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胶质瘤调控机制的生物信息学探讨及舞茸多糖诱导胶质瘤细胞凋亡的研究

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胶质瘤调控机制的生物信息学探讨及舞茸多糖诱导胶质瘤细胞凋亡的研究
论文目录
 
中文摘要第1-5页
Abstract第5-8页
缩略词表第8-15页
第一部分 绪论第15-55页
  1.1 研究背景第15-37页
    1.1.1 胶质瘤概述第15-33页
    1.1.2 中药对胶质瘤作用研究进展第33-35页
    1.1.3 舞茸多糖第35-37页
  1.2 生物信息学分析在肿瘤研究中的进展第37-44页
    1.2.1 基因芯片第37-38页
    1.2.2 基因芯片的数据分析第38-40页
    1.2.3 TCGA数据库研究背景第40-41页
    1.2.4 KEGG生物通路数据第41-42页
    1.2.5 GO(Gene Ontology)数据库第42-44页
  1.3 研究目的第44页
  1.4 研究内容第44-45页
  1.5 研究方法第45-47页
    1.5.1 差异基因筛选以及GO通路分析第45页
    1.5.2 加权基因共表达网络分析(WGCNA)第45-46页
    1.5.3 体外实验方法第46-47页
  1.6 技术路线第47-48页
参考文献第48-55页
第二部分 胶质母细胞瘤差异基因筛选以及GO通路分析第55-74页
  2.1 前言第55-56页
  2.2 数据下载第56页
  2.3 差异基因筛选第56-57页
  2.4 结果第57-63页
  2.5 讨论第63-67页
  2.6 结论第67-68页
参考文献第68-74页
第三部分 胶质瘤转录组加权基因共表达网络分析(WGCNA)第74-101页
  3.1 WGCNA理论基础第74-78页
    3.1.1 WGCNA算法基础第74-75页
    3.1.2 基因共表达网络similarity的定义第75-76页
    3.1.3 Adjacency功能参数的定义第76-77页
    3.1.4 识别基因模块以及功能modules第77页
    3.1.5 基因距离(dissimilarity)衡量方法的定义第77-78页
  3.2 TCGA较低级别胶质瘤WGCNA网络构建第78-87页
    3.2.1 数据下载第78-79页
    3.2.2 数据处理第79-86页
    3.2.3 Cytoscape的基因网络分析第86-87页
  3.3 胶质瘤临床预后研究第87-92页
  3.4 讨论第92-95页
  3.5 结论第95-97页
参考文献第97-101页
第四部分 联合舞茸多糖和维生素C对人神经胶质瘤细胞M059K增殖的影响及联合用药抗肿瘤分子机制的探讨第101-134页
  4.1 研究材料第102-106页
    4.1.1 主要试剂与材料第102-103页
    4.1.2 主要仪器设备第103页
    4.1.3 主要试剂的配制第103-106页
  4.2 实验方法第106-118页
    4.2.1 神经胶质瘤M059K细胞的培养第106-107页
    4.2.2 MTT法检测MP与VC对M059K细胞增殖的影响第107-108页
    4.2.3 联合用药MTT检测第108-109页
    4.2.4 Annexin V-FITC/PI双染色法检测细胞凋亡率第109-110页
    4.2.5 流式细胞分析仪检测细胞周期第110页
    4.2.6 凋亡荧光染色后观察细胞第110-111页
    4.2.7 WB检测凋亡相关蛋白的表达第111-115页
    4.2.8 检测Caspase-3、-8、-9 活性第115-117页
    4.2.9 统计学分析第117页
    4.2.10 技术路线第117-118页
  4.3 结果第118-126页
    4.3.1 MTT法检测结果第118-119页
    4.3.2 联合用药MTT法确定最终用药浓度第119-121页
    4.3.3 药物处理后细胞凋亡率的测定第121-122页
    4.3.4 药物处理后细胞周期检测结果第122-123页
    4.3.5 Hoechst33258特异荧光染色观察凋亡细胞第123-124页
    4.3.6 凋亡相关蛋白表达第124-125页
    4.3.7 caspase活性检测第125-126页
  4.4 讨论第126-130页
  4.5 结论第130-131页
参考文献第131-134页
第五部分 结论第134-137页
  5.1 主要结论第134-135页
  5.2 特色与创新第135页
  5.3 局限性与不足第135-136页
  5.4 研究展望第136-137页
在学期间的研究成果第137-138页
致谢第138页

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