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花生籽仁不同发育时期蛋白质组学分析及CRISPR-Cas9表达载体的构建和转化

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花生籽仁不同发育时期蛋白质组学分析及CRISPR-Cas9表达载体的构建和转化
论文目录
 
致谢第1-10页
摘要第10-12页
第一章 文献综述第12-23页
    1 油料作物种子中的油脂及脂肪酸第12-13页
    2 油脂的生物合成及调控第13-16页
        2.1 植物脂肪酸的生物合成第13-14页
        2.2 植物油脂的生物合成第14-15页
        2.3 油脂脱氢酶FAD2 基因的研究进展第15-16页
            2.3.1 植物FAD2 基因的研究进展第15页
            2.3.2 花生FAD2 基因研究进展第15-16页
    3 种子油脂的降解及调控第16-18页
    4 蛋白质组学及其应用第18-22页
        4.1 蛋白质学研究概述第18页
        4.2 蛋白质组与基因组及转录组第18-19页
        4.3 蛋白质组学研究技术进展第19-20页
        4.4 植物蛋白基因组学第20页
        4.5 国内外植物发育蛋白质组学研究进展第20-22页
            4.5.1 植物种子不同生长阶段的蛋白质组学研究第20-21页
            4.5.2 花生蛋白质组学研究概况第21-22页
    5 本研究的目的意义第22-23页
第二章 花生籽仁不同发育时期脂肪酸积累与降解模式研究第23-31页
    1 引言第23页
    2 材料和方法第23-24页
        2.1 供试材料第23页
        2.2 试验方法第23-24页
            2.2.1 取材方法第23-24页
            2.2.2 不同时期籽仁含油量与脂肪酸含量的测定第24页
    3 结果分析第24-29页
        3.1 粗脂肪在不同生长阶段的积累和代谢第24-25页
        3.2 脂肪酸的相对含量在不同生长阶段的变化第25-27页
        3.3 花生籽仁在发育过程中脂肪酸相对含量与含油量的相关分析第27-28页
        3.4 籽仁萌发后过程中脂肪酸相对含量的相关分析第28-29页
    4 结论与讨论第29-31页
第三章 花生种子在不同发育时期油体的显微结构分析第31-38页
    1 引言第31-32页
    2 材料方法第32-33页
        2.1 试验材料第32页
            2.1.1 试验所需试剂及配置第32页
        2.2 取材方法第32页
        2.3 花生不同发育时期籽仁和萌发后子叶的观测第32页
        2.4 激光共聚焦扫描切片制作与观察第32页
        2.5 图片处理与数据统计第32-33页
    3 结果与分析第33-36页
        3.1 花生籽仁不同发育及萌发后时期的形态特征第33页
        3.2 不同发育时期花生子叶细胞中油体的分布及比较第33-34页
        3.3 不同萌发后时期花生子叶细胞中油体的分布第34-35页
        3.4 不同发育时期花生籽仁子叶细胞内油体含量的统计分析第35-36页
    4 结论与讨论第36-38页
        4.1 花生子叶细胞在不同时期油体动态的细胞学特征变化第36页
        4.2 花生油体与油脂动态变化过程的相关性分析第36页
        4.3 花生油体动态相关蛋白表达变化与油脂积累过程过程的关联性分析第36-38页
第四章 花生种子发育及萌发后不同时期蛋白质组学分析第38-60页
    1 引言第38页
    2 材料与方法第38-44页
        2.1 花生材料第38-39页
        2.2 试验方法第39-44页
            2.2.1 取材方法第39页
            2.2.2 花生子叶总蛋白制备第39页
            2.2.3 SDS‐PAGE电泳检测第39页
            2.2.4 蛋白质的酶解第39-40页
            2.2.5 多肽的i TRAQ标记第40页
            2.2.6 iTRAQ标记多肽的反相色谱分离第40页
            2.2.7 基于QE的液质联用分析第40页
            2.2.8 蛋白质组数据分析第40-41页
            2.2.9 花生种子总RNA的提取第41-42页
            2.2.10 反转录合成cDNA第42页
            2.2.11 引物的设计与合成第42-43页
            2.2.12 RT‐PCR反应体系及程序第43-44页
    3 结果与分析第44-57页
        3.1 花生籽仁不同发育时期及萌发后蛋白质的SDS‐PAGE及图谱分析第44-45页
        3.2 蛋白测序质谱鉴定质量评估‐肽段匹配误差第45页
        3.3 蛋白质质谱基本信息第45-46页
        3.4 GO功能聚类分析及COG注释分析第46-48页
        3.5 差异蛋白筛选结果第48-49页
        3.6 不同时期差异蛋白GO的显著性富集分析第49-51页
        3.7 不同时期差异蛋白pathway的显著性富集分析第51-52页
        3.8 与脂类代谢相关旳差异蛋白第52-55页
        3.9 RT‐PCR验证第55-57页
            3.9.1 总RNA的提取以及检测第55-56页
            3.9.2 有关脂质代谢蛋白的RT‐PCR分析第56-57页
    4 结论与讨论第57-60页
        4.1 发育过程中与油脂合成代谢相关蛋白质的表达变化及功能分析第57-59页
        4.2 萌发过程中与油脂降解相关蛋白的表达变化及功能分析第59-60页
第五章 花生油脂合成关键基因FAD2 基因家族及CRISPR‐Cas9 载体的构建和表达第60-79页
    1.引言第60页
    2 材料与方法第60-67页
        2.1 试验材料第60-62页
            2.1.1 植物材料第60-61页
            2.1.2 菌株与质粒第61页
            2.1.3 试剂耗材第61页
            2.1.4 主要试剂的配置第61-62页
            2.1.5 DNA测序第62页
        2.2 总RNA提取及cDNA的合成第62页
        2.3 基因组DNA的提取第62页
        2.4 发育的花生种子中构建及筛选c DNA文库第62-63页
        2.5 FAD2 基因多重序列比对和系统发育分析第63页
        2.6 实时定量PCR分析第63页
        2.7 CRISPR/Cas9 载体的构建第63-67页
            2.7.1 CRISPR/Cas9 靶点选择第63-64页
            2.7.2 FAD2 基因sg RNA靶位点序列引物的设计第64-65页
            2.7.4 sg RNA与Cas9表达载体的整合第65-66页
            2.7.5 构建好的sgRNA-Cas9 载体转化到农杆菌载体 LBA4404 中及验证第66-67页
            2.7.6 农杆菌介导的转化第67页
    3 结果与分析第67-76页
        3.1 花生FAD2 基因家族成员的克隆与序列分析第67-68页
        3.2 花生AhFAD2 氨基酸序列同源性分析第68-69页
        3.3 花生AhFAD2 基因蛋白的结构域分析第69-72页
        3.4 FAD2 基因的系统进化分析第72-73页
        3.5 AhFAD2 基因不同组织的表达模式第73页
        3.6 CRISPR/Cas9 载体的构建第73-75页
            3.6.1 AhFAD2‐1 基因靶位点的查找及确定第73-74页
            3.6.2 携带FAD2 基因靶位点的sg RNA载体的鉴定第74-75页
            3.6.3 sg RNA‐Cas9载体的构建第75页
        3.7 转基因种子的PCR检测第75-76页
        3.8 靶位点有效性及突变效率的检测第76页
    4 结论与讨论第76-79页
        4.1 花生FAD2 基因家族成员的特性及功能分化第76-77页
        4.2 CRISPR/Cas9体系应用于根癌农杆菌诱导花生的转化第77-78页
        4.3 利用CRISPR/Cas9体系构建花生基因的突变体库第78-79页
第六章 全文结论第79-82页
    6.1 花生种子不同发育及萌发后时期脂肪酸的积累与降解模式第79页
    6.2 花生种子在不同发育及萌发后时期的油体的显微结构分析第79-80页
    6.3 花生种子发育及萌发后时期蛋白质组学分析第80页
    6.4 花生油脂合成关键基因FAD2 基因家族及CRISPPR‐CAS9 载体的构建及表达第80-82页
参考文献第82-101页
英文摘要第101-103页

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