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集成微流控芯片及单细胞基因表达检测研究

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集成微流控芯片及单细胞基因表达检测研究
论文目录
 
摘要第1-6页
Abstract第6-16页
第1章 绪论第16-32页
  1.1 课题来源第16页
  1.2 课题研究背景和意义第16-20页
    1.2.1 微流控芯片研究背景和意义第16-19页
    1.2.2 单细胞基因表达检测研究背景和意义第19-20页
  1.3 国内外相关技术发展概况第20-31页
    1.3.1 微流控芯片国内外发展概况第20-25页
    1.3.2 单细胞基因表达国内外研究概况第25-28页
    1.3.3 目前研究存在的问题第28-31页
  1.4 本文主要研究内容第31-32页
第2章 集成微流控芯片研制第32-52页
  2.1 集成微流控芯片设计第32-38页
    2.1.1 两类芯片总体布局第32-34页
    2.1.2 细胞操纵单元设计第34-35页
    2.1.3 芯片微流通道设计第35-36页
    2.1.4 气动液压微阀设计第36-37页
    2.1.5 多路复用微阀网络设计第37页
    2.1.6 生化反应微腔设计第37-38页
  2.2 含加热器的微传感器设计与传热性能评估第38-46页
    2.2.1 含加热器的微传感器设计第38-40页
    2.2.2 单工作单元式芯片传热理论建模第40-42页
    2.2.3 单工作单元式芯片传热数值求解第42页
    2.2.4 单工作单元式芯片温控性能分析第42-45页
    2.2.5 阵列式芯片传热过程仿真分析第45-46页
  2.3 微流控芯片工艺设计与实现第46-51页
    2.3.1 芯片加工环境第46-47页
    2.3.2 总体工艺路线第47-48页
    2.3.3 芯片工艺实现过程第48-51页
  2.4 本章小结第51-52页
第3章 单细胞基因表达检测系统设计与构建第52-69页
  3.1 单细胞基因表达检测试验系统总体设计第52-53页
  3.2 微流控平台设计与构建第53-57页
    3.2.1 微流动层控制硬件组成第53-54页
    3.2.2 气动层流动控制硬件组成第54-55页
    3.2.3 微流控策略与步骤第55-57页
  3.3 芯片温控平台设计与构建第57-61页
    3.3.1 芯片温控总体方案第57-58页
    3.3.2 硬件设备组成第58页
    3.3.3 温控程序设计第58-61页
  3.4 细胞培养与传代试验平台构建第61-66页
    3.4.1 细胞培养环境构建第62-63页
    3.4.2 生物试验环境构建第63-64页
    3.4.3 细胞传代步骤第64-65页
    3.4.4 细胞悬液密度控制方法第65-66页
  3.5 生物分子荧光信号检测与分析平台设计与构建第66-68页
    3.5.1 荧光显微镜工作参数选择第66-68页
    3.5.2 信号采集与数据分析第68页
  3.6 本章小结第68-69页
第4章 单细胞操纵流-固耦合动力学仿真分析第69-95页
  4.1 流-固耦合建模基础第69-71页
    4.1.1 无量纲数第69-70页
    4.1.2 仿真模型求解方法第70-71页
  4.2 流-固耦合动力学有限元建模方法第71-77页
    4.2.1 有限元弱形式离散第71-73页
    4.2.2 ALE流固耦合动力学描述第73-75页
    4.2.3 瞬态问题动网格平滑处理第75-76页
    4.2.4 建模关键参数与边初条件第76-77页
  4.3 单工作单元式芯片模型求解与分析第77-90页
    4.3.1 网格独立性分析第77-78页
    4.3.2 瞬态求解器对比分析第78-79页
    4.3.3 流-固两相场耦合分析第79-81页
    4.3.4 载流中细胞力学行为解析第81-87页
    4.3.5 3D模型参数化求解与分析第87-90页
  4.4 微流控阵列式芯片模型求解与分析第90-94页
  4.5 本章小结第94-95页
第5章 集成微流控单细胞基因表达检测方法与试验第95-115页
  5.1 温度传感器校验与温控性能评估第95-98页
    5.1.1 温度传感器校验准备第95-96页
    5.1.2 校验方法与结果分析第96-97页
    5.1.3 芯片全程温控性能评估第97-98页
  5.2 荧光信号检测系统背景噪声评估第98-99页
    5.2.1 校验方法与步骤第98-99页
    5.2.2 检测系统的荧光噪声分析第99页
  5.3 微磁珠总量优选分析第99-102页
    5.3.1 微磁珠总量优选试验设计与步骤第100页
    5.3.2 Oligo(dT)_(25)微磁珠对PCR终点产量影响分析第100-102页
  5.4 基于XenoRNA样本的微磁珠捕捉容量分析第102-104页
    5.4.1 试验设计思想第102-103页
    5.4.2 XenoRNA样本二次捕捉试验步骤第103页
    5.4.3 Oligo(dT)_(25)微磁珠对XenoRNA的捕捉容量分析第103-104页
  5.5 集成微流控方法评估第104-105页
    5.5.1 PDMS材料表面化学修饰第104-105页
    5.5.2 微流控XenoRNA样本RT-qPCR试验设计第105页
    5.5.3 微流控XenoRNA样本RT-qPCR结果分析第105页
  5.6 微流控qPCR效率及检测灵敏度分析第105-107页
    5.6.1 微流控qPCR效率、灵敏度试验设计与步骤第105-106页
    5.6.2 微流控qPCR与传统方法的对比分析第106-107页
  5.7 水动力单细胞捕捉效率分析第107-109页
    5.7.1 单细胞捕捉试验设计与步骤第107-108页
    5.7.2 水动力单细胞捕捉效率分析第108-109页
  5.8 单细胞化学裂解/混合时间优选分析第109-110页
    5.8.1 试验设计与步骤第109-110页
    5.8.2 单细胞化学裂解/混合时间对PCR终点产量影响分析第110页
  5.9 MCF-7 单细胞CDKN1A基因表达检测与分析第110-114页
    5.9.1 单细胞基因表达检测试验设计与步骤第111页
    5.9.2 MMS诱导单细胞CDKN1A基因表达检测第111-114页
  5.10 本章小结第114-115页
第6章 平行化微流控单细胞基因表达检测方法与试验第115-132页
  6.1 阵列式芯片温度传感器校验与评估第115-116页
  6.2 微磁珠平行化Xeno RNA样本捕捉容量分析第116-118页
    6.2.1 试验设计与步骤第116-118页
    6.2.2 Oligo(dT)_(25)微磁珠对XenoRNA的平行化捕捉容量分析第118页
  6.3 微流控平行化RT-qPCR可行性分析第118-120页
    6.3.1 XenoRNA与单细胞GAPDH转录水平检测设计与步骤第118-119页
    6.3.2 微流控平行化XenoRNA与GAPDH转录水平检测第119-120页
  6.4 阵列式芯片平行化RT-qPCR可重复性分析第120-121页
    6.4.1 多单元RT-qPCR试验设计与步骤第120页
    6.4.2 阵列式芯片平行化RT-qPCR可重复性分析第120-121页
  6.5 平行化qPCR效率及检测灵敏度分析第121-123页
    6.5.1 效率及灵敏度试验设计与骤第121页
    6.5.2 阵列式芯片平行化qPCR与传统方法的对比研究第121-123页
  6.6 平行化单细胞基因表达检测与分析第123-126页
    6.6.1 单细胞GAPDH与CDKN1A基因表达检测试验设计与步骤第123-124页
    6.6.2 阵列式芯片平行化单细胞两类基因表达检测结果分析第124-126页
  6.7 平行化MMS诱导单细胞基因表达检测与分析第126-128页
    6.7.1 MMS诱导单细胞两类基因表达检测试验设计与步骤第126页
    6.7.2 MMS诱导单细胞两类基因表达检测结果分析第126-128页
  6.8 MMS剂量对CDKN1A表达上调作用分析第128-129页
    6.8.1 CDKN1A表达水平检测试验设计与步骤第128页
    6.8.2 MMS剂量对CDKN1A表达上调作用分析第128-129页
  6.9 MMS处理时间对CDKN1A表达上调作用分析第129-131页
    6.9.1 CDKN1A表达水平检测试验设计与步骤第130页
    6.9.2 MMS处理时间对CDKN1A表达上调作用分析第130-131页
  6.10 本章小结第131-132页
结论第132-134页
参考文献第134-143页
附录1 网格剖分精度分析第143-144页
附录2 网格独立性分析第144-149页
攻读博士学位期间发表的论文及其它成果第149-151页
致谢第151-152页
个人简历第152页

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