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基于宏基因组测序的龋病儿童口腔微生态和功能基因分析

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基于宏基因组测序的龋病儿童口腔微生态和功能基因分析
论文目录
 
致谢第1-8页
中文摘要第8-10页
英文摘要第10-13页
缩写、符号及术语表第13-18页
绪论第18-22页
第一部分 龋病儿童口腔菌群结构多样性研究第22-61页
1 前言第22-24页
2 材料和方法第24-32页
  2.1 研究对象第24-27页
  2.2 口腔唾液样本采集第27页
  2.3 口腔唾液DNA抽提第27-28页
  2.4 高通量测序第28-29页
  2.5 数据处理第29-30页
  2.6 生物信息学分析第30-31页
  2.7 统计方法第31-32页
3 实验结果第32-56页
  3.1 纳入对象基本情况第32页
  3.2 唾液样本DNA抽提情况第32-34页
  3.3 原始测序序列统计第34-36页
  3.4 有效序列条数及与数据库比对情况第36-38页
  3.5 物种多样性分析第38-40页
  3.6 主成分分析第40-42页
  3.7 两组儿童不同分类学水平top物种分析第42-50页
  3.8 龋病组和口腔健康对照组口腔微生态差异物种分析第50-54页
  3.9 口腔细菌与龋病相关性分析第54-56页
4 讨论第56-60页
5 结论第60-61页
第二部分 龋病儿童口腔菌群功能基因多样性研究第61-91页
1 前言第61-63页
2 材料和方法第63-68页
  2.1 宏基因组测序第64页
  2.2 基因组组装第64页
  2.3 基因预测第64页
  2.4 基因集的构建第64页
  2.5 生物信息学分析第64-67页
  2.6 统计方法第67-68页
3 实验结果第68-86页
  3.1 有效序列以及基因组装结果第68-70页
  3.2 基因预测结果第70-72页
  3.3 基因集比较分析第72-75页
  3.4 差异基因比较分析第75页
  3.5 宏基因物种分析第75-76页
  3.6 KEGG数据库比对分析第76-82页
  3.7 eggNOG数据库比对分析第82-84页
  3.8 相关功能基因在龋病发病过程中的机制分析第84-86页
4 讨论第86-90页
5 结论第90-91页
全文总结第91-92页
参考文献第92-103页
综述(一)第103-118页
参考文献第111-118页
综述(二)第118-132页
参考文献第127-132页
病例报告 纳米复合树脂直接粘接修复技术在前牙美学修复中的应用第132-151页
前言第132-136页
病例1第136-138页
病例2第138-140页
病例3第140-142页
病例4第142-144页
病例5第144-146页
讨论第146-149页
参考文献第149-151页
附录 试剂耗材及仪器设备第151-152页
作者简介及在读期间取得的科研成果第152-153页

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