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新型真菌杂萜的基因挖掘和生物合成

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新型真菌杂萜的基因挖掘和生物合成
论文目录
 
摘要第1-6页
ABSTRACT第6-7页
缩略词和符号第8-14页
第一章 前言第14-42页
    1. 引言第14-15页
    2. 真菌杂萜的生物合成第15-35页
        2.1 聚酮杂萜的生物合成第16-30页
        2.2 吲哚杂萜的生物合成第30-32页
        2.3 其他真菌杂萜的生物合成第32-35页
    3. 本论文研究目的和意义第35页
    4. 本论文研究内容第35-37页
    参考文献第37-42页
第二章 Arthrinium sp. NF2194和Nectria sp. Z14-w的生物信息学分析第42-55页
    2.1 引言第42页
    2.2 实验材料第42-43页
        2.2.1 仪器与耗材第42页
        2.2.2 试剂和工具酶第42-43页
        2.2.3 菌株第43页
        2.2.4 培养基第43页
    2.3 实验方法第43-46页
        2.3.1 生物信息学分析软件第43-44页
        2.3.2 Arthrinium sp. NF2194及Nectria sp. Z14-w总RNA提取第44页
        2.3.3 DNA消化处理、反转录及PCR第44-45页
        2.3.4 生物活性测试第45-46页
    2.4 结果与讨论第46-53页
        2.4.1 AntiSMASH及Augustus预测及分析第46页
        2.4.2 Arthrinium sp. NF2194及Nectria sp. Z14-w中杂萜基因簇的功能注释第46-50页
        2.4.3 Atn和ntn基因簇表达条件优化第50-51页
        2.4.4 Arthrinium sp. NF2194及Nectria sp. Z14-w发酵产物分离第51-52页
        2.4.5 生物活性测试结果第52-53页
    2.5 本章小结第53-54页
    参考文献第54-55页
第三章 Arthripenoid的生物合成研究第55-95页
    3.1 引言第55页
    3.2 实验材料第55-58页
        3.2.1 仪器与耗材第55页
        3.2.2 试剂和工具酶第55-56页
        3.2.3 质粒和菌株第56页
        3.2.4 培养基及各种缓冲盐试剂第56-58页
    3.3 实验方法第58-63页
        3.3.1 载体构建第58-61页
        3.3.2 PEG介导的PCR target第61-62页
        3.3.3 蛋白表达纯化及功能验证第62-63页
        3.3.4 异源表达株及突变株发酵第63页
    3.4 结果与讨论第63-93页
        3.4.1 基因敲除第63-65页
        3.4.2 利用米曲霉A.oryzae NSAR1共表达PKS基因atnG和atnH第65-68页
        3.4.3 AtnJ敲除及体外功能鉴定第68-71页
        3.4.4 萜环合成相关基因功能鉴定第71-73页
        3.4.5 AtnM催化C-1’和C-10’羟基化第73页
        3.4.6 AtnB的体内和体外功能验证第73-76页
        3.4.7 中间产物的化学回补第76页
        3.4.8 Arthripenoid生物合成途径概述第76-77页
        3.4.9 Nectripenoid生物合成途径推测第77-78页
        3.4.10 结构解析第78-93页
    3.5 本章小结第93-94页
    参考文献第94-95页
第四章 总结与展望第95-97页
    4.1 总结第95页
    4.2 展望第95-97页
博士期间发表的论文第97-98页
致谢第98-99页
附录1 新化合物相关图谱第99-131页

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