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基于数据驱动的非编码基因功能注释方法研究
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基于数据驱动的非编码基因功能注释方法研究
论文目录
提要
第1-6页
摘要
第6-8页
Abstract
第8-15页
第1章 绪论
第15-27页
1.1 研究背景
第15-19页
1.1.1 人类基因组计划
第15-16页
1.1.2 DNA 原件百科全书
第16-17页
1.1.3 非编码 RNA
第17页
1.1.4 长非编码 RNA
第17-19页
1.2 国内外研究现状
第19-23页
1.2.1 基于数据驱动的生物网络构造
第19-21页
1.2.2 生物网络与非编码基因功能研究
第21-22页
1.2.3 疾病相关非编码基因研究
第22-23页
1.3 研究内容及意义
第23-24页
1.4 论文组织结构
第24-27页
第2章 非编码基因特征研究
第27-41页
2.1 引言
第27-28页
2.2 非编码基因生物统计特征分析
第28-34页
2.2.1 lncRNA 平面构象
第28-31页
2.2.2 lncRNA 密码子替换频率
第31-32页
2.2.3 lncRNA 核苷酸三聚体分布
第32-33页
2.2.4 lncRNA 序列保守性分析
第33页
2.2.5 lncRNA 开放读码框特征
第33-34页
2.3 LNCRNA 功能特异性分析
第34-36页
2.4 鉴定 RNA
第36-38页
2.4.1 发现新的 lncRNA
第36-37页
2.4.2 lncRNA 与 mRNA 区别
第37-38页
2.5 非编码基因数据库
第38-39页
2.6 本章小结
第39-41页
第3章 基于数据驱动的编码基因功能注释
第41-63页
3.1 生物芯片非编码基因重注释
第41-48页
3.1.1 HG-U133A 芯片平台
第41页
3.1.2 芯片探针定义重注释
第41-44页
3.1.3 HG U133A 重注释结果与分析
第44-48页
3.2 非编码基因功能预测
第48-54页
3.2.1 芯片数据数据预处理
第48-49页
3.2.2 构建共表达网络
第49-53页
3.2.3 功能预测
第53-54页
3.3 算法性能评价
第54-57页
3.3.1 随机网络对比实验
第54页
3.3.2 预测精确度、特异性
第54-57页
3.4 人类非编码基因功能预测结果及分析
第57-60页
3.5 本章小结
第60-63页
第4章 基于傅立叶分析的非编码持家基因鉴定
第63-81页
4.1 引言
第63页
4.2 傅立叶谱构造
第63-67页
4.2.1 基因表达时序数据选择
第64-65页
4.2.2 时序数据预处理
第65-67页
4.3 鉴定持家基因
第67-69页
4.3.1 持家基因样本分类
第67-68页
4.3.2 识别和提取 HKG 谱的特征信息
第68-69页
4.4 持家基因鉴定结果
第69-71页
4.5 预测性能分析
第71-76页
4.5.1 利用组织表达谱评价预测性能
第73-74页
4.5.2 验证 HKG 预测结果与评价
第74-76页
4.6 预测结果分析
第76-78页
4.7 本章小结
第78-81页
第5章 总结与展望
第81-83页
5.1 论文工作总结
第81-82页
5.2 未来工作方向
第82-83页
参考文献
第83-95页
作者简介及在学期间所取得的科研成果
第95-96页
致谢
第96页
本篇论文共
96
页,
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。
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