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植物PME基因家族的分析及白菜PME37c的功能鉴定

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植物PME基因家族的分析及白菜PME37c的功能鉴定
论文目录
 
致谢第1-10页
缩略词第10-14页
摘要第14-16页
Abstract第16-17页
前言第18-20页
1 文献综述第20-40页
    1.1 花粉内壁的发育第21-24页
        1.1.1 花粉发育第21页
        1.1.2 成熟花粉壁的结构第21页
        1.1.3 花粉壁发育过程第21-22页
        1.1.4 参与花粉内壁发育的基因第22-24页
            1.1.4.1 纤维素合成相关基因第22页
            1.1.4.2 果胶合成相关基因第22-23页
            1.1.4.3 果胶侧链修饰相关基因第23页
            1.1.4.4 花粉壁结构蛋白相关基因第23页
            1.1.4.5 其他基因第23-24页
    1.2 PME基因的研究进展第24-28页
        1.2.1 PME蛋白的结构第24-25页
        1.2.2 PME蛋白的性质第25-26页
        1.2.3 PME蛋白的作用模式第26页
        1.2.4 PME蛋白的抑制子第26页
        1.2.5 PME基因在植物生长发育中的功能第26-28页
            1.2.5.1 PME基因在营养生长过程中的功能第27页
            1.2.5.2 PME基因在生殖生长过程中的功能第27-28页
    1.3 CRISPR/Cas9基因编辑技术在植物基因组编辑中的应用第28-40页
        1.3.1 CRISPR/Cas9系统简介第29页
        1.3.2 CRISPR/Cas9基因编辑技术在植物中的应用第29-32页
        1.3.3 CRISPR/Cas9体系被广泛用于植物基因组编辑第32-37页
        1.3.4 在植物中应用CRISPR/Cas9基因编辑技术的流程第37-38页
        1.3.5 CRISPR/Cas9基因编辑技术存在脱靶及其他问题第38-39页
        1.3.6 提高CRISPR/Cas9靶向效率的策略第39页
        1.3.7 获得不含T-DNA的突变体的方法第39-40页
2 白菜等九种植物PME基因家族的鉴定及花发育相关PME的分析第40-54页
    2.1 材料与方法第40-44页
        2.1.1 植物材料和试剂耗材第40页
        2.1.2 植物基因组、基因表达数据及其他生物信息学工具第40-41页
        2.1.3 PME基因家族成员的鉴定第41-43页
        2.1.4 基因表达数据获取及处理第43页
        2.1.5 总RNA的提取及cDNA合成第43页
        2.1.6 白菜PME基因家族qRT-PCR分析第43-44页
        2.1.7 花发育相关PME启动子序列获取及分析第44页
    2.2 结果第44-52页
        2.2.1 白菜等九种植物的PME基因家族成员都较多第44页
        2.2.2 白菜等九种植物709个PME可分为五类第44-46页
        2.2.3 PME家族基因的表达分析第46-49页
        2.2.4 白菜PME基因表达验证第49页
        2.2.5 花序特异或优势表达的PME分析第49-52页
    2.3 讨论第52-54页
        2.3.1 在高等植物中PME基因家族成员都比较多第52页
        2.3.2 众多PME基因参与花序的发育第52-53页
        2.3.3 不同植物参与花序发育的PME在序列上高度保守第53-54页
3 白菜和拟南芥花粉发育相关的四个PME基因序列与表达分析第54-68页
    3.1 材料与方法第54-60页
        3.1.1 植物材料、载体、菌种与主要试剂第54-55页
        3.1.2 DNA、RNA的提取与cDNA的合成第55页
        3.1.3 DNA和CDS的克隆第55-56页
        3.1.4 核酸和蛋白序列分析第56页
        3.1.5 实时荧光定量分析(qRT-PCR)第56页
        3.1.6 启动子融合表达第56-59页
            3.1.6.1 载体构建及农杆菌转化第56-59页
            3.1.6.2 拟南芥浸花转化及转基因植株筛选第59页
            3.1.6.3 启动子融合表达载体转基因拟南芥的观察第59页
        3.1.7 亚细胞定位第59-60页
            3.1.7.1 亚细胞定位载体构建第59页
            3.1.7.2 洋葱表皮瞬时转化第59-60页
            3.1.7.3 亚细胞定位观察第60页
    3.2 结果第60-65页
        3.2.1 BcPME37a、BcPME37b、BcPME37c和AtPME37的启动子、核酸和蛋白质序列分析第60-63页
        3.2.2 BcPME37a、BcPME37b、BcPME37c和AtPME37在花粉中优势或特异表达第63-64页
        3.2.3 表明BcPME37c在花发育晚期表达量较高第64页
        3.2.4 BcPME37c的编码蛋白定位于细胞壁第64-65页
    3.3 讨论第65-68页
        3.3.1 BcPME37a、BcPME37b和AtPME37的功能可能相似第65页
        3.3.2 BcPME37c可能参与成熟花粉的发育和花粉萌发等过程第65-66页
        3.3.3 BcPME37a、BcPME37b和BcPME37c的功能可能有分化第66-68页
4 白菜CRISPR/Cas9基因编辑体系的建立第68-88页
    4.1 材料与方法第68-74页
        4.1.1 植物材料、载体、菌株、主要试剂及常用培养基配方第68-69页
        4.1.2 sgRNA的设计、合成及退火第69页
        4.1.3 CRISPR/Cas9载体的构建第69-72页
        4.1.4 sgRNA-Cas9-121载体对菜心的遗传转化第72-73页
        4.1.5 基因组DNA的提取第73页
        4.1.6 阳性芽及突变类型鉴定第73-74页
        4.1.7 T-DNA插入片段检测第74页
        4.1.8 脱靶检测第74页
    4.2 结果第74-84页
        4.2.1 克隆得到Bra003491、Bra007665和Bra014410基因DNA序列和CDS第74-77页
        4.2.2 构建了单靶点载体并转化菜心得到突变体第77-80页
        4.2.3 构建了多靶点载体并转化菜心得到突变体第80-82页
        4.2.4 CRISPR/Cas9引起的白菜基因突变可以稳定地遗传到T_1代和T_2代第82-83页
        4.2.5 得到了不含T-DNA的Bra003491突变体第83页
        4.2.6 在白菜突变体中未检测到脱靶效应第83-84页
    4.3 讨论第84-88页
        4.3.1 高效菜心CRISPR/Cas9体系的建立第84-85页
        4.3.2 多靶点载体在菜心中实现大片段敲除第85页
        4.3.3 多靶点载体在菜心中实现两个基因的同时编辑第85页
        4.3.4 少数碱基的插入和缺失突变造成蛋白质移码突变或者翻译提早结束第85-86页
        4.3.5 T_0代的突变可以稳定遗传给后代第86页
        4.3.6 通过自交可以得到不含T-DNA的突变体第86页
        4.3.7 三条sgRNA在菜心中没有脱靶第86-88页
5 BcPME37c在白菜花粉发育中的功能鉴定第88-96页
    5.1 材料与方法第88-91页
        5.1.1 植物材料和主要试剂耗材第88页
        5.1.2 敲除突变体的形态学观察第88-89页
        5.1.3 花粉活力检测第89页
        5.1.4 花粉直径测量第89页
        5.1.5 花粉苯胺蓝染色第89页
        5.1.6 花粉DAPI染色第89页
        5.1.7 花粉形态扫描电镜观察第89页
        5.1.8 花粉切片透射电镜观察第89-90页
        5.1.9 结籽率统计第90-91页
    5.2 结果第91-94页
        5.2.1 bcpme37c营养生长及四轮花器官的形态均正常第91-92页
        5.2.2 bcpme37c部分花粉吸胀后直径明显增大第92页
        5.2.3 BcPME37c突变后不影响花粉核的分裂及胼胝质的降解第92页
        5.2.4 bcpme37c部分花粉形态异常第92-93页
        5.2.5 bcpme37c成熟花粉内壁异常加厚第93页
        5.2.6 bcpme37c结籽正常第93-94页
    5.3 讨论第94-96页
        5.3.1 BcPME37c可能通过调控内壁HG的甲酯化程度来影响内壁的建构第94-95页
        5.3.2 bcpme37c表型不太明显可能是基因功能冗余导致第95-96页
结论第96-98页
参考文献第98-110页
附录第110-126页
    附录1 附表和附图第110-123页
    附录2 常用试剂和培养基配方第123-126页
在读期间发表的论文第126页

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