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基于数据驱动的非编码基因功能注释方法研究

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基于数据驱动的非编码基因功能注释方法研究
论文目录
 
提要第1-6页
摘要第6-8页
Abstract第8-15页
第1章 绪论第15-27页
  1.1 研究背景第15-19页
    1.1.1 人类基因组计划第15-16页
    1.1.2 DNA 原件百科全书第16-17页
    1.1.3 非编码 RNA第17页
    1.1.4 长非编码 RNA第17-19页
  1.2 国内外研究现状第19-23页
    1.2.1 基于数据驱动的生物网络构造第19-21页
    1.2.2 生物网络与非编码基因功能研究第21-22页
    1.2.3 疾病相关非编码基因研究第22-23页
  1.3 研究内容及意义第23-24页
  1.4 论文组织结构第24-27页
第2章 非编码基因特征研究第27-41页
  2.1 引言第27-28页
  2.2 非编码基因生物统计特征分析第28-34页
    2.2.1 lncRNA 平面构象第28-31页
    2.2.2 lncRNA 密码子替换频率第31-32页
    2.2.3 lncRNA 核苷酸三聚体分布第32-33页
    2.2.4 lncRNA 序列保守性分析第33页
    2.2.5 lncRNA 开放读码框特征第33-34页
  2.3 LNCRNA 功能特异性分析第34-36页
  2.4 鉴定 RNA第36-38页
    2.4.1 发现新的 lncRNA第36-37页
    2.4.2 lncRNA 与 mRNA 区别第37-38页
  2.5 非编码基因数据库第38-39页
  2.6 本章小结第39-41页
第3章 基于数据驱动的编码基因功能注释第41-63页
  3.1 生物芯片非编码基因重注释第41-48页
    3.1.1 HG-U133A 芯片平台第41页
    3.1.2 芯片探针定义重注释第41-44页
    3.1.3 HG U133A 重注释结果与分析第44-48页
  3.2 非编码基因功能预测第48-54页
    3.2.1 芯片数据数据预处理第48-49页
    3.2.2 构建共表达网络第49-53页
    3.2.3 功能预测第53-54页
  3.3 算法性能评价第54-57页
    3.3.1 随机网络对比实验第54页
    3.3.2 预测精确度、特异性第54-57页
  3.4 人类非编码基因功能预测结果及分析第57-60页
  3.5 本章小结第60-63页
第4章 基于傅立叶分析的非编码持家基因鉴定第63-81页
  4.1 引言第63页
  4.2 傅立叶谱构造第63-67页
    4.2.1 基因表达时序数据选择第64-65页
    4.2.2 时序数据预处理第65-67页
  4.3 鉴定持家基因第67-69页
    4.3.1 持家基因样本分类第67-68页
    4.3.2 识别和提取 HKG 谱的特征信息第68-69页
  4.4 持家基因鉴定结果第69-71页
  4.5 预测性能分析第71-76页
    4.5.1 利用组织表达谱评价预测性能第73-74页
    4.5.2 验证 HKG 预测结果与评价第74-76页
  4.6 预测结果分析第76-78页
  4.7 本章小结第78-81页
第5章 总结与展望第81-83页
  5.1 论文工作总结第81-82页
  5.2 未来工作方向第82-83页
参考文献第83-95页
作者简介及在学期间所取得的科研成果第95-96页
致谢第96页

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