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端粒DNA四重折叠结构的检测及其动力学性质的研究

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端粒DNA四重折叠结构的检测及其动力学性质的研究
论文目录
 
中文摘要第1-7 页
Abstract第7-10 页
目录第10-15 页
第一章 文献综述第15-45 页
  1.端粒研究概况第15-26 页
    · 端粒的研究历史第15 页
    · 端粒DNA第15-17 页
      · 端粒序列的测定第15-16 页
      · 端粒序列的组成第16 页
      · 端粒的功能第16-17 页
    1.3.端粒相关蛋白第17-19 页
      · 端粒结合蛋白第17-18 页
        · 双链结合蛋白及其功能第17 页
        · 单链结合蛋白及其功能第17-18 页
      · 招募蛋白第18-19 页
    1.4.端粒酶第19-22 页
      · 端粒酶的结构第19-20 页
        · 端粒酶的RNA部分第19-20 页
        · 端粒酶的催化亚基第20 页
      · 端粒酶相关蛋白第20-21 页
      · 端粒酶的功能第21-22 页
    1.5.端粒、端粒酶与衰老、肿瘤的关系第22-26 页
      · 端粒的缩短第22-23 页
      · 端粒的延长第23-24 页
      · 衰老与肿瘤第24-26 页
        · 细胞衰老及永生化的端粒假说第24 页
        · 端粒酶与肿瘤治疗第24-26 页
          · 反义核苷酸及肽核酸对端粒酶活性的抑制第24 页
          · 核酶对端粒酶活性的抑制第24-25 页
          · 逆转录酶抑制剂对端粒酶活性的抑制第25 页
          · 通过抑制端粒酶底物来抑制端粒酶活性第25-26 页
  2.端粒DNA结构的研究进展第26-41 页
    2.1.G—quadruplex的研究进展第26-34 页
      · G:G配对第26-27 页
      · G—quartet的发现第27-28 页
      · G—quadruplex的种类第28-29 页
      · G—quadruplex的特点第29-31 页
        · 链的极性第29 页
        · 碱基的构象第29-30 页
        · G—quartet的loop环第30-31 页
      · G—quadruplex的离子选择性第31-32 页
      · 与G-quadruplex作用的药物第32-34 页
    · i—motif结构的研究进展第34-41 页
      · i—motif的研究历史第35 页
      · i—motif的种类第35-36 页
      · i—motif性质第36-39 页
        · loop,groove第36-37 页
        · 对称性第37 页
        · 拓扑性第37-38 页
        · 稳定性第38-39 页
      · 生物学意义第39-41 页
  3.DNA结构的研究方法第41-43 页
    · X-射线晶体衍射第41 页
    · 核磁共振(NMR)第41 页
    · 圆二色光谱法(CD)第41-42 页
    · 表面等离子体共振(SPR)第42-43 页
      · 基本原理第42 页
      3.4.2.Biacore工作原理第42 页
      · Biacore的优越性第42-43 页
      · SPR技术在生物学中的应用第43 页
  4.研究的目的和意义第43-45 页
第二章 单链结合蛋白检测四重折叠结构的形成第45-73 页
  · 引言第45-46 页
  · 材料和方法第46-55 页
    · 仪器装置第46 页
    · 实验材料第46-47 页
      · DNA序列合成第46 页
      · 蛋白质和酶第46 页
      · 芯片第46-47 页
      · 试剂盒第47 页
      · 同位素操作第47 页
    · 试剂溶液及配方第47-48 页
    · 实验方法第48-55 页
      · 四重折叠的电泳检测第48-50 页
        · 非变性聚丙烯酰胺凝胶的制备第48-49 页
        · 合成DNA的放射性标记与纯化第49 页
        · 四重折叠的非变性电泳第49-50 页
        · 放射自显影第50 页
      · 四重折叠的HPLC检测第50 页
      · 交联DNA的制备与检测第50-52 页
        · DNA的紫外交联第50-51 页
        · 交联DNA的分离第51 页
        · 交联DNA的纯化第51-52 页
        · 交联DNA的标记第52 页
        · 交联DNA的检测第52 页
      · 凝胶迁移第52 页
      · G链和C链的熔解实验第52-53 页
      · C链的pH滴定实验第53 页
        · 缓冲液的酸碱滴定第53 页
        · C链的酸碱滴定第53 页
      · CM5芯片修饰成SA芯片第53-54 页
      · DNA在芯片上的固定第54 页
      · 单链结合蛋白检测四重折叠结构的形成第54-55 页
        · .SSB检测G—quadruplex的形成第54 页
        · .SSB检测i—motif的形成第54-55 页
  · 实验结果第55-66 页
    · E.coli单链结合蛋白(SSB)检测G链四重折叠第55-61 页
      · SSB只和单链结合,而不结合四重折叠结构第55 页
      · DNA在芯片上的固定第55-58 页
      · 溶液状态下,(TTAGGG)_4形成结构的证明第58-59 页
        · 电泳实验第58 页
        · 熔解实验第58-59 页
      · 单链结合蛋白(SSB)检测(TTAGGG)_4形成四重折叠结构第59-61 页
    · E.coli单链结合蛋白(SSB)检测C链四重折叠第61-66 页
      · (CCCTAA)_4在溶液中形成结构的证明第61-64 页
        · 熔解实验第61 页
        · (CCCTAA)_4的pH滴定实验第61-63 页
        · (CCCTAA)_4的凝胶过滤实验第63-64 页
      · 单链结合蛋白(SSB)检测(CCCTAA)_4形成四重折叠结构第64-66 页
  · 讨论第66-73 页
    · 探针的选择第66-67 页
    · SPR技术对结构的研究第67-70 页
    · 固定DNA的性质第70-71 页
    · 二级结构引起的DNA芯片的假阴性问题第71-73 页
      · DNA芯片技述的发展与应用第71-72 页
      · 二级结构引起的假阴性问题第72-73 页
第三章 四重折叠结构的动力学性质研究第73-93 页
  · 引言第73-74 页
  · 材料和方法第74-79 页
    · 实验材料第74 页
    · 实验方法第74-79 页
      · 折叠和解折叠动力学常数测定的理论推导第74-79 页
      · DNA在芯片上的固定第79 页
      · G链和C链的动力学常数测定第79 页
  · 实验结果第79-88 页
    · 互补链杂交检测四重折叠结构第79-80 页
    · 互补链杂交测定折叠和解折叠速率常数第80-84 页
    · 不同序列的DNA的选择与形成结构的证明第84-88 页
      · 凝胶电泳实验第84-85 页
      · 熔解实验第85-86 页
      · 四个不同序列DNA的动力学常数的测定第86-88 页
  · 讨论第88-93 页
    · 芯片上DNA形成四重折叠结构的定性检测第88 页
    · 四重折叠结构的动力学研究方法第88-90 页
    · 动力学常数的生物学意义第90 页
    · 固定DNA的性质改变第90 页
    · loop和碱基组成对稳定性的影响第90-91 页
    · 技术的拓展应用第91-93 页
研究总结第93-95 页
参考文献第95-109 页
博士研究生期间发表的论文第109-110 页
致谢第110 页

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