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我国部分地方鸭品种遗传多样性与群体结构分析

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我国部分地方鸭品种遗传多样性与群体结构分析
论文目录
 
中文摘要第1-6页
ABSTRACT第6-13页
缩略词说明第13-14页
第一章 绪论第14-43页
  1 遗传多样性的概念及畜禽遗传资源保护第14-18页
    · 遗传多样性的概念第14-15页
    · 畜禽遗传资源保护第15-18页
      · 畜禽遗传资源保种理论第16页
      · 畜禽遗传资源保种方法第16-18页
  2 我国地方鸭种起源及品种资源概况第18-43页
    · 我国地方鸭品种起源与进化第18页
    · 我国地方鸭品种遗传资源概况第18-20页
    · 地方鸭品种遗传多样性及群体结构研究进展第20-29页
      · 形态水平遗传多样性与群体结构第22页
      · 细胞水平遗传多样性与群体结构第22-23页
      · 生化水平遗传多样性与群体结构第23-24页
      · 分子水平遗传多样性与群体结构第24-29页
    · SSR标记及其在家禽遗传育种研究中的应用第29-38页
      · SSR DNA的发现、结构及分布第29-30页
      · SSR DNA多态性形成的机制及研究方法第30-32页
      · SSR标记的优点第32-33页
      · SSR标记研究的方法第33-34页
      · SSR标记在畜禽遗传育种研究中的应用第34-37页
      · SSR标记的缺陷与不足第37-38页
    · mtDNA的遗传多样性与群体结构分析第38-40页
    · 系统发育树构建方法第40-41页
      · 非加权组平均法(UPGMA)第40页
      · 最小二乘法(LS)第40页
      · 最小进化法(ME)第40页
      · 邻接法(NJ)第40-41页
      · 最大简约法(MP)第41页
      · 最大似然法(ML)第41页
    · 本研究的目的与意义第41-43页
第二章 基于STR分型技术分析我国部分地方鸭品种遗传多样性与群体结构第43-76页
  1 材料与方法第43-50页
    · 样本采集第43-44页
    · SSR引物选择第44页
    · 主要仪器与试剂第44-45页
      · 主要仪器设备第44页
      · 主要试剂第44-45页
    · 主要溶液的配制第45页
    · 鸭基因组总DNA提取第45页
    · PCR反应体系及程序的优化第45-46页
    · PCR产物检测第46-47页
      · 琼脂糖凝胶电泳检测第46页
      · 聚丙烯酰胺凝胶电泳及硝酸银染色第46-47页
    · 基于丙烯酰胺凝胶的基因型判定第47页
    · 荧光引物的筛选与组合第47页
    · 多色PCR扩增产物ABI-3730XL DNA Analyzer检测第47页
    · 统计原理与基因型判定方法第47-50页
      · 统计原理第47-49页
      · 基因型判定方法第49-50页
    · 聚类方法第50页
  2 结果第50-73页
    · 基因组DNA的提取第50-51页
    · 普通PCR扩增产物PAGE电泳检测第51-52页
    · 筛选的标记引物及其组合第52-53页
    · 荧光PCR产物的STR分型第53-54页
    · 所选SSR座位的遗传参数第54-55页
    · 引物在单个群体中的群体遗传学参数第55-57页
      · 等位基因数第55页
      · 多态信息含量第55-56页
      · 杂合度第56页
      · 优势等位基因及频率第56页
      · 特有等位基因及频率第56-57页
      · 共有等位基因第57页
    · F统计量第57-58页
    · 单个群体的遗传学参数分析第58-59页
    · 遗传距离与其初步应用第59-63页
      · 遗传距离第59-60页
      · 基于遗传距离的聚类分析第60-61页
      · 基于遗传距离的分化时间推测第61-62页
      · 基于遗传距离的杂种优势预测第62-63页
    · PCA分析第63-65页
    · 群体结构分析第65-73页
  3 讨论第73-76页
    · 各群体的样本含量第73页
    · SSR引物的选择及标记第73-74页
    · 群体遗传学参数与遗传距离第74-75页
    · PCA与Structure程序分析第75-76页
第三章 基于MTDNA D-LOOP区序列分析我国部分地方鸭品种的遗传结构第76-88页
  1 材料和方法第76-77页
    · 实验材料第76页
    · 实验方法第76-77页
      · mt DNA提取第76页
      · mtDNA D-loop区扩增第76-77页
    · 统计分析第77页
  2 结果与分析第77-86页
    · mtDNA D-loop区扩增效果及测序结果第77-78页
    · 鸭mtDNA D-loop区的碱基组成第78-79页
    · 鸭mtDNAD-loop区遗传结构第79-80页
    · 鸭mtDNA D-loop区遗传多样性第80-84页
    · 聚类分析第84-85页
    · Network网络图分析第85-86页
  3 讨论第86-88页
第四章 基于COI基因序列分析我国部分地方鸭品种的遗传结构第88-99页
  1 材料与方法第88-89页
    · 实验材料第88页
    · 实验方法第88-89页
      · mtDNA的提取第88页
      · mtDNA COI基因的扩增第88-89页
    · 统计分析第89页
  2 结果第89-97页
    · 鸭COI基因扩增效果及测序结果第89-90页
    · 鸭COI基因的碱基组成第90-91页
    · 鸭COI基因的遗传多样性第91-94页
    · 聚类分析第94-96页
    · Network网络图分析第96-97页
  3 讨论第97-99页
第五章 巢湖鸭异地小群保种效果监测第99-103页
  1 材料和方法第99页
    · 实验材料第99页
    · 实验方法第99页
      · 血样采集与基因组DNA提取第99页
      · SSR引物的选择与数据处理第99页
  2 结果与分析第99-101页
    · 荧光PCR扩增产物检测分型结果第99-100页
    · 保种群体与原产地群体优势等位基因的比较第100页
    · 保种群体与原产地群体He、PIC的比较第100-101页
  3 讨论第101-103页
第六章 全文结论第103-104页
参考文献第104-114页
附录第114-120页
致谢第120-121页
攻读学位期间发表的学术论文目录第121-123页

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