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传染性法氏囊病毒感染的生物标记与细胞SAGE文库的鉴定

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传染性法氏囊病毒感染的生物标记与细胞SAGE文库的鉴定
论文目录
 
论文创新点第10-11 页
摘要第11-13 页
Abstract第13-16 页
研究意义第16-17 页
研究路线第17-18 页
第一部分 文献综述第18-41 页
  第一章 传染性法氏囊病(IBD)第18-25 页
    定义第18-19 页
    简史第19 页
    流行病学第19 页
    抗原性及毒力变异第19-21 页
    发病机理和临床症状第21-23 页
    传染性法氏囊病的诊断第23 页
    预防和控制第23-25 页
  第二章 传染性法氏囊病病毒(IBDV)第25-34 页
    分类第25-26 页
    病毒结构和基因组结构第26-27 页
    理化性质第27 页
    病毒蛋白第27-30 页
    IBDV的复制第30-34 页
  第三章 传染性法氏囊病病毒宿主转录组学研究进展第34-41 页
    Long-SAGE技术在IBDV宿主转录组学研究上的应用第35-37 页
    基因芯片技术在IBDV宿主转录组学研究上的应用第37-40 页
    其他病原宿主转录组研究进展第40-41 页
第二部分 研究内容第41-137 页
  第一章 IBDV对宿主基因表达的影响第41-88 页
    摘要第41-43 页
    1 材料与方法第43-50 页
      · Long-SAGE文库第43 页
      · 单克隆Vero细胞系的培养和总RNA的分离第43-44 页
      · 鸡胚成纤维细胞培养、接毒和总RNA提取第44 页
      · 动物感染试验和法氏囊总RNA提取第44-45 页
      · Real-time PCR引物设计第45-50 页
      · 荧光定量PCR程序第50 页
    2 结果第50-71 页
      · Long-SAGE文库数据登录第50-51 页
      · Long-SAGE文库中表达变化基因汇总第51-61 页
      · 差异表达基因聚类第61-63 页
      · 荧光定量PCR验证第63-68 页
      · IBDV感染对鸡胚成纤维细胞中基因表达的影响第68 页
      · IBDV感染对法氏囊组织中基因表达的影响第68-69 页
      · IBDV感染Vero、CEF和BF的基因表达变化比较第69 页
      · 炎性因子在IBDV感染的CEF细胞中的表达变化第69-70 页
      · 炎性因子在IBDV感染法氏囊组织中的表达变化第70-71 页
    3 讨论第71-88 页
      · IBDV对细胞骨架的影响第71-72 页
      · 免疫相关基因的表达变化第72-73 页
      · mRNA转录及加工相关基因的表达变化第73-74 页
      · 能量代谢相关基因的表达变化第74-75 页
      · 蛋白质合成相关基因的表达变化第75-76 页
      · 细胞增殖相关基因的表达变化第76 页
      · 表达IBDV VP243蛋白Vero细胞的基因表达变化第76-77 页
      · 表达IBDV VP5蛋白Vero细胞的基因表达变化第77 页
      · IBDV感染Vero、CEF和BF的基因表达变化比较第77-78 页
      · 促炎性细胞因子对IBDV致病性的作用第78-88 页
  第二章 IBDV感染条件下Cofilin基因的表达变化第88-99 页
    摘要第88-89 页
    1 材料与方法第89-92 页
      · 细胞、病毒和试剂第89 页
      · CEF细胞的制备与接毒第89 页
      · 间接免疫荧光试验(IFA)第89-90 页
      · Western-blotting鉴定第90 页
      · 合成ADF和Cofilin C端13个氨基酸多肽第90-91 页
      · 多肽偶联第91 页
      · 小鼠免疫第91 页
      · 细胞融合第91-92 页
      · 杂交瘤细胞筛选第92 页
      · 有限稀释法对阳性孔细胞进行克隆化第92 页
      · 以腹水的形式大量制备单克隆抗体第92 页
    2 结果第92-97 页
      · 兔抗Cofilin多抗与Vero细胞和CEF细胞的反应性第92-93 页
      · Cofilin三维结构预测第93 页
      · Cofilin多抗与Cofilin和ADF的反应性分析第93-94 页
      · ADF和Cofilin单克隆抗体的制备第94-95 页
      · IBDV感染CEF的VP3和cofilin蛋白检测第95 页
      · IFA检测IBDV攻毒后肌肉组织和法氏囊组织中的VP3和Cofilin蛋白第95-97 页
    3 讨论第97-99 页
  第三章 传染性法氏囊病病毒VP4、VP3蛋白单克隆及多克隆抗体的制备第99-119 页
    摘要第99-100 页
    1 材料与方法第100-110 页
      · 毒株、载体及主要试剂第100 页
      · 传染性法氏囊病病毒VP4、VP3基因的克隆第100-101 页
      · 原核表达载体和真核表达载体的构建第101 页
      · 连接反应第101-102 页
      · 感受态细胞的制备(CaCl_2法)第102 页
      · 转化第102 页
      · 重组质粒的鉴定第102-103 页
      · 原核表达IBDV VP4、VP3蛋白与鉴定第103-105 页
      · 重组IBDV VP4、VP3蛋白的纯化第105 页
      · 转染级高纯度真核表达质粒的制备第105-106 页
      · 细胞转染与VP4、VP3的真核表达第106 页
      · 间接免疫荧光试验(IFA)第106-107 页
      · 抗IBDV VP3、VP4蛋白单克隆抗体制备第107-109 页
      · CEF细胞制备与接毒第109 页
      · 兔、鸡抗IBDV VP3、VP4多克隆抗体制备第109-110 页
    2 结果第110-117 页
      · RT-PCR扩增第110 页
      · IBDV VP3、VP4基因原核表达载体的构建第110 页
      · VP3、VP4蛋白在E.coli BL21(DE3)中的表达第110-111 页
      · 传染性法氏囊病病毒VP3、VP4蛋白的表达优化与纯化第111-112 页
      · IBDV VP3、VP4基因真核表达载体的构建第112-113 页
      · IBDV VP3、VP4基因在Vero细胞中的表达第113-114 页
      · 抗IBDV VP4、VP3蛋白单克隆抗体的制备第114 页
      · 间接免疫荧光检测单克隆抗体的反应性第114-116 页
      · Western blot检测单克隆抗体的反应性第116 页
      · 兔、鸡抗IBDV VP3、VP4多克隆抗体的制备第116-117 页
    3 讨论第117-119 页
  第四章 不同毒力IBDV感染条件下鸡对VP4、VP3蛋白的免疫应答能力第119-137 页
    摘要第119-120 页
    1 材料与方法第120-123 页
      · 仪器与试剂第120 页
      · 动物感染试验第120-121 页
      · VP3、VP4蛋白ELISA包被浓度的优化第121-122 页
      · 间接ELISA检测鸡血清中抗VP3、VP4抗体第122 页
      · CEF细胞的制备与接毒第122 页
      · 中和试验第122-123 页
    2 结果第123-133 页
      · 攻毒后临床症状第123 页
      · 强弱毒感染血清中抗VP3、VP4抗体的IFA检测结果第123-124 页
      · Western blot检测IBDV感染血清中的VP4蛋白特异性抗体第124-125 页
      · ELISA检测方法中VP3、VP4蛋白包被量的优化第125-126 页
      · IBDV NB株强毒感染血清抗体ELISA监测结果第126-127 页
      · IBDV NB株强毒感染血清VP4抗体ELISA监测结果第127 页
      · IBDV NB株强毒感染血清VP3抗体监测结果第127-128 页
      · IBDV NB株强毒攻毒鸡血清中和抗体与其他抗体的比较第128-129 页
      · VP3、VP4 ELISA抗体与病毒中和抗体的统计学关系第129 页
      · 不同毒力IBDV毒株感染条件下鸡对VP蛋白的免疫应答第129-130 页
      · 不同毒力IBDV感染后的VP4抗体效价第130-132 页
      · IBDV VP4、VP3蛋白在法氏囊组织中的表达分析第132-133 页
    3 讨论第133-137 页
全文总结第137-138 页
参考文献第138-147 页
第三部分 附录第147-161 页
  缩写词索引第147-149 页
  本研究所涉及基因的主要功能第149-153 页
  常用试剂及仪器第153-155 页
  常用缓冲液及培养基配方第155-161 页
致谢第161 页

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