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棉花体细胞胚发育组学分析及JA和ABA调控的研究

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棉花体细胞胚发育组学分析及JA和ABA调控的研究
论文目录
 
摘要第1-5页
Abstract第5-7页
英文缩略表第7-13页
第一章 背景介绍第13-25页
  · 前言第13-14页
  · 植物体细胞胚胎发生第14-16页
    · 胚性细胞的起始第14-15页
    · 体细胞胚的起始第15页
    · 植物体细胞胚发育和合子胚发育的比较第15-16页
  · 体细胞胚胎发生相关的基因第16-19页
    · 细胞循环和细胞壁相关基因第17页
    · 激素响应基因第17-18页
    · 体细胞胚发育过程中的Marker基因第18-19页
  · 体细胞胚胎发生和合子胚发生的蛋白组和转录组学研究第19-21页
  · SAM和RAM在胚发育过程中的作用第21-23页
  · 利用Sfold软件预测基因靶标序列的VIGS干涉效率第23-25页
第二章 棉花体细胞胚发育的蛋白质组学分析第25-47页
  · 引言第25页
  · 实验材料第25-26页
  · 试验方法第26-29页
    · 改良的酚抽提法提取棉花体细胞胚的总蛋白第26-27页
    · 蛋白质浓度测定第27页
    · SDS电泳第27页
    · 蛋白质酶解第27页
    · iTRAQ标记第27页
    · SCX分离第27-28页
    · 基于Triple TOF 5600的LC-ESI-MSMS分析第28页
    · 肽段序列的鉴定第28页
    · 差异蛋白的鉴定和分析第28-29页
  · 结果与分析第29-44页
    · 正常球形胚和子叶胚的选择第29页
    · 蛋白数据分析和蛋白质的鉴定第29-30页
    · 差异蛋白的功能聚类第30页
    · 候选蛋白的转录水平分析第30-31页
    · 压力响应蛋白影响棉花体细胞胚发育第31-39页
    · 棉花体细胞胚发育过程中的激素代谢和信号转导通路第39页
    · 棉花体细胞胚发育过程中能量和糖代谢动态变化第39-40页
    · 其他差异蛋白的分析第40-42页
    · 外源激素对棉花体细胞胚发育的影响第42-44页
  · 讨论第44-45页
    · 压力和激素响应蛋白调控棉花体细胞胚发育第44-45页
    · 能量和糖代谢的动态变化调控棉花体细胞胚发育第45页
    · 蛋白、脂质、细胞壁代谢和细胞转运影响棉花体细胞胚发育第45页
  · 结论第45-47页
第三章 棉花体细胞胚发育的转录组学分析第47-65页
  · 前言第47页
  · 实验材料第47页
  · 实验方法第47-50页
    · 棉花体细胞胚总RNA的提取第47-48页
    · RNA浓度和质量的测定第48-49页
    · RNA-seq的实验步骤第49页
    · 生物信息学分析第49-50页
  · 结果与分析第50-60页
    · 原始数据质量评估分析第50-51页
    · 样品reads比对到基因和基因组的概率统计第51-53页
    · 样品重复性分析第53页
    · 体细胞胚发育过程中SAM和RAM的动态变化第53-54页
    · 差异表达基因的分析第54-55页
    · 棉花体细胞胚发育过程中的差异事件第55-56页
    · 调控棉花体细胞胚SAM和RAM发育的Marker基因的表达模式分析第56-58页
    · 体细胞胚发育过程中激素互作维持SAM和RAM的发育第58-60页
    · 激素互作调控棉花体细胞胚发育的模式图第60页
  · 讨论第60-64页
    · 差异表达基因聚类分析和石蜡切片揭示棉花体细胞胚发育的动态变化第61页
    · 控制棉花体细胞胚SAM发育成子叶的调控网络第61-62页
    · MP和它的靶标TMO5调控RAM发育成胚根第62-63页
    · 激素互作调控SAM和RAM的干细胞的增殖和分化第63-64页
  · 结论第64-65页
第四章 JA诱导GhMYC3-like表达调控棉花体细胞胚胎发生第65-79页
  · 引言第65页
  · 实验材料第65-66页
    · 材料与种植第65页
    · 菌株与质粒第65-66页
    · 试剂第66页
  · 实验方法第66-69页
    · RNA提取第66页
    · 基因克隆及载体构建第66-67页
    · 棉花遗传转化第67页
    · 培养基的配制第67-69页
    · 石蜡切片制作第69页
    · H_2O_2含量的测定第69页
  · 结果与分析第69-76页
    · 外源茉莉酸诱导棉花次级体细胞胚产生第69-70页
    · JA诱导GhMYC3-like基因的表达第70-71页
    · GhMYC3-like基因的结构域和进化树分析第71-72页
    · GhMYC3-like基因存在与JAZ互作的功能结构域第72-73页
    · GhMYC3-like基因载体构建和转化棉花第73-74页
    · GhMYC3-like基因调控棉花愈伤的生长第74-75页
    · GhMYC3-like基因调控H_2O_2的产生第75-76页
  · 讨论第76-79页
第五章 ABA促进棉花体细胞胚胎发生的机制的研究第79-89页
  · 前言第79-80页
  · 实验材料第80页
    · 材料与种植第80页
    · 试剂第80页
  · 实验方法第80页
    · 体细胞胚取样和激素处理第80页
    · RNA提取第80页
    · 基因克隆和载体构建第80页
    · 棉花遗传转化第80页
    · 培养基配置第80页
    · 石蜡切片制作第80页
  · 结果与分析第80-87页
    · ABA促进次级体细胞胚的产生和成熟第80-81页
    · GA抑制棉花体细胞胚发育第81-83页
    · ABA诱导体细胞胚胎发生Marker基因LEC1、LEC2、FUS3、WUSCHEL的表达第83-84页
    · GhMYB44-1基因及其同源基因的表达模式分析第84-85页
    · GhMYB44-1基因与其同源基因的氨基酸比对和进化树分析第85-86页
    · GhMYB44-1基因促进棉花体细胞胚发育和再生苗的获得第86页
    · 过表达GhMYB44-1基因抑制PP2Cs基因的表达第86-87页
  · 讨论第87-89页
第六章 利用Sfold软件预测VIGS效率及可行性分析第89-101页
  · 前言第89页
  · 材料与方法第89-92页
    · 植物材料和生长条件第89-90页
    · VIGS载体的构建和植物转化第90-91页
    · Sflod软件参数的选择第91页
    · Sfold软件分析靶标序列的指导原则第91页
    · qRT-PCR分析基因干涉水平第91-92页
  · 结果与分析第92-98页
    · △Gdisruption、DSSE和AIS控制干涉效率第92页
    · 利用Sfold预测靶标片段的干涉水平第92-95页
    · VIGS实验验证Sfold预测的GhCLA1和GhPDS干涉水平第95-96页
    · Sfold预测的GhAOSl和GhCXE1的沉默水平与VIGS的实验结果相吻合第96页
    · VIGS在棉花体细胞胚中的应用第96-98页
    · 有效VIGS的干涉过程第98页
  · 讨论第98-101页
第七章 全文结论第101-103页
  · 结论第101页
  · 创新点第101-103页
参考文献第103-115页
附录第115-119页
致谢第119-121页
个人简介第121页

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