教育论文网

腾冲热泉环境细菌多样性研究及Tepidimonas和Chloroflexi (TK17)类群全基因组分析

硕士博士毕业论文站内搜索    
分类:教育论文网→生物科学论文→微生物学论文
腾冲热泉环境细菌多样性研究及Tepidimonas和Chloroflexi (TK17)类群全基因组分析
论文目录
 
摘要第1-6页
Abstract第6-12页
第1章 前言和文献综述第12-18页
  1.1 极端微生物第12-13页
  1.2 世界范围内热液系统的分布第13页
  1.3 中国境内所分布的热泉第13-15页
  1.4 嗜热生物工程中的应用第15-16页
  1.5 多样性分析第16-17页
  1.6 改良R2A培养基的利用(无碳水化合物)第17页
  1.7 本研究的目的和目标第17-18页
第2章 通过纯培养的方式研究腾冲热泉中的细菌多样性第18-30页
  2.1 前言第18页
  2.2 从腾冲热泉中所收集样品的资料第18页
  2.3 材料与方法第18-21页
    2.3.1 分离培养基第18-19页
    2.3.2 嗜热菌株的纯化和保存第19页
    2.3.3 分离菌株的基因组DNA提取第19-20页
    2.3.4 16S r RNA基因PCR扩增和测序第20页
    2.3.5 16S r RNA基因的聚类分析 (分子系统进化分析)第20-21页
  2.4 结果与分析第21-29页
    2.4.1 中国腾冲热泉中的可培养细菌的多样性研究第21页
    2.4.2 细菌菌株在门水平上的具体分布第21-22页
    2.4.3 在属水平上的细菌菌株的分布第22页
    2.4.4 培养温度对细菌多样性的影响第22-23页
    2.4.5 不同分离培养基中细菌多样性的比较第23-24页
    2.4.6 序列相似性及 16S rRNA基因扩增产物分析第24-28页
    2.4.7 用于分离的高度多样性样品第28-29页
  2.5 结论第29-30页
第3章 新的候选细菌的鉴定第30-56页
  3.1 前言第30页
  3.2 材料与方法第30-33页
    3.2.1 表型鉴定第30页
    3.2.2 形态鉴定第30页
    3.2.3 生理学鉴定第30-31页
    3.2.4 生物化学特征的鉴定第31-32页
    3.2.5 基因组特征第32页
    3.2.6 系统发育分析第32-33页
  3.3 新物种鉴定结果第33-56页
    3.3.1 Meiothermus luteus sp.nov的鉴定第33-38页
    3.3.2 Caldovatus sediminis sp. nov 的物种鉴定第38-43页
    3.3.3 Tepidimonas sediminis sp. nov. 和 Tepidimonas alkaliphilus sp. nov 的物种鉴定第43-48页
    3.3.4 Elioraea thermophilum sp.nov 的物种鉴定第48-52页
    3.3.5 Thermus ochraceum sp. nov.的物种鉴定第52-56页
第4章 Tepidomonas菌株的比较基因组学研究第56-86页
  4.1 前言第56-58页
    4.1.1 Tepidimonas属细菌的特征第56-57页
    4.1.2 本群体的重要性第57-58页
  4.2 材料与方法第58-63页
    4.2.1 Tepidomonas属细菌与其相关的细菌菌株的基因组分析及基因组学研究第58-59页
    4.2.2 系统发育分析评价第59页
    4.2.3 基因组测序和重组装第59页
    4.2.4 直系同源基因簇分析第59-60页
    4.2.5 系统进化分析第60-61页
    4.2.6 平均核苷酸一致性 (ANI)第61-62页
    4.2.7 作为代替DDH法的基因组-基因组遗传距离计算器(GGDC)第62页
    4.2.8 基于基因组序列构建假定的代谢途径第62页
    4.2.9 抗重金属及抗药基因的鉴定第62页
    4.2.10 与生理和生化特征相关假设基因的鉴定第62-63页
    4.2.11 CRISPR分析第63页
    4.2.12 基因组岛第63页
  4.3 结果第63-86页
    4.3.1 新测序菌株的种系发生和全基因组统计第63-65页
    4.3.2 核心和泛基因组分析第65-66页
    4.3.3 遗传多样性和物种分类第66-69页
    4.3.4 Tepidimonas属细菌与Comamonadaceae科内其他物种的系统发育关系第69-71页
    4.3.5 六个基因组的比较第71-78页
    4.3.6 具重金属抗性的基因第78-79页
    4.3.7 直系同源基因及其适应性第79-82页
    4.3.8 成簇的、规律的间隔短回文重复(CRISPRs)第82-83页
    4.3.9 Tepidimonas属细菌的基因组岛第83-85页
    4.3.10 结论第85-86页
第5章 绿弯门的可培养细菌的比较基因组学研究第86-108页
  5.1 前言第86-87页
    5.1.1 绿弯菌门成员的栖息地第86页
    5.1.2 绿弯菌门中的TK17第86-87页
  5.2 材料与方法第87-88页
    5.2.1 YIM 72310T的分离第87页
    5.2.2 形态特征第87页
    5.2.3 系统发育进化分析第87-88页
    5.2.4 基因组测序和组装第88页
    5.2.5 比较基因组学分析第88页
  5.3 结果第88-108页
    5.3.1 分类和特征第88-90页
    5.3.2 菌株YIM 72310T的基因组概况第90-91页
    5.3.3 菌株YIM 72310T和G233T的比较第91-95页
    5.3.4 基因水平转移的证据第95-96页
    5.3.5 两个菌株的蛋白质比较第96-98页
    5.3.6 YIM 72310T菌株与其他Chloroflexi细菌门其他成员的蛋白比较第98-100页
    5.3.7 碳代谢第100-102页
    5.3.8 氮代谢和氨基酸生物合成第102-103页
    5.3.9 硫同化和硫酸盐还原第103-104页
    5.3.10 环境适应性第104-105页
    5.3.11 细胞壁形成第105页
    5.3.12 趋化性和鞭毛形成相关的基因第105页
    5.3.13 单氧酶第105-106页
    5.3.14 乙酰辅酶A(乙酰CoA):辅酶A转移酶第106页
    5.3.15 芳香烃的降解第106页
    5.3.16 胆碱降解和C1氧化第106-107页
    5.3.17 结论第107-108页
第6章 总结与展望第108-109页
参考文献第109-134页
博士期间成果第134-137页
致谢第137页

本篇论文共137页,点击这进入下载页面
 
更多论文
腾冲热泉环境细菌多样性研究及Tepi
影响人多潜能干细胞生物功能的关键
高能重离子碰撞中强子的光子诱导产
手征微扰理论中的介子—重子散射
集值映射的广义度量次正则性
张量特征值的S-型定位集及其应用
缺失数据模型的估计与变量选择
几类传递图及相关弧传递覆盖
C-6、C-7位断裂的对映—贝売杉烷二
独特生境帚状香茶菜中新颖化学成分
石松生物碱Phleghenrine A和(±)-C
弯曲核液晶分子的设计、合成及自组
基于唑—羧酸多官能团配体的金属配
云南东部寒武系第二统澄江生物群和
滇东-黔中寒武系第2统背甲连三叶虫
澄江生物群中林乔利科节肢动物化石
中国东南部秋季降水变异及其与热带
印度季风区大气环流变异与中国低纬
耀变体多波段观测及光变特性研究
对大质量恒星形成区猎户座星云“Or
脉冲星磁层的准谱法模拟和应用
喜冬草谱系地理学研究兼论水晶兰亚
高温放线菌科系统演化与菌丝分化的
甜菜树属与近缘属的系统学研究
优化Context 建模及其在微生物基因
全基因组水平探究家犬温度适应的遗
云南高原湖泊滇池的真菌多样性及其
云南骨碎补类植物鉴别研究
基于MDM4 rs4245739位点探讨癌症与
中国共产党执政伦理研究
边疆与内地一体化进程中的云南吏治
锡石与方解石、斜绿泥石的浮选分离
从自由主义看萧乾的心路历程与文学
人体颈动脉管壁三层膜超声回波信号
HIV-1 gp120构象柔性和装换研究
Ferritin介导营养免疫抵抗鼠伤寒沙
感染调节线虫寿命和免疫遗传的表观
三种鼠尾草属植物中二萜的化学成分
帚状香茶菜中生物活性成分的挖掘及
云南彝族药用昆虫喙尾琵琶甲物质基
独龙牛(Bos frontalis)野生饲用植物
植物生长中茎体状况的超声射频检测
黄河源区沼泽湿地宏观生态变化与气
无机铁盐及铁基MOFs去除富营养化水
功能碳及贵金属纳米材料的制备及其
硫、氮掺杂TiO2的合成及
石蒜科Lycorine型和Phenanthridine
2-氨基吡咯/吡啶与烷硫基喹唑啉类杂
基于区域划分的空间co-location模式
磁控溅射Ge/Si量子点的微结构优化和
高性能白光有机发光二极管的研制
新时代云南普洱边疆民族地区教育优
先秦儒家思想在大学德育中的应用探
强礼仪与弱依附—缅甸乡村社会结构
疏离与聚合:城市化进程中昆明顺城
红河哈尼族奕车女性身体审美研究
古弦新韵——京族独弦琴文化发展历
“回”邻“彝”家的文化共生观—高
南亚东南亚在昆商人的商业实践与文
宗教生活与敬老养老文化研究——基
刚果(金)东北地区族群问题研究
云南白族价值观当代适应性研究
哈尼梯田景观标识的人类学研究
哈尼族传统知识的知识产权问题研究
三台山德昂族乡脱贫攻坚中的博弈问
尼日利亚“博科圣地”问题研究
基于语义网的傣族历史档案信息资源
日常生活与手机实践——云南某哈尼
基于脉冲耦合神经网络与多尺度分析
基于样本和深度学习的图像修复方法
斐波那契树优化算法求解多峰函数理
基于深度学习的云南野生鸟类图像细
两种稀土离子的新型印迹电化学传感
基于深度神经网络的非线性系统辨识
HTTP/2加密网页识别研究
双耳骨传导数字均衡技术研究
基于空间听觉P300的脑机接口技术研
面向在线旅游服务的网络舆情监控与
马克思主义生态观视阈下绿色发展问
长链非编码RNAFantom3_F830212L20调
九龙谷国家森林公园游憩价值评估
自主性支持、基本心理需求满足、学
非线性时间序列分析中几种非参数方
肝吸虫病的数学建模与竞争系统的分
基于CYP450酶探讨人参、炙甘草减轻
辣椒素类TMEM16A抑制剂的发现及分子
启动藻强化短程硝化—厌氧氨氧化反
NiO/α-Ga2O3
一种新型固相萃取与毛细管电泳在线
利用表面预烯基化二氧化硅纳米颗粒
论网络舆情场域视角下的影响性诉讼
韧性断裂准则在复杂加载塑性成形过
染发剂和环境水体中对苯二酚和间苯
日本七鳃鳗NICIR受体克隆表达、抗体
日本七鳃鳗Syk分子的重组表达以及相
静态磁场诱导耐盐偶氮染料降解真菌
惰性中微子对赝标量介子纯轻衰变的
双色圆偏振激光场中的非次序双电离
基于偏振探测的目标偏振特性的研究
隐色道效应对奇异数-1双重子态的影
多夸克态相关研究
空间调制系统的信号检测技术研究
山西培训学校管理人员激励机制研究
细河流域蓝水绿水时空变化研究
S市绿色建筑发展问题及政策研究
 
极端环境论文 细菌群落结构论文 腾冲热泉论文 比较基因组论文
版权申明:目录由用户c**提供,www.51papers.com仅收录目录,作者需要删除这篇论文目录请点击这里
| 设为首页||加入收藏||站内搜索引擎||站点地图||在线购卡|
版权所有 教育论文网 Copyright(C) All Rights Reserved