论文目录 | |
| 摘要 | 第12-14
页 |
| Abstract | 第14-17
页 |
| 第一章 绪论 | 第17-34
页 |
| · 低能电子诱导DNA螺旋的断裂 | 第17-23
页 |
| · 实验研究的进展 | 第18-21
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| · 理论计算的进展 | 第21-23
页 |
| · 金属酶的催化机理研究 | 第23-25
页 |
| · 本论文拟开展的工作 | 第25-28
页 |
| · 低能电子附着诱导DNA螺旋断裂的理论研究 | 第25-26
页 |
| · 金属酶催化过程的反应机理研究 | 第26-28
页 |
| 参考文献 | 第28-34
页 |
| 第二章 计算方法 | 第34-50
页 |
| · 密度泛函理论(Density Functional Theory) | 第34-39
页 |
| · Thomas-Fermi理论和Hohenberg-Kohn-Sham理论 | 第35-36
页 |
| · 局域密度近似 | 第36-37
页 |
| · 广义梯度近似 | 第37-38
页 |
| · 杂化泛函 | 第38-39
页 |
| · 量子力学/分子力学组合方法(Combined QM/MM Methods) | 第39-45
页 |
| · QM/MM组合方法的能量表达式 | 第40
页 |
| · 静电势项 | 第40-42
页 |
| · 机械嵌入(Mechanical Embedding) | 第40-41
页 |
| · 静电场嵌入(Electrostatic Embedding) | 第41
页 |
| · 极化嵌入(Polarized Embedding) | 第41-42
页 |
| · 其它的非键和成键相互作用 | 第42
页 |
| · QM/MM边界原子的处理 | 第42-43
页 |
| · QM/MM计算方法的架构 | 第43-45
页 |
| 参考文献 | 第45-50
页 |
| 第三章 嘌呤碱基脱氢过程的密度泛函研究 | 第50-63
页 |
| · 前言 | 第50-51
页 |
| · 计算方法 | 第51
页 |
| · 结果与讨论 | 第51-58
页 |
| · 腺嘌呤和鸟嘌呤的几何构型和自然布居分析 | 第51-52
页 |
| · 脱氢的自由基和阴离子的稳定性研究 | 第52-53
页 |
| · 电子亲合能和热力学性质的研究 | 第53-55
页 |
| · 势能面 | 第55-57
页 |
| · 电子结构性质 | 第57-58
页 |
| · 结论 | 第58-60
页 |
| 参考文献 | 第60-63
页 |
| 第四章 腺嘌呤-胸腺嘧啶碱基对脱氢过程的密度泛函研究 | 第63-80
页 |
| · 前言 | 第63-64
页 |
| · 计算方法 | 第64-65
页 |
| · 结果与讨论 | 第65-74
页 |
| · 脱氢化自由基和阴离子的几何构型和相对能量 | 第65-69
页 |
| · 自然布居分析 | 第69
页 |
| · 电子亲合能和热力学性质 | 第69-71
页 |
| · 脱氢分解能 | 第71-72
页 |
| · 脱氢碎片化的势能面曲线和电子结构性质 | 第72-74
页 |
| · 结论 | 第74-75
页 |
| 参考文献 | 第75-80
页 |
| 第五章 电子附着诱导嘧啶核苷C-O和C-N键断裂的理论研究 | 第80-94
页 |
| · 前言 | 第80-81
页 |
| · 计算方法 | 第81
页 |
| · 结果与讨论 | 第81-88
页 |
| · 几何构型和电荷分布 | 第81-83
页 |
| · 电子亲合能 | 第83-84
页 |
| · C_(5′)-O_(5′)和C_(1′)-N_1键的分解能 | 第84-86
页 |
| · C_(5′)-O_(5′)和C_(1′)-N_1键的活化能垒 | 第86-88
页 |
| · 结论 | 第88-90
页 |
| 参考文献 | 第90-94
页 |
| 第六章 固氮酶活性位铁钼辅酶中空隙原子的理论探索 | 第94-106
页 |
| · 前言 | 第94
页 |
| · 计算方法 | 第94-95
页 |
| · 结果和讨论 | 第95-100
页 |
| · 几何构型 | 第96-97
页 |
| · FeMoco(μ_6-X)簇中CO和N_2的配位 #8 | 第97-100
页 |
| · FeMoco(μ_6-X)簇的氧化还原势 | 第100
页 |
| · 结论 | 第100-102
页 |
| 参考文献 | 第102-106
页 |
| 第七章 CO脱氢酶反应中间体的计算表征 | 第106-117
页 |
| · 前言 | 第106-107
页 |
| · 计算方法 | 第107-108
页 |
| · 结果和讨论 | 第108-113
页 |
| · 结论 | 第113-114
页 |
| 参考文献 | 第114-117
页 |
| 第八章 硝酸根还原酶反应机理的密度泛函研究 | 第117-129
页 |
| · 前言 | 第117-118
页 |
| · 计算方法 | 第118-119
页 |
| · 结果和讨论 | 第119-125
页 |
| · 几何构型 | 第119-120
页 |
| · 反应机理 | 第120-125
页 |
| · 质子化和电子还原步骤 | 第125
页 |
| · 结论 | 第125-126
页 |
| 参考文献 | 第126-129
页 |
| 发表论文 | 第129-130
页 |
| 致谢 | 第130页 |
