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端粒DNA四重折叠结构的检测及其动力学性质的研究
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端粒DNA四重折叠结构的检测及其动力学性质的研究
论文目录
中文摘要
第1-7 页
Abstract
第7-10 页
目录
第10-15 页
第一章 文献综述
第15-45 页
1.端粒研究概况
第15-26 页
· 端粒的研究历史
第15 页
· 端粒DNA
第15-17 页
· 端粒序列的测定
第15-16 页
· 端粒序列的组成
第16 页
· 端粒的功能
第16-17 页
1.3.端粒相关蛋白
第17-19 页
· 端粒结合蛋白
第17-18 页
· 双链结合蛋白及其功能
第17 页
· 单链结合蛋白及其功能
第17-18 页
· 招募蛋白
第18-19 页
1.4.端粒酶
第19-22 页
· 端粒酶的结构
第19-20 页
· 端粒酶的RNA部分
第19-20 页
· 端粒酶的催化亚基
第20 页
· 端粒酶相关蛋白
第20-21 页
· 端粒酶的功能
第21-22 页
1.5.端粒、端粒酶与衰老、肿瘤的关系
第22-26 页
· 端粒的缩短
第22-23 页
· 端粒的延长
第23-24 页
· 衰老与肿瘤
第24-26 页
· 细胞衰老及永生化的端粒假说
第24 页
· 端粒酶与肿瘤治疗
第24-26 页
· 反义核苷酸及肽核酸对端粒酶活性的抑制
第24 页
· 核酶对端粒酶活性的抑制
第24-25 页
· 逆转录酶抑制剂对端粒酶活性的抑制
第25 页
· 通过抑制端粒酶底物来抑制端粒酶活性
第25-26 页
2.端粒DNA结构的研究进展
第26-41 页
2.1.G—quadruplex的研究进展
第26-34 页
· G:G配对
第26-27 页
· G—quartet的发现
第27-28 页
· G—quadruplex的种类
第28-29 页
· G—quadruplex的特点
第29-31 页
· 链的极性
第29 页
· 碱基的构象
第29-30 页
· G—quartet的loop环
第30-31 页
· G—quadruplex的离子选择性
第31-32 页
· 与G-quadruplex作用的药物
第32-34 页
· i—motif结构的研究进展
第34-41 页
· i—motif的研究历史
第35 页
· i—motif的种类
第35-36 页
· i—motif性质
第36-39 页
· loop,groove
第36-37 页
· 对称性
第37 页
· 拓扑性
第37-38 页
· 稳定性
第38-39 页
· 生物学意义
第39-41 页
3.DNA结构的研究方法
第41-43 页
· X-射线晶体衍射
第41 页
· 核磁共振(NMR)
第41 页
· 圆二色光谱法(CD)
第41-42 页
· 表面等离子体共振(SPR)
第42-43 页
· 基本原理
第42 页
3.4.2.Biacore工作原理
第42 页
· Biacore的优越性
第42-43 页
· SPR技术在生物学中的应用
第43 页
4.研究的目的和意义
第43-45 页
第二章 单链结合蛋白检测四重折叠结构的形成
第45-73 页
· 引言
第45-46 页
· 材料和方法
第46-55 页
· 仪器装置
第46 页
· 实验材料
第46-47 页
· DNA序列合成
第46 页
· 蛋白质和酶
第46 页
· 芯片
第46-47 页
· 试剂盒
第47 页
· 同位素操作
第47 页
· 试剂溶液及配方
第47-48 页
· 实验方法
第48-55 页
· 四重折叠的电泳检测
第48-50 页
· 非变性聚丙烯酰胺凝胶的制备
第48-49 页
· 合成DNA的放射性标记与纯化
第49 页
· 四重折叠的非变性电泳
第49-50 页
· 放射自显影
第50 页
· 四重折叠的HPLC检测
第50 页
· 交联DNA的制备与检测
第50-52 页
· DNA的紫外交联
第50-51 页
· 交联DNA的分离
第51 页
· 交联DNA的纯化
第51-52 页
· 交联DNA的标记
第52 页
· 交联DNA的检测
第52 页
· 凝胶迁移
第52 页
· G链和C链的熔解实验
第52-53 页
· C链的pH滴定实验
第53 页
· 缓冲液的酸碱滴定
第53 页
· C链的酸碱滴定
第53 页
· CM5芯片修饰成SA芯片
第53-54 页
· DNA在芯片上的固定
第54 页
· 单链结合蛋白检测四重折叠结构的形成
第54-55 页
· .SSB检测G—quadruplex的形成
第54 页
· .SSB检测i—motif的形成
第54-55 页
· 实验结果
第55-66 页
· E.coli单链结合蛋白(SSB)检测G链四重折叠
第55-61 页
· SSB只和单链结合,而不结合四重折叠结构
第55 页
· DNA在芯片上的固定
第55-58 页
· 溶液状态下,(TTAGGG)_4形成结构的证明
第58-59 页
· 电泳实验
第58 页
· 熔解实验
第58-59 页
· 单链结合蛋白(SSB)检测(TTAGGG)_4形成四重折叠结构
第59-61 页
· E.coli单链结合蛋白(SSB)检测C链四重折叠
第61-66 页
· (CCCTAA)_4在溶液中形成结构的证明
第61-64 页
· 熔解实验
第61 页
· (CCCTAA)_4的pH滴定实验
第61-63 页
· (CCCTAA)_4的凝胶过滤实验
第63-64 页
· 单链结合蛋白(SSB)检测(CCCTAA)_4形成四重折叠结构
第64-66 页
· 讨论
第66-73 页
· 探针的选择
第66-67 页
· SPR技术对结构的研究
第67-70 页
· 固定DNA的性质
第70-71 页
· 二级结构引起的DNA芯片的假阴性问题
第71-73 页
· DNA芯片技述的发展与应用
第71-72 页
· 二级结构引起的假阴性问题
第72-73 页
第三章 四重折叠结构的动力学性质研究
第73-93 页
· 引言
第73-74 页
· 材料和方法
第74-79 页
· 实验材料
第74 页
· 实验方法
第74-79 页
· 折叠和解折叠动力学常数测定的理论推导
第74-79 页
· DNA在芯片上的固定
第79 页
· G链和C链的动力学常数测定
第79 页
· 实验结果
第79-88 页
· 互补链杂交检测四重折叠结构
第79-80 页
· 互补链杂交测定折叠和解折叠速率常数
第80-84 页
· 不同序列的DNA的选择与形成结构的证明
第84-88 页
· 凝胶电泳实验
第84-85 页
· 熔解实验
第85-86 页
· 四个不同序列DNA的动力学常数的测定
第86-88 页
· 讨论
第88-93 页
· 芯片上DNA形成四重折叠结构的定性检测
第88 页
· 四重折叠结构的动力学研究方法
第88-90 页
· 动力学常数的生物学意义
第90 页
· 固定DNA的性质改变
第90 页
· loop和碱基组成对稳定性的影响
第90-91 页
· 技术的拓展应用
第91-93 页
研究总结
第93-95 页
参考文献
第95-109 页
博士研究生期间发表的论文
第109-110 页
致谢
第110 页
本篇论文共
110
页,
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