究基础第41 页
    · 本研究内容和目的第41-43 页
第二章 实验材料和方法第43-56 页
  第1节 实验材料第43-50 页
    · 菌株第43-44 页
    · 质粒第44-47 页
    · 培养基和化学试剂第47-50 页
    · 标准品合成第50 页
  第2节 实验方法第50-56 页
第三章 硫修饰DNA 分子的定位第56-62 页
  第1节 含dnd 基因簇的野生及工程大肠杆菌Dnd 表型的鉴定第56-58 页
  第2节 大肠杆菌B7A 和DH10B(pJTU1238) DNA 酶解产物的HPLC 分离以及含~(35)S 组分的定位第58-62 页
第四章 硫修饰脱氧核糖核苷的结构鉴定第62-93 页
  第1节 高压液相-质谱分析鉴定硫修饰脱氧核糖核苷第62-66 页
  第2节 高效液相色谱/电喷雾飞行时间质谱联用鉴定硫修饰脱氧核糖核苷第66-68 页
  第3节 硫修饰脱氧核糖核苷的结构预测第68-72 页
  第4节 紫外新峰中硫修饰双脱氧核糖核酸与标准品的对比分析第72-80 页
    · 高压液相色谱对比保留时间第72-75 页
    · 高压液相色谱-质谱对比紫外特征吸收和质谱信号第75-80 页
  第5节 高压液相色谱-多级质谱断裂分析第80-82 页
  第6节 硫修饰5'-d(G_(PS)A)-3' 空间构象的鉴定第82-86 页
  第7节 DNA 磷硫酰化修饰与Dnd 表型的联系第86-90 页
  第8节 磷硫酰化DNA 降解过程的推断第90-93 页
第五章 变铅青链霉菌中的DNA 硫修饰第93-105 页
  第1节 放射性~(35)S 喂养变铅青链霉菌第93-94 页
  第2节 LC-MS 检测变铅青链霉菌中的硫修饰DNA 分子第94-99 页
  第3节 变铅青链霉菌中可能的硫修饰分子5'-d(G_(PS)G)-3' 的结构鉴定第99-103 页
  第4节 高精度质谱确定链霉菌中硫修饰双脱氧核糖核酸第103-105 页
第六章 其他微生物中DNA 硫修饰结构的鉴定第105-130 页
  第1节 不同细菌dnd 同源基因簇比较第105-109 页
  第2节 不同细菌中dnd 同源基因簇氨基酸序列比较第109-114 页
  第3节 不同细菌中DNA 硫修饰结构的检测第114-130 页
    · 荧光假单胞菌PfO-1 中的DNA 硫修饰第115-117 页
    · Hahella chejuensis KCTC 2396 中的DNA 硫修饰第117-119 页
    · Shewanella pealeana ATCC 700345 中的DNA 硫修饰第119-122 页
    · Candidatus Pelagibacter ubique HTCC1002 中的DNA 硫修饰第122-125 页
    · Oceanobacter sp. RED65 中的DNA 硫修饰第125-127 页
    · Geobacter uraniumreducens Rf4 中的DNA 硫修饰第127-130 页
第七章 参与DNA 硫修饰Dnd 蛋白的表达第130-143 页
  第1节 Dnd 蛋白在变铅青链霉菌中的表达纯化第130-135 页
    · DndC 蛋白在链霉菌中的超量表达和纯化第130-133 页
    · DndB 蛋白在链霉菌中的超量表达和纯化第133-135 页
    · DndD 蛋白在链霉菌中的超量表达和纯化第135 页
  第2节 Dnd 蛋白在大肠杆菌中的异源表达和纯化第135-140 页
    · DndB 蛋白的异源表达和纯化第135-137 页
    · DndC 蛋白的异源表达和纯化第137-138 页
    · DndE 蛋白的异源表达和纯化第138-140 页
  第3节 Dnd 蛋白功能后续研究第140-143 页
第八章 链霉菌FR-008 线性质粒pHZ227 上的arsRBOCT 型抗砷系统第143-161 页
  第1节 课题背景介绍第143-146 页
  第2节 链霉菌FR-008 中抗砷基因簇的定第146-149 页
  第3节 链霉菌FR-008 中的arsRBOCT 抗砷基因簇第149-150 页
  第4节 arsRBOCT 抗砷基因功能分析第150-158 页
    · 链霉菌FR-008 线性质粒pHZ227 上抗砷基因簇的基因置换第150-154 页
    · arsRBOCT 基因簇的转录第154-155 页
    · arsRBOCT 抗砷操纵子基因功能分析第155-158 页
  第5节 arsRBOCT 基因簇的生物信息学比较第158-161 页
第九章 本研究工作总结和展望第161-168 页
  第1节 本研究工作总结第161-164 页
  第2节 本研究主要创新点第164-165 页
  第3节 本研究工作进一步展望第165-168 页
参考文献第168-173 页
致谢第173-175 页
攻读学位期间发表学术论文和申请发明专利第175-176 页
附录第176-179 页

本篇论文共179页,点击这进入下载页面
 
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