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中国不同地理种群环棱螺遗传多样性和分类阶元的研究

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中国不同地理种群环棱螺遗传多样性和分类阶元的研究
论文目录
 
摘要第10-13页
Abstract第13-17页
第一章 文献综述第17-29页
  · 环棱螺的研究现状第17-18页
  2 遗传多样性的研究第18-19页
  3 遗传多样性的研究方法第19-23页
  4 微卫星标记技术在淡水腹足类种群遗传学研究的应用第23-26页
  5 线粒体基因在软体动物种群遗传学研究中的应用第26-28页
    · 物种亲缘关系第26-27页
    · 种群起源、分化与扩散第27-28页
  6 本研究的目的和意义第28-29页
第二章 环棱螺分子系统发育的研究第29-61页
  1 材料和方法第30-48页
    · 样品采集第30-31页
    · DNA提取第31-32页
    · 目的基因引物设计第32页
    · 目的片段的扩增及确认第32-33页
    · 序列比对第33页
    · 序列的核苷酸组成分析第33页
    · 系统发育分析第33-48页
  2 结果与分析第48-56页
    · 四种基因片段序列特征分析第48-49页
    · 遗传分化第49-50页
    · 系统发育分析第50-56页
      · 线粒体COI基因系统发育分析第50-53页
      · 线粒体16S rRNA基因系统发育分析第53-54页
      · 核基因H3系统发育分析第54-55页
      · 核基因28S rRNA系统发育分析第55页
      · COI、16S rRNA、H3和28S rRNA序列联合的系统发育分析第55-56页
  3 讨论第56-61页
    · 四种基因序列变异比较研究第56-57页
    · 环棱螺的分子系统发育分析第57-61页
第三章 我国环棱螺微卫星文库的构建第61-79页
  1 实验材料及来源第61-67页
    · 样品采集第61页
    · 主要仪器设备第61-62页
    · 主要试剂第62页
    · 实验方法及步骤第62-67页
      · 基因组DNA的提取与检测第62-63页
      · 酶切环棱螺基因组DNA第63页
      · 连接反应第63页
      · PCR预扩增第63页
      · PCR预扩增产物与生物素探针杂交第63-64页
      · 磁珠杂交第64页
      · 目的片段的洗脱和回收第64页
      · 目的DNA片段的扩增第64页
      · 扩增产物与pGEM-T easy载体连接第64页
      · 转化,克隆目的基因第64-65页
      · 含微卫星DNA序列的重组子的筛选第65页
      · 测序结果分析第65-66页
      · 微卫星引物设计第66页
      · 多态性微卫星位点的筛选第66页
      · 聚丙烯酰胺凝胶电泳第66页
      · 银染第66页
      · 数据统计及分析第66-67页
  2 结果与分析第67-76页
    · 基因组DNA的质量检测结果第67页
    · 基因组DNA的酶切第67-68页
    · PCR预扩增与目的片段的收集第68页
    · 微卫星阳性克隆的检测及筛选第68-70页
    · 微卫星引物的设计及PCR扩增第70-71页
    · 聚丙烯酰胺凝胶电泳第71页
    · 微卫星位点的多态性分析第71-76页
  3 讨论第76-79页
第四章 环棱螺微卫星标记的遗传结构分析第79-124页
  · 材料和方法第80-83页
    · 样品采集第80页
    · 主要试剂和仪器第80页
    · 基因组DNA的提取第80页
    · 微卫星DNA的扩增第80-81页
    · 微卫星DNA的电泳扫描检测及基因分型第81页
    · 数据分析第81-83页
      · 遗传多样性第81-82页
      · 种群遗传结构分析第82页
      · 地理隔离和基因流第82-83页
  2 结果与分析第83-119页
    · 铜锈环棱螺种群遗结构分析第83-92页
      · 遗传变异和遗传多样性第83-85页
      · 种群间遗传分化第85-86页
      · 地理隔离和基因流第86-89页
      · 种群遗传结构第89-92页
    · 梨形环棱螺种群遗结构分析第92-100页
      · 遗传变异和遗传多样性第92-95页
      · 种群间遗传分化第95页
      · 地理隔离和基因流第95-97页
      · 种群遗传结构第97-100页
    · 方形环棱螺种群遗结构分析第100-108页
      · 遗传变异和遗传多样性第100-102页
      · 种群间遗传分化第102-103页
      · 地理隔离和基因流第103-105页
      · 种群遗传结构第105-108页
    · 双旋环棱螺种群遗传结构分析第108-112页
      · 遗传变异和遗传多样性第108-111页
      · 种群间遗传分化和基因流第111-112页
    · 角形环棱螺种群遗结构分析第112-116页
      · 遗传变异和遗传多样性第112-115页
      · 种群间遗传分化和基因流第115-116页
    · 五种环棱螺共34个种群的遗传结构分析第116-119页
      · 环棱螺的种间遗传变异分析第116-117页
      · 34个种群的主成分判别分析和聚类分析第117-119页
  3 讨论第119-124页
    · 遗传多样性分析第119-121页
    · 种群遗传结构分析第121-124页
第五章 环棱螺COI基因的遗传结构分析第124-144页
  · 材料和方法第124-126页
    · 样本采集第124页
    · 基因组DNA提取第124页
    · 线粒体基因COI的扩增第124-125页
    · 线粒体COI基因的测序第125页
    · 数据分析第125-126页
      · 遗传结构和遗传多样性第125页
      · 谱系生物地理学(phylogeography)分析第125页
      · 群体演化历史分析(Demographic history)第125-126页
  2 结果与分析第126-140页
    · 铜锈环棱螺种群遗传结构分析第126-131页
      · 遗传变异和多样性第126-127页
      · 群体历史动态分析第127-128页
      · COI基因单倍型的网状图第128-129页
      · 种群遗传结构第129-131页
    · 梨形环棱螺种群遗传结构分析第131-135页
      · 遗传变异和多样性第131-132页
      · 群体历史动态分析第132-133页
      · COI基因单倍型的网状图第133-134页
      · 种群遗传结构第134-135页
    · 方形环棱螺种群遗传结构分析第135-139页
      · 遗传变异和多样性第135-137页
      · 群体历史动态分析第137-138页
      · COI基因单倍型的网状图第138页
      · 种群遗传结构第138-139页
    · 三种环棱螺遗传分化分析第139-140页
  3 讨论第140-144页
    · 三种环棱螺的遗传多样性分析第140-141页
    · 群体的历史动态分析第141-142页
    · 三种环棱螺的遗传分化与遗传结构第142-144页
第六章 中国环棱螺形态和齿舌超显微结构的比较第144-175页
  第一节 环棱螺螺壳形态度量的比较研究第145-169页
    1 材料方法第145-147页
      · 材料第145-147页
      · 统计分析第147页
    2 结果与分析第147-167页
      · 铜锈环棱螺10个种群的形态度量学分析第147-152页
        · 主成分分析第147-150页
        · 聚类分析第150页
        · 判别分析第150-152页
      · 梨形环棱螺7个种群的形态度量学分析第152-155页
        · 主成分分析第152-153页
        · 聚类分析第153-154页
        · 判别分析第154-155页
      · 方形环棱螺7个种群的形态度量学分析第155-158页
        · 主成分分析第155-157页
        · 聚类分析第157页
        · 判别分析第157-158页
      · 角形环棱4个种群的形态度量学分析第158-161页
        · 主成分分析第158-159页
        · 聚类分析第159-160页
        · 判别分析第160-161页
      · 双旋环棱螺4个种群的形态度量学分析第161-164页
        · 主成分分析第161-163页
        · 聚类分析第163页
        · 判别分析第163-164页
      · 五种环棱螺32个种群的形态比较研究第164-167页
        · 聚类分析第164-165页
        · 主成分分析第165-167页
    3 讨论第167-169页
  第二节 环棱螺齿舌超显微结构异同第169-175页
    1 材料与方法第169-170页
      · 样本采集第169-170页
      · 齿舌的提取第170页
    2 结果与分析第170-173页
      · 六种环棱螺齿舌的形态描述第170-173页
      · 五种环棱螺齿舌的比较第173页
    3 讨论第173-175页
第七章 中国环棱螺分类阶元的探讨第175-182页
  1 环棱螺的世界分布第175页
  2 环棱螺在中国分布第175页
  3 中国环棱螺分类阶元的探讨第175-182页
    · 从形态度量学探讨5种环棱螺的分类第177-178页
    · 从分子系统发育探讨中国环棱螺的分类第178-179页
    · 种群遗传结构的研究探讨中国环棱螺的分类第179-182页
参考文献第182-196页
附录第196-197页
致谢第197-198 页

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