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控制水稻粒宽/粒重主效QTL的定位、克隆和功能研究

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控制水稻粒宽/粒重主效QTL的定位、克隆和功能研究
论文目录
 
摘要第1-8 页
Abstract第8-10 页
文献综述第10-47 页
  综述一 高等植物种子大小的发育调控第10-34 页
    1、引言第10-11 页
    2、基因组印记(Genomic Imprinting)影响种子大小的形态建成第11-20 页
      · 被子植物基因组印记的概念、理论、机制和生物学意义第11-13 页
      · 基因组印记影响种子大小发育的实例第13-20 页
        · FIS类基因第13-14 页
        · FIS类基因的目标基因PHERES1(PHE1)第14-15 页
        · 对FIS类基因起调控作用的遗传因子第15-16 页
        · 直接影响植物基因组甲基化水平的基因也能调控种子的大小第16-18 页
        · 其他类影响种子大小发育的父/母源效应基因第18-20 页
    3、植物激素(plant hormone)信号途径可能参与种子大小调节第20-22 页
      · 油菜素类固醇(brassinosteroids, BRs)信号途径第20 页
      · 细胞分裂素(Cytokinin)信号途径第20-21 页
      · 响应生长素反应的基因第21-22 页
    4、编码G蛋白(GTP-binding protein)α亚基基因突变也改变了种子的大小第22-23 页
    5、植物发育和代谢中的信号转导途径参与了种子大小的调控第23-26 页
      · HAIKU1(IKU1)、HAIKU2(IKU2)和MINISEED3(MIN13)第23-25 页
      · EXTRA SPOROGENOUSCELLS (EXS)第25 页
      · 玉米中的Miniature1 基因第25-26 页
    6、小结和展望第26-27 页
    参考文献第27-34 页
  综述二 作物产量构成要素的分子基础第34-47 页
    1、引言第34 页
    2、产量构成的概念和研究的意义第34 页
    3、作物产量构成要素的分子调节第34-41 页
      · 控制番茄果实大小的QTL和FW2.2 基因第35-37 页
      · 水稻分蘖数和MOC1 基因第37-38 页
      · 控制水稻穗粒数的主效QTL/基因G111a第38-39 页
      · 控制水稻粒长/粒重QTL/基因G53第39-40 页
      · 玉米(Zea mays)中控制子粒大小和子粒数的基因G1111-3 和G1111-第40-41 页
    4、展望第41-43 页
    参考文献第43-47 页
研究论文第47-98 页
  引言第47-49 页
  1、材料与方法第49-65 页
    1-1 材料选择和亲本材料性状的考察、测定第49 页
    1-2 定位群体和目标QTL的近等基因系(nearly isogenic line) 即NIL(QTL)的构建第49-50 页
    1-3 菌株与质粒第50 页
      1-3-1 菌株第50 页
      1-3-2 质粒(载体)第50 页
    1-4 分子标记的选择、引物设计和基因型分析第50-51 页
    1-5 简易提取基因组DNA方法第51 页
    1-6 PCR反应和电泳分析第51-52 页
    1-7 F2 群体和初步定位第52-53 页
    1-8 大量提取基因组DNA的简化方法第53 页
    1-9 精细定位第53 页
    1-10 质粒的提取、酶切和片段的回收第53-55 页
      1-10-1 碱裂解法提取质粒第53-54 页
      1-10-2 从TBE琼脂糖凝胶中回收DNA片段(Ferments Kit)第54-55 页
    1-11 载体构建第55-57 页
      1-11-1 水稻转基因互补表达载体构建第55-56 页
      1-11-2 GFP-GW2 融合蛋白在洋葱表皮细胞中的亚细胞定位载体构建第56 页
      1-11-3 转基因GW2 promoter-GFP表达载体构建第56 页
      1-11-4 大肠杆菌蛋白表达载体构建第56-57 页
    1-12 大肠杆菌DH5α菌株感受态细胞的制备和转化第57-58 页
      1-12-1 钙镁法制备大肠杆菌感受态细胞第57 页
      1-12-2 CaC12 法制备大肠杆菌感受态细胞第57-58 页
    1-13 RT-PCR分析第58-59 页
      1-13-1 RNA提取和RT-PCR反应第58-59 页
      1-13-2 基因的表达分析第59 页
    1-14 GW2 蛋白的大肠杆菌低温诱导表达和目标活性蛋白的回收第59-60 页
      1-14-1 低温诱导第59-60 页
      1-14-2 目标活性蛋白的回收第60 页
    1-15 抗原的制备、纯化和PAGE胶电泳检测第60-61 页
    1-16 根癌农杆菌(EHA105)感受态细胞的制备和转化第61-62 页
    1-17 GFP融合蛋白在洋葱表皮细胞中的亚细胞定位第62-63 页
      1-17-1 材料准备第62 页
      1-17-2 微弹制备(金粉母液制备)第62 页
      1-17-3 质粒DNA的包裹第62-63 页
      1-17-4 利用PDS-1000/He型基因枪轰击洋葱表皮细胞第63 页
      1-17-5 GFP-GW2 融合蛋白瞬时表达信号的观察第63 页
    1-18 E3 泛素连接酶反应第63-64 页
    1-19 Western blot分析第64-65 页
  2、实验结果第65-84 页
    2-1 亲本材料之间在株型、穗型、粒型和粒重上都差别较大第65 页
    2-2 控制水稻粒型QTL的初步定位第65-66 页
    2-3 控制水稻粒宽主效QTL的精细定位第66-69 页
      2-3-1 精细定位和高精确度连锁分析第66-67 页
      2-3-2 利用关键交换个体的表型测定和基因型检测锁定QTL GW2第67-68 页
      2-3-3 QTL GW2 为半显性遗传第68-69 页
    2-4 对控制水稻粒宽基因GW2 的序列分析和同源性比对第69-72 页
      2-4-1 序列分析表明该基因编码一个功能未知的蛋白,包含一个类似RING的结构域第69-70 页
      2-4-2 GW2 的同源基因搜索和比对第70-72 页
    2-5 不同品种等位基因之间的序列差异第72 页
    2-6 转基因水稻中GW2 基因的表达变化影响谷粒的宽度第72-74 页
    2-7 GW2 的表达无时间和组织特异性(即无时空特异性)第74-75 页
    2-8 GW2 的表达定位在细胞质中第75-76 页
    2-9 GW2 编码的新型RING蛋白具有E3 泛素连接酶活性第76-79 页
      2-9-1 低温下可以诱导GW2 活性蛋白在大肠杆菌中表达第76-77 页
      2-9-2 大肠杆菌表达的双亲的GW2 活性蛋白都具有E3 泛素连接酶活性第77-78 页
      2-9-3 除UbcH56外,GW2 蛋白还可以与其他E2 如UbcH2、Ubc5a、Ubc5c和UbcH6 等结合发生泛素化反应第78-79 页
    2-10 利用近等基因系NIL(GW2)研究GW2 对粒型性状的作用第79-82 页
      2-10-1 NIL(GW2)的选育第79-80 页
      2-10-2 NIL(GW2)和FAZ1 之间主要在粒宽和粒重上存在极显著差异第80-82 页
    2-11 正反交结果表明GW2 基因不受母本效应的影响第82-84 页
  3、讨论第84-88 页
    3-1 水稻粒型和千粒重性状的QTL定位第84 页
    3-2 GW2 蛋白属于一种新类型的RING E3 泛素连接酶第84-85 页
    3-3 推测GW2 对水稻粒宽和粒重的遗传调控机理第85-86 页
    3-4 NIL(GW2)和GW2 转基因的应用前景第86-88 页
  参考文献第88-91 页
  4、附录第91-98 页
致谢第98-99 页

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