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人增生性瘢痕IncRNA和circRNA差异表达分析及自噬、外泌体干预研究

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人增生性瘢痕IncRNA和circRNA差异表达分析及自噬、外泌体干预研究
论文目录
 
摘要第1-7页
abstract第7-16页
缩略词中英文对照第16-19页
前言第19-25页
第1章 人皮肤增生性瘢痕与正常皮肤组织中lncRNA和circRNA的差异表达分析第25-89页
1 实验材料第25-29页
  1.1 研究对象第25-26页
    1.1.1 样本来源与分组第25-26页
    1.1.2 样本采集第26页
  1.2 实验材料第26-29页
    1.2.1 主要试剂第26-27页
    1.2.2 主要仪器设备第27-28页
    1.2.3 数据库及分析软件第28-29页
2 实验方法第29-42页
  2.1 高通量测序检测lncRNA、circRNA和mRNA在人增生性瘢痕与正常皮肤组织中的表达第29-33页
    2.1.1 增生性瘢痕及正常皮肤组织总RNA提取第30-31页
    2.1.2 总RNA质检第31页
    2.1.3 测序第31-33页
  2.2 HS相关lncRNA、circRNA和mRNA生物信息学分析第33-42页
    2.2.1 测序质量评估第33-36页
    2.2.2 实时荧光定量PCR实验对测序结果进行验证第36-40页
    2.2.3 统计学处理第40页
    2.2.4 基因相关分析第40-42页
3 结果第42-85页
  3.1 RNA质检结果第42-43页
  3.2 测序质量评估结果第43-46页
    3.2.1 碱基质量分布第43-44页
    3.2.2 BaseContent分布第44页
    3.2.3 GCContent分布第44-45页
    3.2.4 SequenceBaseQuality第45-46页
  3.3 参考信息比对结果第46-50页
    3.3.1 比对结果基本统计第46-47页
    3.3.2 比对区域分布统计第47-49页
    3.3.3 比对结果质控分析结果第49-50页
  3.4 基于表达量的测序质量评估结果第50-54页
    3.4.1 样品表达模式第50-51页
    3.4.2 测序饱和度第51-52页
    3.4.3 基因覆盖均一度第52-53页
    3.4.4 PCA分析第53-54页
  3.5 生物信息学分析第54-81页
    3.5.1 两组样本mRNA相关生物信息学分析第54-59页
    3.5.2 两组样本lncRNA相关生物信息学分析第59-75页
    3.5.3 两组样本circRNA相关生物信息学分析第75-81页
  3.6 qRT-PCR验证结果第81-82页
  3.7 两组样本差异基因的网络构建及功能分析第82-85页
    3.7.1 差异表达基因的CNC网络构建及分析第82-84页
    3.7.2 差异表达基因的ceRNA网络构建与分析第84-85页
4 讨论第85-89页
第2章 自噬及外泌体干预后体外培养人增生性瘢痕成纤维细胞lncRNA和circRNA的表达变化第89-130页
一、细胞自噬与增生性瘢痕第89页
二、外泌体与增生性瘢痕第89-130页
1 实验材料第90-92页
  1.1 研究对象第90-91页
  1.2 实验材料第91-92页
2 实验方法第92-98页
  2.1 体外培养人增生性瘢痕皮肤成纤维细胞第92-94页
    2.1.1 组织块法培养人增生性瘢痕皮肤成纤维细胞第92页
    2.1.2 成纤维细胞的传代培养第92-93页
    2.1.3 成纤维细胞的冻存第93页
    2.1.4 成纤维细胞的复苏第93-94页
  2.2 人羊膜间充质干细胞的分离与培养第94-95页
  2.3 羊膜间充质干细胞上清液中外泌体的分离与纯化第95页
  2.4 实验细胞分组第95页
  2.5 细胞RNA提取第95-96页
  2.6 细胞RNA质检第96页
    2.6.1 微量分光光度计检测浓度及纯度第96页
    2.6.2 琼脂糖凝胶电泳检测RNA完整性第96页
  2.7 细胞RNA测序第96-97页
  2.8 细胞RNA相关生物学分析第97-98页
  2.9 统计学处理第98页
3 结果第98-123页
  3.1 RNA质检结果第98-99页
  3.2 测序质量评估结果第99-102页
    3.2.1 测序数据整理和过滤第99-100页
    3.2.2 碱基质量分布第100-101页
    3.2.3 BaseContent分布第101页
    3.2.4 GCContent分布第101-102页
    3.2.5 SequenceBaseQuality第102页
  3.3 参考信息比对结果第102-106页
    3.3.1 比对结果基本统计第102-103页
    3.3.2 比对区域分布统计第103-105页
    3.3.3 比对结果质控分析结果第105-106页
  3.4 基于表达量的测序质量评估结果第106-109页
    3.4.1 样品表达模式第106-107页
    3.4.2 测序饱和度第107页
    3.4.3 基因覆盖均一度第107-108页
    3.4.4 PCA分析第108-109页
  3.5 生物信息学分析第109-123页
    3.5.1 三组样本差异表达的RNA聚类分析第109页
    3.5.2 A与B两组样本测序结果相关生物信息学分析第109-116页
    3.5.3 A与C两组样本测序结果相关生物信息学分析第116-123页
4 讨论第123-130页
  4.1 增生性瘢痕中细胞自噬与lncRNA、circRNA的调节第123-127页
  4.2 外泌体与增生性瘢痕细胞中lncRNA、circRNA的调节第127-130页
第3章 结论与展望第130-132页
  3.1 结论第130页
  3.2 进一步工作的方向第130-132页
致谢第132-133页
参考文献第133-141页
攻读学位期间的研究成果第141-142页
综述一 细胞自噬调控在创面修复中的作用研究进展第142-152页
参考文献第149-152页
综述二 ceRNA在皮肤病理性瘢痕中的研究进展第152-160页
参考文献第158-160页

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