基因表达数据分析方法及其应用研究

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基因表达数据分析方法及其应用研究

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基因表达数据分析方法及其应用研究

论文目录
内容提要	第1-5页
摘要	第5-7页
Abstract	第7-14页
第1章绪论	第14-24页
· 引言	第14-15页
· 研究背景和现状	第15-21页
· 生物信息学	第15页
· 基因表达数据分析研究进展	第15-20页
· 基因表达数据分析尚存问题	第20页
· 蛋白质网络中的子网识别研究进展	第20-21页
· 本文工作	第21-24页
· 研究路线和方法	第21-22页
· 主要研究内容和研究结果	第22-24页
第2章基因表达数据分析方法及蛋白质复合物识别	第24-44页
· 引言	第24页
· DNA 微阵列技术	第24-27页
· cDNA 微阵列	第24-26页
· 寡核苷酸芯片	第26-27页
· 基因表达数据分析方法	第27-35页
· 数据预处理	第27-29页
· 差异表达基因分析	第29-32页
· 基因聚类分析	第32-33页
· 基因功能富集分析	第33-35页
· 蛋白质相互作用子网识别方法	第35-36页
· 基因注释数据库	第36-41页
· 基因本体数据库	第37-39页
· KEGG 代谢通路数据库	第39-41页
· 基因表达数据分析软件及网络资源	第41-43页
· 基因表达数据网络资源	第41-42页
· 基因表达数据分析软件	第42-43页
· 本章小结	第43-44页
第3章基因表达数据分析工作流	第44-54页
· 引言	第44页
· 方法设计	第44-47页
· 数据预处理	第44-45页
· 差异表达基因识别	第45-47页
· 基因聚类	第47页
· 基因功能富集分析	第47页
· 实验与分析	第47-52页
· 模拟数据实验与分析	第48-49页
· 乳腺癌数据实验与分析	第49-51页
· 拟南芥数据实验与分析	第51-52页
· 本章小结	第52-54页
第4章基因表达谱模拟数据生成算法	第54-60页
· 引言	第54页
· 基于 K-MEDOIDS 的基因表达谱模拟数据生成算法设计	第54-56页
· 概念定义	第54-55页
· 算法设计	第55-56页
· 实验与分析	第56-59页
· 原始数据与模拟数据对比分析	第56-58页
· 差异表达基因算法检测分析	第58-59页
· 本章小结	第59-60页
第5章一种简单高效的差异表达基因识别算法 MRP	第60-68页
· 引言	第60页
· MRP 算法设计	第60-62页
· 实验与数据分析	第62-67页
· 模拟数据实验分析	第62-63页
· 小鼠数据实验分析	第63-64页
· 拟南芥数据实验分析	第64-67页
· 本章小结	第67-68页
第6章基于元分析的差异表达基因算法 RSDM	第68-82页
· 引言	第68页
· RSDM 算法设计	第68-70页
· 软件系统设计	第70-75页
· 系统流程	第70-71页
· 功能分析	第71-73页
· 系统运行	第73-75页
· 实验与数据分析	第75-80页
· 模拟数据实验分析	第75-78页
· 肺癌数据实验分析	第78-79页
· 拟南芥数据实验分析	第79-80页
· 本章小结	第80-82页
第7章 PPI 网络中基于基因表达谱的子网模块识别算法	第82-90页
· 引言	第82页
· 蛋白质网络中基于基因表达谱的子网模块识别算法设计	第82-85页
· 实验与分析	第85-89页
· 肺癌数据分析	第85-87页
· GO 富集分析	第87-88页
· KEGG Pathway 富集分析	第88-89页
· 本章小结	第89-90页
第8章总结与展望	第90-92页
· 本文工作总结	第90-91页
· 展望	第91-92页
参考文献	第92-108页
作者简介及科研成果	第108-110页
致谢	第110 页

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