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榛子花芽转录组文库的Solexa测序及冷调节基因的表达谱分析

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榛子花芽转录组文库的Solexa测序及冷调节基因的表达谱分析
论文目录
 
摘要第1-7页
Abstract第7-19页
第一章 绪论第19-36页
  · 引言第19-31页
    · 研究背景第19-22页
    · 国内外植物抗寒研究现状第22-29页
    · 第二代高通量测序技术第29-31页
  · 研究目的和意义第31-33页
  · 研究目标和主要研究内容第33-35页
    · 研究基础第33页
    · 研究目标第33-34页
    · 主要研究内容第34-35页
  · 研究技术路线第35-36页
第二章 平榛花芽转录组文库的构建及Solexa 测序第36-65页
  · 试验材料第37-38页
    · 植物材料第37-38页
    · 生化试剂第38页
  · 试验方法第38-44页
    · 平榛花芽的转录组样品测序第38-42页
    · 转录组冷调节基因的筛选第42-44页
  · 结果与分析第44-52页
    · RNA 提取第44-45页
    · 原始测序数据产量第45-46页
    · 中级分析结果第46-47页
    · 高级分析结果第47页
    · Scaffold-gene 的GO 分类第47页
    · 蛋白功能和分类预测第47-49页
    · Scaffold-gene 代谢通路分析第49-51页
    · Unigenes 注释第51-52页
  · 冷调节基因的筛选及表达分析第52-64页
    · 冷调节基因的筛选第52-61页
    · 荧光定量分析假定平榛冷调节基因在冷适应过程中的表达第61-62页
    · 假定冷调节基因在不同榛属植物间的表达差异第62-63页
    · 筛选的假定冷调节基因在低温胁迫不同时间的表达差异第63-64页
  · 小结第64-65页
第三章 平榛基因表达分析中稳定内参的选择第65-69页
  · 试验材料第65-66页
  · 试验方法第66页
    · 设计持家基因引物第66页
    · 半定量分析持家基因的表达谱第66页
  · 结果与分析第66-67页
  · 小结第67-69页
第四章 CBF 基因的克隆及功能鉴定第69-87页
  · 材料与方法第69-75页
    · 试验材料第69页
    · 主要试剂第69页
    · 主要仪器第69-70页
    · 实验流程第70-75页
  · 结果与分析第75-86页
    · 平榛ChCBF1 cDNA 全长的获得及序列分析第75-76页
    · 平榛ChCBF1 在不同冷适应时期花芽中的表达分析第76-77页
    · 平榛叶片CBF1 响应低温胁迫的的荧光定量PCR 分析第77页
    · ChCBF1 在平榛不同组织的表达第77-78页
    · 平榛ChCBF2 cDNA 全长的获得及序列分析第78-80页
    · ChCBF2 编码氨基酸区段的同源性分析及系统进化发育第80-82页
    · 平榛ChCBF2 在花芽不同冷适应时期的表达分析第82-83页
    · 平榛CBF2 在4℃低温处理不同时间叶片中的荧光定量PCR 分析第83页
    · ChCBF2 在平榛不同组织的表达第83-84页
    · 半定量分析CBF2 在两种榛属植物中的差异表达第84页
    · 榛属植物间CBF2 基因的序列多态性第84-85页
    · CBF2-GFP 融合蛋白在洋葱表皮中的表达第85-86页
  · 小结第86-87页
第五章 DHN 基因家族成员DHN1 和DHN2 的分子克隆及功能分析第87-119页
  · 试验材料第87页
  · 试验方法第87-97页
    · ChDHN 基因的克隆第87-88页
    · qRT-PCR 分析ChDHN 基因的时空表达第88页
    · pET-30a(+)-DHN2 原核表达载体的构建第88-89页
    · E.coli BL21 原核表达的诱导第89页
    · 聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)第89-90页
    · Western blotting 鉴定融合质粒的表达第90-92页
    · 诱导表达pET-30a(+)-DHN2Y 的大肠杆菌耐低温鉴定第92页
    · 基因组DNA 的提取第92页
    · 启动子序列的分离第92-94页
    · 启动子序列分析第94页
    · 转录起始位点的确定第94页
    · 植物表达载体的构建第94-95页
    · 农杆菌介导的烟草的转化第95-96页
    · 转基因株系的PCR 鉴定第96页
    · 转基因烟草生理指标的测定第96-97页
  · 结果与分析第97-117页
    · DHN1 的克隆及序列分析第97-99页
    · DHN1 基因组DNA 的克隆第99-100页
    · ChDHN1 基因的时空表达第100页
    · 平榛ChDHN2 cDNA 全长的获得及序列分析第100-102页
    · ChDHN2 的时空表达分析第102-103页
    · 重组质粒pET-30a(+)-DHN2Y 的成功构建第103-104页
    · SDS-PAGE 电泳和Western blot 分析第104-105页
    · Western blot 检测重组融合蛋白反应原性第105-106页
    · 异源表达DHN2 基因提高大肠杆菌在低温下的生存能力第106页
    · DHN1 启动子的克隆及分析第106-109页
    · DHN2 基因组序列的克隆第109页
    · ChDHN2 启动子的TAIL-PCR 扩增第109-111页
    · 榛属植物间DHN2 序列的差异第111-112页
    · 植物表达载体PBI121-DHN2Q 的构建第112页
    · 转基因植株的获得及RT-PCR 鉴定第112-113页
    · 转基因株系的表型观察第113-115页
    · 低温处理下野生型和转基因烟草的生理指标差异第115-117页
  · 小结第117-119页
第六章 讨论第119-123页
  · 木本植物抗寒研究的取材第119页
  · 转录组测序和RACE 的结合为挖掘有价值基因搭建了一个强有力的的技术平台第119-120页
  · 转录因子和下游功能基因的表达特点第120-122页
  · 榛属植物冷调节网络模型的构建第122-123页
第七章 结论及进一步研究的设想第123-124页
  · 结论第123页
  · 进一步研究的设想第123-124页
参考文献第124-136页
附录第136-149页
缩略词第149-150页
在读期间的学术研究第150-151页
致谢第151页

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