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陆地棉×黄褐棉种间全基因组SSR高密度遗传图谱的构建

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陆地棉×黄褐棉种间全基因组SSR高密度遗传图谱的构建
论文目录
 
博士学位论文评阅人、答辩委员会签名表第1-6页
摘要第6-7页
Abstract第7-11页
Abbreviation第11-13页
CHAPTER 1 INTRODUCTION第13-35页
  · COTTON CROP第13-14页
    · World Production第13页
    · Growth第13-14页
  · HISTORY AND TAXONOMY第14-17页
    · Cotton Evolution and Polyploidization第15-17页
  · COTTON MOLECULAR BREEDING AND GENETICS第17-18页
  · MOLECULAR MARKERS IN COTTON第18-25页
    · Role of DNA Markers Techniques in Cotton第19-25页
      · Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP)第20页
      · Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD)第20-25页
        · Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP)第21页
        · Simple Sequence Repeats (SSR)第21-22页
        · Inter Simple Sequence Repeats (ISSR)第22页
        · Sequence Related Amplified Polymorphism (SRAP)第22-23页
        · Single Nucleotide Polymorphism (SNPs)第23-25页
        · Important Features of Different Molecular Markers第25页
  · GENETIC MAPPING第25-34页
    · Pre-Requisites for Genetic Maps第26-32页
      · Mapping Population第26-32页
        · Selection of molecular markers for mapping第28-29页
        · Polymorphism screening and genotyping of the mapping population第29页
        · Construction of Map and Linkage analyses第29-30页
        · Test for segregation distortion第30页
        · Establishing linkage groups第30-31页
        · Determining map distance and locus order第31-32页
    · Cotton Genetic Linkage Maps第32-34页
  · OBJECTIVES OF THE STUDY第34-35页
CHAPTER 2 MATERIAL AND METHODS第35-48页
  · PLANT MATERIALS第35页
    · Selection of Parents第35页
    · Population Development第35页
  · PLANT GENOMIC DNA EXTRACTION第35-37页
    · Reagents and Stock solutions Requirement第35-36页
      · CTAB DNA Extraction Buffer第35-36页
      · 1M Tris-HCL第36页
      · ·MEDTA(pH8.0)第36页
    · DNA extraction procedure第36-37页
  · DNA QUANTIFICATION第37-39页
    · Agarose gel electrophoresis第37-38页
      · · XTBE buffer (Tris-Borate-EDTA)第37页
      · Composition of ·% Agarose Gel第37-38页
      · Procedure of Agarose Gel第38页
      · DNA Visualization第38页
    · UV Spectrophotometer第38-39页
  · PCR PRIMERS AND ASSAYS第39-42页
    · PCR Mixture第39页
    · Configuration of PCR Program第39页
    · Poly Acrylamide Gel Electrophoresis (PAGE)第39-42页
      · Stock Solution Requirement第40-41页
      · Preparation for PAGE第41页
      · Loading and Running of Gel第41页
      · Silver Staining Procedure第41-42页
  · SSR PRIMERS USED IN THIS RESEARCH第42-43页
    · PARENTAL SCREENING第43页
    · POPULATION SCREENING WITH SELECTED SSR PRIMER PAIRS第43页
  · GENOTYPING/MARKER DATA ACQUISITION第43-44页
    · GEL SCORING第43-44页
    · POLYMORPHIC PRIMER IDENTIFICATION第44页
  · STATISTICAL ANALYSIS第44-48页
    · MAP CONSTRUCTION第44-45页
    · Coding第45页
    · Data analysis on Join Map ·第45-48页
CHAPTER 3 RESULTS第48-64页
  · PARENTAL SCREENING AND POLYMORPHISM RATIO第48-49页
  · F_1 CONFIRMATION(CRI 12-2X G.MUSTELINUM)第49-50页
  · DNA EXTRACTION AND QUANTIFICATION OF F_2第50页
  · POPULATION GENOTYPING第50-51页
  · GENETIC MAP第51页
  · MAIN FEATURES OF GENETIC MAP第51-52页
  · STRUCTURE CHARACTERIZATION OF LINKAGE MAP第52-53页
  · DUPLICATON,AND REARRANGEMENT IN COTTON第53-64页
CHAPTER4 DISCUSSION第64-69页
  · SELECTION OF MAPPING POPULATION第64-66页
    · SELECTION OF PARENT MATERIAL第64-65页
    · CHOICE OF MAPPING POPULATION第65页
    · POPULATION SIZE第65-66页
  · SELECTION OF MOLECULA MARKERS第66页
  · SEGREGATION DISTORTION REGIONS ARE ASSOCIATED TO COTTON EVOLUTION第66-67页
  · APPLICABILITY OF SSR BASED HIGH DENSITY GENETIC MAP TO BREEDING第67-69页
CONCLUSION第69-71页
REFERENCES第71-81页
ACKNOWLEDGEMENT第81-83页
CURRICULUM VITAE第83 页

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